More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6067 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5519  amidohydrolase  85.42 
 
 		 396 aa  702    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.5258  normal  0.111633 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6067  amidohydrolase  100 
 
 		 395 aa  810    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6670  amidohydrolase  94.4 
 
 		 395 aa  764    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6435  peptidase M20D, amidohydrolase  94.4 
 
 		 395 aa  764    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6268  amidohydrolase  94.4 
 
 		 395 aa  764    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.843577  normal  0.0558872 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6364  amidohydrolase  98.48 
 
 		 395 aa  800    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.557183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  53.3 
 
 		 404 aa  410  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  52.67 
 
 		 403 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0453  amidohydrolase  51.7 
 
 		 401 aa  398  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0444  amidohydrolase  51.44 
 
 		 401 aa  396  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186163  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1248  amidohydrolase  51.79 
 
 		 425 aa  395  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.144528  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0333  amidohydrolase  51.41 
 
 		 401 aa  389  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2476  amidohydrolase  51.85 
 
 		 398 aa  390  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.738512  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  50.77 
 
 		 397 aa  389  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  49.24 
 
 		 396 aa  390  1e-107  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  49.49 
 
 		 397 aa  385  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  50 
 
 		 396 aa  385  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  50 
 
 		 396 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  49.62 
 
 		 396 aa  384  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  50 
 
 		 389 aa  384  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2466  amidohydrolase  54.74 
 
 		 390 aa  383  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.293537  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  48.59 
 
 		 398 aa  382  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  48.99 
 
 		 398 aa  380  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  50.66 
 
 		 402 aa  380  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  49.24 
 
 		 423 aa  381  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  49.49 
 
 		 397 aa  375  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  48.61 
 
 		 397 aa  378  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5843  amidohydrolase  49.36 
 
 		 396 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4653  amidohydrolase  49.36 
 
 		 415 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0295739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  47.85 
 
 		 403 aa  370  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5651  amidohydrolase  49.36 
 
 		 396 aa  368  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.146235 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3715  peptidase M20D, amidohydrolase  49.36 
 
 		 415 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410848  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  50.27 
 
 		 395 aa  368  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2533  peptidase M20D, amidohydrolase  49.08 
 
 		 397 aa  365  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030908 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5626  amidohydrolase  48.84 
 
 		 399 aa  364  1e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.528848  normal  0.0552178 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1132  amidohydrolase  49.09 
 
 		 402 aa  363  2e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4896  amidohydrolase  50.27 
 
 		 396 aa  361  1e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.873901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  47.3 
 
 		 397 aa  360  2e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  48.17 
 
 		 390 aa  359  4e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  47.96 
 
 		 379 aa  358  9e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5374  amidohydrolase  50 
 
 		 399 aa  358  9e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2992  peptidase M20D, amidohydrolase  50 
 
 		 399 aa  358  9e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0252  peptidase M20D, amidohydrolase  49.73 
 
 		 396 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5250  amidohydrolase  49.73 
 
 		 396 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4721  amidohydrolase  49.73 
 
 		 396 aa  354  1e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  47.86 
 
 		 388 aa  352  4e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  46.63 
 
 		 399 aa  350  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4353  amidohydrolase  45.93 
 
 		 399 aa  351  2e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.980853  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  47.7 
 
 		 389 aa  350  2e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4012  amidohydrolase  47.14 
 
 		 392 aa  349  4e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873821 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2175  peptidase M20D, amidohydrolase  47.87 
 
 		 396 aa  349  5e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.20985 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  47.58 
 
 		 390 aa  348  1e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2598  peptidase M20D, amidohydrolase  50.26 
 
 		 396 aa  348  1e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.572475  normal  0.542589 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6019  amidohydrolase  48.66 
 
 		 389 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  46.51 
 
 		 387 aa  347  3e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5935  amidohydrolase  47.07 
 
 		 396 aa  346  4e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3769  amidohydrolase  48 
 
 		 396 aa  346  4e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  46.79 
 
 		 425 aa  343  2e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  45.16 
 
 		 387 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  45.97 
 
 		 387 aa  343  4e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  45.97 
 
 		 387 aa  343  4e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  46.63 
 
 		 387 aa  342  5e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4728  amidohydrolase  45.84 
 
 		 393 aa  342  7e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.848291 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  45.16 
 
 		 387 aa  342  9e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  51.09 
 
 		 384 aa  341  1e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2229  amidohydrolase  46.92 
 
 		 395 aa  341  1e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  47.45 
 
 		 406 aa  341  1e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  44.16 
 
 		 389 aa  340  2.9999999999999998e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  46.98 
 
 		 387 aa  340  4e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4586  putative amidohydrolase family protein  45.97 
 
 		 389 aa  339  5e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  45.97 
 
 		 387 aa  338  9e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1301  amidohydrolase  45.62 
 
 		 404 aa  336  5e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.855359 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4367  amidohydrolase  50.27 
 
 		 388 aa  336  5e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3314  amidohydrolase  47.62 
 
 		 390 aa  336  5e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2871  peptidase M20D, amidohydrolase  47.31 
 
 		 391 aa  335  7e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  47.03 
 
 		 388 aa  334  1e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5140  amidohydrolase  48.21 
 
 		 389 aa  334  1e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.778625 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4062  amidohydrolase  48.05 
 
 		 387 aa  334  1e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2671  peptidase M20D, amidohydrolase  47.19 
 
 		 394 aa  334  1e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00976662  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2379  amidohydrolase  45.38 
 
 		 402 aa  334  1e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  44.62 
 
 		 387 aa  333  2e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1729  peptidase M20D, amidohydrolase  48.23 
 
 		 390 aa  333  2e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0022862 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2262  peptidase M20D, amidohydrolase  48.06 
 
 		 389 aa  333  3e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.891111  normal  0.0931897 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  46.63 
 
 		 387 aa  333  3e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  46.46 
 
 		 387 aa  333  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  47.45 
 
 		 388 aa  333  4e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2573  amidohydrolase  48.8 
 
 		 387 aa  332  5e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0165265  normal  0.498174 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  45.31 
 
 		 399 aa  332  5e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5405  amidohydrolase  44.3 
 
 		 396 aa  330  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1813  peptidase M20D, amidohydrolase  48.43 
 
 		 388 aa  330  2e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.301487  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2932  peptidase M20D, amidohydrolase  47.58 
 
 		 382 aa  330  2e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.886758  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5220  amidohydrolase  45.65 
 
 		 393 aa  330  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4914  putative hydrolase  47.04 
 
 		 405 aa  330  2e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0719  peptidase M20D, amidohydrolase  46.56 
 
 		 387 aa  330  3e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.093275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2692  amidohydrolase  49.32 
 
 		 388 aa  330  3e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  44.62 
 
 		 394 aa  330  3e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6319  amidohydrolase  48.66 
 
 		 373 aa  330  3e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.834758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  44.65 
 
 		 412 aa  329  4e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5569  amidohydrolase  45.45 
 
 		 401 aa  330  4e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2919  amidohydrolase  49.04 
 
 		 388 aa  328  8e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.068301  normal  0.124085 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>