More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_0206 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_0206  amidohydrolase  100 
 
 
471 aa  957    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.196253  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0259  amidohydrolase  75.63 
 
 
435 aa  684    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0605709 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0208  amidohydrolase  96.18 
 
 
466 aa  915    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.132335  normal  0.813004 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3487  peptidase M20D, amidohydrolase  82.22 
 
 
435 aa  691    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00054557  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3743  carboxypeptidase  87.97 
 
 
465 aa  831    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3816  carboxypeptidase  87.79 
 
 
465 aa  806    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0302  amidohydrolase  81.19 
 
 
437 aa  729    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4257  amidohydrolase  95.54 
 
 
465 aa  885    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.15916 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4131  amidohydrolase  97.66 
 
 
471 aa  915    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3941  carboxypeptidase  89.66 
 
 
470 aa  819    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3688  amidohydrolase  60.92 
 
 
439 aa  501  1e-140  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.395415  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03984  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  57.86 
 
 
438 aa  488  1e-137  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1258  peptidase M20D, amidohydrolase  59.01 
 
 
431 aa  462  1e-129  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.248557  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2714  amidohydrolase  51.68 
 
 
449 aa  456  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3266  amidohydrolase  53.33 
 
 
438 aa  434  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.309281 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0207  amidohydrolase  52.49 
 
 
480 aa  430  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1358  carboxypeptidase  53.09 
 
 
459 aa  428  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5885  amidohydrolase  49.39 
 
 
449 aa  395  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4303  amidohydrolase  49.54 
 
 
436 aa  393  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00571  Peptidase M20D, amidohydrolase  45.77 
 
 
432 aa  387  1e-106  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1306  amidohydrolase  48.89 
 
 
447 aa  387  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1417  amidohydrolase  46.14 
 
 
458 aa  372  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1501  amidohydrolase  43.32 
 
 
431 aa  322  8e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.190577  normal  0.0701308 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0130  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  39.51 
 
 
401 aa  302  9e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0750166  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1324  amidohydrolase  41.25 
 
 
410 aa  291  2e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0066  amidohydrolase  40.35 
 
 
390 aa  291  3e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2758  amidohydrolase  42.45 
 
 
393 aa  290  5.0000000000000004e-77  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00285471  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0613  amidohydrolase  40.84 
 
 
400 aa  286  5.999999999999999e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1020  peptidase M20D, amidohydrolase  41.27 
 
 
407 aa  286  8e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0205344 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0273  amidohydrolase  40.1 
 
 
395 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1254  amidohydrolase  40.36 
 
 
404 aa  283  6.000000000000001e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.226068  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0169  amidohydrolase  39.56 
 
 
411 aa  280  4e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.358542  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1597  amidohydrolase  40.64 
 
 
399 aa  279  1e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0486539 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3841  amidohydrolase  38.67 
 
 
397 aa  276  4e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0903  peptidase M20D, amidohydrolase  40 
 
 
409 aa  274  3e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0528  amidohydrolase  38.74 
 
 
390 aa  274  3e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0493  amidohydrolase  41.71 
 
 
391 aa  273  5.000000000000001e-72  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.642244  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1044  amidohydrolase  38.89 
 
 
408 aa  270  2.9999999999999997e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210114  unclonable  0.00000194036 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1764  amidohydrolase  40.49 
 
 
389 aa  270  2.9999999999999997e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1591  amidohydrolase  40 
 
 
389 aa  270  2.9999999999999997e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.653364 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0022  amidohydrolase  42.5 
 
 
380 aa  271  2.9999999999999997e-71  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1330  amidohydrolase  39.12 
 
 
407 aa  270  5e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2218  peptidase M20D, amidohydrolase  37.81 
 
 
405 aa  266  7e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7287  amidohydrolase  37.06 
 
 
391 aa  265  1e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0004  amidohydrolase  38.16 
 
 
399 aa  265  1e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.209653  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4369  amidohydrolase  36.98 
 
 
405 aa  265  2e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0256  peptidase M20D, amidohydrolase  38.17 
 
 
408 aa  264  2e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4957  amidohydrolase  37.71 
 
 
395 aa  265  2e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00657786 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1843  amidohydrolase  37.24 
 
 
405 aa  265  2e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3557  amidohydrolase  37.56 
 
 
405 aa  263  4.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0217903 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2073  amidohydrolase  38.46 
 
 
393 aa  263  6e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  38.77 
 
 
388 aa  262  8e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1415  amidohydrolase family protein  37.23 
 
 
398 aa  262  8e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486637  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1225  amidohydrolase family protein  37.32 
 
 
398 aa  262  8.999999999999999e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0413476  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  38.4 
 
 
388 aa  262  1e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36900  amidohydrolase  39.12 
 
 
410 aa  262  1e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0846344 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  38.42 
 
 
388 aa  261  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0023  amidohydrolase  39.3 
 
 
417 aa  261  2e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.69346  normal  0.453416 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1361  amidohydrolase  37.99 
 
 
405 aa  261  2e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4368  amidohydrolase  36.18 
 
 
403 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4430  amidohydrolase  36.18 
 
 
403 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0678  amidohydrolase  38.92 
 
 
394 aa  261  2e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.000000231632  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1096  hypothetical protein  37.63 
 
 
400 aa  259  5.0000000000000005e-68  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081293 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4353  amidohydrolase  43.16 
 
 
399 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.980853  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2708  amidohydrolase  36.59 
 
 
415 aa  259  9e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2667  peptidase M20D, amidohydrolase  37.47 
 
 
404 aa  259  1e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  38.06 
 
 
388 aa  256  4e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7215  hippurate hydrolase  40 
 
 
397 aa  256  6e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0728  amidohydrolase  41.05 
 
 
454 aa  256  6e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.0037974  hitchhiker  0.0000264187 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  37.72 
 
 
384 aa  256  8e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0982  amidohydrolase  36.67 
 
 
404 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  37.16 
 
 
389 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2314  peptidase M20D, amidohydrolase  38 
 
 
402 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.63249  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3623  amidohydrolase  38.37 
 
 
399 aa  254  3e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000412782  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  37.25 
 
 
387 aa  254  3e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  37.16 
 
 
387 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  37.16 
 
 
387 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  40.81 
 
 
403 aa  253  5.000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2348  peptidase M20D, amidohydrolase  38.86 
 
 
399 aa  253  5.000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1729  peptidase M20D, amidohydrolase  39.01 
 
 
390 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0022862 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  37.87 
 
 
387 aa  253  6e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  38.76 
 
 
379 aa  253  6e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3340  amidohydrolase  36.98 
 
 
394 aa  253  7e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  36.97 
 
 
387 aa  252  8.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3187  amidohydrolase  38.7 
 
 
388 aa  252  9.000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0033512 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2319  amidohydrolase  38.35 
 
 
386 aa  252  1e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00292059  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4224  amidohydrolase  35.63 
 
 
391 aa  251  2e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000104143  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  37 
 
 
402 aa  251  2e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0984  peptidase M20D, amidohydrolase  36.21 
 
 
397 aa  251  2e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0190  amidohydrolase family protein  37.16 
 
 
389 aa  251  3e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0261019  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  36.5 
 
 
387 aa  250  4e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1296  amidohydrolase  37.91 
 
 
392 aa  249  5e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.224852  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0545  amidohydrolase  37.85 
 
 
400 aa  249  7e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.502241  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2022  amidohydrolase  38.82 
 
 
396 aa  249  7e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3419  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  38.05 
 
 
381 aa  248  1e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000697071  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1012  amidohydrolase  36.93 
 
 
400 aa  249  1e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  36.23 
 
 
387 aa  249  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2778  amidohydrolase  37.1 
 
 
471 aa  249  1e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  36.05 
 
 
387 aa  249  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3681  thermostable carboxypeptidase 1  38.54 
 
 
381 aa  249  1e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>