More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0903 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0903  peptidase M20D, amidohydrolase  100 
 
 		 409 aa  842    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1361  amidohydrolase  68.23 
 
 		 405 aa  586  1e-166  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1330  amidohydrolase  67.84 
 
 		 407 aa  579  1e-164  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1254  amidohydrolase  65.82 
 
 		 404 aa  543  1e-153  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.226068  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1020  peptidase M20D, amidohydrolase  62.88 
 
 		 407 aa  527  1e-148  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0205344 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1324  amidohydrolase  60.2 
 
 		 410 aa  507  9.999999999999999e-143  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1044  amidohydrolase  58.04 
 
 		 408 aa  474  1e-132  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210114  unclonable  0.00000194036 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7287  amidohydrolase  44.73 
 
 		 391 aa  353  4e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0545  amidohydrolase  45.34 
 
 		 400 aa  350  3e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.502241  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0273  amidohydrolase  42.89 
 
 		 395 aa  341  2e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0130  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  44.07 
 
 		 401 aa  336  3.9999999999999995e-91  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0750166  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1096  hypothetical protein  43.42 
 
 		 400 aa  331  1e-89  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081293 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4957  amidohydrolase  41.58 
 
 		 395 aa  328  1.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657786 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3841  amidohydrolase  40.77 
 
 		 397 aa  321  9.999999999999999e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0528  amidohydrolase  39.8 
 
 		 390 aa  303  5.000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2224  amidohydrolase  40.86 
 
 		 396 aa  293  4e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.355102  normal  0.809475 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0066  amidohydrolase  38.9 
 
 		 390 aa  290  4e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5569  amidohydrolase  41.75 
 
 		 401 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  40.92 
 
 		 425 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0259  amidohydrolase  41.78 
 
 		 435 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0605709 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  39.14 
 
 		 389 aa  283  3.0000000000000004e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0051  peptidase M20D, amidohydrolase  42.71 
 
 		 407 aa  281  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3175  amidohydrolase  37.34 
 
 		 394 aa  278  1e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0302  amidohydrolase  39.69 
 
 		 437 aa  277  3e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  40.15 
 
 		 390 aa  276  4e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  39.85 
 
 		 396 aa  276  5e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4012  amidohydrolase  40.84 
 
 		 392 aa  276  6e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873821 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  39.33 
 
 		 402 aa  276  6e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1729  peptidase M20D, amidohydrolase  41.62 
 
 		 390 aa  276  7e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0022862 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3743  carboxypeptidase  39.85 
 
 		 465 aa  275  8e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6019  amidohydrolase  39.69 
 
 		 389 aa  275  8e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0208  amidohydrolase  40.21 
 
 		 466 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.132335  normal  0.813004 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5222  hippurate hydrolase  39.65 
 
 		 398 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.22678 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  38.86 
 
 		 404 aa  275  1.0000000000000001e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2708  amidohydrolase  35.11 
 
 		 415 aa  275  2.0000000000000002e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  39.84 
 
 		 388 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4687  amidohydrolase  39.19 
 
 		 395 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  39.59 
 
 		 396 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3816  carboxypeptidase  39.85 
 
 		 465 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1059  peptidase M20D, amidohydrolase  37.6 
 
 		 392 aa  273  3e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996259  decreased coverage  0.0000027158 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2982  putative amidohydrolase family protein  41.15 
 
 		 389 aa  273  3e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  39.15 
 
 		 403 aa  273  3e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2379  amidohydrolase  39.43 
 
 		 402 aa  273  3e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4250  amidohydrolase  42.67 
 
 		 390 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.456638  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  39.79 
 
 		 398 aa  273  4.0000000000000004e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2671  peptidase M20D, amidohydrolase  40.93 
 
 		 394 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00976662  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3340  amidohydrolase  36.39 
 
 		 394 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5220  amidohydrolase  40.84 
 
 		 393 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1298  peptidase M20D, amidohydrolase  40.15 
 
 		 394 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  38.18 
 
 		 396 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  38.18 
 
 		 396 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  38.18 
 
 		 396 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  38.39 
 
 		 396 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  38.39 
 
 		 396 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  38.39 
 
 		 396 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  40.58 
 
 		 390 aa  271  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1245  hippurate hydolase  38.39 
 
 		 396 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689013  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  39.95 
 
 		 387 aa  271  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  39.07 
 
 		 387 aa  270  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4257  amidohydrolase  40 
 
 		 465 aa  270  4e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.15916 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  39.69 
 
 		 395 aa  270  5e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03984  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  39.49 
 
 		 438 aa  269  7e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4914  putative hydrolase  39.9 
 
 		 405 aa  269  7e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4728  amidohydrolase  40.41 
 
 		 393 aa  269  7e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.848291 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  40.21 
 
 		 379 aa  269  8e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  39.07 
 
 		 396 aa  269  8e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0444  amidohydrolase  38.64 
 
 		 401 aa  268  8.999999999999999e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186163  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0206  amidohydrolase  40 
 
 		 471 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.196253  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0453  amidohydrolase  38.64 
 
 		 401 aa  268  1e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  39.95 
 
 		 399 aa  268  1e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2611  amidohydrolase  40.46 
 
 		 391 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  38.18 
 
 		 396 aa  268  1e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4131  amidohydrolase  39.9 
 
 		 471 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  39.84 
 
 		 387 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  39.23 
 
 		 406 aa  268  1e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  39.84 
 
 		 387 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  39.02 
 
 		 397 aa  268  1e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  39.12 
 
 		 387 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1597  amidohydrolase  38.78 
 
 		 399 aa  268  2e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0486539 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  39.64 
 
 		 394 aa  267  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2791  amidohydrolase  36.8 
 
 		 390 aa  268  2e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  38.31 
 
 		 397 aa  268  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  39.9 
 
 		 394 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2753  amidohydrolase  41.05 
 
 		 391 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114457  normal  0.226959 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  39.9 
 
 		 394 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1225  amidohydrolase family protein  36.64 
 
 		 398 aa  268  2e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0413476  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  39.13 
 
 		 394 aa  268  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  39.9 
 
 		 394 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  37.98 
 
 		 403 aa  267  2.9999999999999995e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  40.85 
 
 		 387 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  40.46 
 
 		 389 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2091  amidohydrolase  37.91 
 
 		 395 aa  266  5e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000150957 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1734  peptidase M20D, amidohydrolase  41.42 
 
 		 389 aa  266  5e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.0172136 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1132  amidohydrolase  39.69 
 
 		 402 aa  266  5e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1248  amidohydrolase  38.6 
 
 		 425 aa  266  5.999999999999999e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.144528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0493  amidohydrolase  38.99 
 
 		 391 aa  266  7e-70  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.642244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  38.96 
 
 		 399 aa  265  8e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2714  amidohydrolase  37.35 
 
 		 449 aa  265  8.999999999999999e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1532  aminoacylase  37.01 
 
 		 389 aa  265  1e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  39.53 
 
 		 387 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>