More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1306 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1306  amidohydrolase  100 
 
 
447 aa  904    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5885  amidohydrolase  61.99 
 
 
449 aa  509  1e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1417  amidohydrolase  60.71 
 
 
458 aa  506  9.999999999999999e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1358  carboxypeptidase  53.73 
 
 
459 aa  450  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2714  amidohydrolase  49.1 
 
 
449 aa  420  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3743  carboxypeptidase  47.19 
 
 
465 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0208  amidohydrolase  48.31 
 
 
466 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.132335  normal  0.813004 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3816  carboxypeptidase  49.5 
 
 
465 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0207  amidohydrolase  49.75 
 
 
480 aa  395  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0259  amidohydrolase  46.68 
 
 
435 aa  397  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0605709 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4257  amidohydrolase  47.99 
 
 
465 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.15916 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1258  peptidase M20D, amidohydrolase  49 
 
 
431 aa  396  1e-109  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.248557  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3941  carboxypeptidase  47.1 
 
 
470 aa  395  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0206  amidohydrolase  46.76 
 
 
471 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.196253  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4303  amidohydrolase  50.34 
 
 
436 aa  393  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4131  amidohydrolase  46.53 
 
 
471 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0302  amidohydrolase  44.85 
 
 
437 aa  387  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03984  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  47.75 
 
 
438 aa  381  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3688  amidohydrolase  48.38 
 
 
439 aa  377  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.395415  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3266  amidohydrolase  46.23 
 
 
438 aa  376  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.309281 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3487  peptidase M20D, amidohydrolase  45.77 
 
 
435 aa  371  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00054557  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00571  Peptidase M20D, amidohydrolase  44.69 
 
 
432 aa  355  6.999999999999999e-97  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1501  amidohydrolase  49.37 
 
 
431 aa  352  5.9999999999999994e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.190577  normal  0.0701308 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4224  amidohydrolase  40.05 
 
 
391 aa  295  1e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000104143  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0493  amidohydrolase  41.85 
 
 
391 aa  294  2e-78  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.642244  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2758  amidohydrolase  39.81 
 
 
393 aa  289  6e-77  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00285471  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0066  amidohydrolase  40 
 
 
390 aa  286  5e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1597  amidohydrolase  40.8 
 
 
399 aa  285  1.0000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0486539 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0169  amidohydrolase  39.53 
 
 
411 aa  280  4e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.358542  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4430  amidohydrolase  36.67 
 
 
403 aa  279  7e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4368  amidohydrolase  36.67 
 
 
403 aa  279  7e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1843  amidohydrolase  38.15 
 
 
405 aa  279  7e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4369  amidohydrolase  36.71 
 
 
405 aa  278  2e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2218  peptidase M20D, amidohydrolase  38.63 
 
 
405 aa  276  4e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1431  amidohydrolase  40.79 
 
 
396 aa  276  5e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00950334  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0022  amidohydrolase  39.3 
 
 
380 aa  276  5e-73  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0130  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  37.81 
 
 
401 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0750166  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1012  amidohydrolase  40.24 
 
 
400 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1764  amidohydrolase  39.71 
 
 
389 aa  273  6e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2808  amidohydrolase  41.31 
 
 
385 aa  272  1e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3557  amidohydrolase  36.3 
 
 
405 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0217903 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0180  peptidase M20D, amidohydrolase  43.16 
 
 
393 aa  271  2e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  38.54 
 
 
388 aa  270  4e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2791  amidohydrolase  35.68 
 
 
390 aa  269  1e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4957  amidohydrolase  37.62 
 
 
395 aa  268  1e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00657786 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1591  amidohydrolase  41.19 
 
 
389 aa  268  1e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.653364 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  40.69 
 
 
389 aa  268  1e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2314  peptidase M20D, amidohydrolase  40.3 
 
 
402 aa  268  2e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.63249  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5519  amidohydrolase  37.59 
 
 
396 aa  268  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.5258  normal  0.111633 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1044  amidohydrolase  38.76 
 
 
408 aa  268  2e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210114  unclonable  0.00000194036 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6019  amidohydrolase  39.45 
 
 
389 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  39.55 
 
 
389 aa  267  2.9999999999999995e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5405  amidohydrolase  38.8 
 
 
396 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0004  amidohydrolase  39.15 
 
 
399 aa  266  8e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.209653  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  40.2 
 
 
390 aa  265  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0528  amidohydrolase  36.72 
 
 
390 aa  265  1e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2762  amidohydrolase  37.59 
 
 
395 aa  265  1e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.65096  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  41.62 
 
 
384 aa  265  1e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  38.96 
 
 
394 aa  264  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  40.94 
 
 
387 aa  264  3e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  38.96 
 
 
394 aa  264  3e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  38.96 
 
 
394 aa  264  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6364  amidohydrolase  36.76 
 
 
395 aa  263  3e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.557183  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2224  amidohydrolase  41.61 
 
 
396 aa  263  4.999999999999999e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.355102  normal  0.809475 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1298  peptidase M20D, amidohydrolase  38.96 
 
 
394 aa  263  6e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7287  amidohydrolase  36.18 
 
 
391 aa  263  6e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0982  amidohydrolase  39.05 
 
 
404 aa  262  8e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  39.7 
 
 
387 aa  261  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  39.7 
 
 
387 aa  262  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  39.7 
 
 
387 aa  262  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1096  hypothetical protein  37.44 
 
 
400 aa  260  3e-68  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081293 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2348  peptidase M20D, amidohydrolase  38.5 
 
 
399 aa  260  3e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  41.96 
 
 
388 aa  260  3e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6067  amidohydrolase  36.27 
 
 
395 aa  260  4e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  39.3 
 
 
388 aa  260  4e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2708  amidohydrolase  37.41 
 
 
415 aa  259  6e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4317  amidohydrolase  41.04 
 
 
385 aa  259  6e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0319433  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4686  amidohydrolase  41.04 
 
 
385 aa  259  6e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.694379  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  38.21 
 
 
394 aa  259  6e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5896  amidohydrolase  40.34 
 
 
395 aa  259  8e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0480348 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  39.2 
 
 
387 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2549  amidohydrolase  39.44 
 
 
389 aa  259  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.475258  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36900  amidohydrolase  38.19 
 
 
410 aa  258  1e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0846344 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3841  amidohydrolase  36.78 
 
 
397 aa  258  2e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3175  amidohydrolase  38.86 
 
 
394 aa  258  2e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0948  peptidase M20D, amidohydrolase  40.5 
 
 
395 aa  257  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0069  peptidase M20D, amidohydrolase  39.26 
 
 
384 aa  258  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.53846  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2073  amidohydrolase  35.75 
 
 
393 aa  258  2e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5220  amidohydrolase  39.21 
 
 
393 aa  258  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  38.69 
 
 
387 aa  257  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1741  amidohydrolase  40.68 
 
 
395 aa  257  3e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0634  amidohydrolase  35.48 
 
 
387 aa  257  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  37.72 
 
 
396 aa  257  3e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2022  amidohydrolase  40.58 
 
 
396 aa  257  3e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1324  amidohydrolase  37.5 
 
 
410 aa  257  4e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5217  peptidase M20D, amidohydrolase  39.8 
 
 
425 aa  256  5e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  38.65 
 
 
395 aa  256  5e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2524  amidohydrolase  40.2 
 
 
421 aa  256  5e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.661102  normal  0.871942 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  38.52 
 
 
394 aa  256  6e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  38.69 
 
 
387 aa  256  8e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>