More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2022 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2022  amidohydrolase  100 
 
 
396 aa  792    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1741  amidohydrolase  92.64 
 
 
395 aa  738    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2224  amidohydrolase  69.04 
 
 
396 aa  553  1e-156  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.355102  normal  0.809475 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2791  amidohydrolase  40.61 
 
 
390 aa  303  3.0000000000000004e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0066  amidohydrolase  39.9 
 
 
390 aa  294  2e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0493  amidohydrolase  41.84 
 
 
391 aa  290  3e-77  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.642244  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0528  amidohydrolase  39.65 
 
 
390 aa  290  3e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2091  amidohydrolase  41.67 
 
 
395 aa  285  8e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000150957 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3175  amidohydrolase  43.3 
 
 
394 aa  285  8e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  42.86 
 
 
388 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3340  amidohydrolase  42.67 
 
 
394 aa  282  7.000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4687  amidohydrolase  40.98 
 
 
395 aa  279  5e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1491  amidohydrolase  41.18 
 
 
396 aa  279  6e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  43.91 
 
 
399 aa  278  1e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0022  amidohydrolase  42.75 
 
 
380 aa  277  3e-73  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3557  amidohydrolase  39.69 
 
 
405 aa  276  4e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0217903 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1764  amidohydrolase  42.01 
 
 
389 aa  275  7e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1597  amidohydrolase  42.09 
 
 
399 aa  275  8e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0486539 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  42.49 
 
 
388 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  40.74 
 
 
396 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3690  amidohydrolase  39.05 
 
 
400 aa  275  1.0000000000000001e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.824469 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17381  zinc metallopeptidase  41.47 
 
 
393 aa  274  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.467436  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4224  amidohydrolase  40.35 
 
 
391 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000104143  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  40.69 
 
 
396 aa  273  5.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0672  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  39.53 
 
 
391 aa  271  1e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  42.05 
 
 
412 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1059  peptidase M20D, amidohydrolase  40.36 
 
 
392 aa  271  1e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996259  decreased coverage  0.0000027158 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0706  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  39.53 
 
 
391 aa  271  1e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1178  amidohydrolase  40.41 
 
 
398 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1205  amidohydrolase  40.41 
 
 
398 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.811982  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0616  aminoacylase (N-acyl-L-amino acid amidohydrolase)  39.43 
 
 
391 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00306425  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2229  amidohydrolase  43.54 
 
 
395 aa  270  4e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0180  peptidase M20D, amidohydrolase  44.41 
 
 
393 aa  270  4e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1190  peptidase M20D, amidohydrolase  40.79 
 
 
394 aa  270  5e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0120  peptidase M20D, amidohydrolase  41.37 
 
 
393 aa  269  5.9999999999999995e-71  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000983179 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  45.01 
 
 
384 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2714  amidohydrolase  39.51 
 
 
449 aa  269  7e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0616  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase (aminoacylase)  39.27 
 
 
391 aa  268  1e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0834  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  39.27 
 
 
391 aa  268  1e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1225  amidohydrolase family protein  38.31 
 
 
398 aa  268  1e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0413476  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1012  amidohydrolase  43.4 
 
 
400 aa  268  1e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0775  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase, degenerate  39.01 
 
 
391 aa  268  2e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20651  zinc metallopeptidase  40.53 
 
 
394 aa  267  2e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7287  amidohydrolase  38.36 
 
 
391 aa  267  2e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4368  amidohydrolase  39.43 
 
 
403 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1415  amidohydrolase family protein  38.31 
 
 
398 aa  267  2.9999999999999995e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486637  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  45.13 
 
 
395 aa  266  4e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4430  amidohydrolase  39.43 
 
 
403 aa  266  4e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0621  amidohydrolase  38.9 
 
 
391 aa  266  5e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0545  amidohydrolase  41.44 
 
 
400 aa  265  1e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.502241  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0948  peptidase M20D, amidohydrolase  44.07 
 
 
395 aa  264  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0634  amidohydrolase  40 
 
 
387 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0004  amidohydrolase  40.4 
 
 
399 aa  263  3e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.209653  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3769  amidohydrolase  44.73 
 
 
396 aa  263  3e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2753  amidohydrolase  43.07 
 
 
391 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114457  normal  0.226959 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2611  amidohydrolase  43.33 
 
 
391 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  40.3 
 
 
396 aa  262  8e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0207  amidohydrolase  38.29 
 
 
480 aa  262  8e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5935  amidohydrolase  44.76 
 
 
396 aa  261  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2073  amidohydrolase  37.91 
 
 
393 aa  262  1e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1222  amidohydrolase  42.08 
 
 
393 aa  261  1e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115214  normal  0.142567 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  42.17 
 
 
388 aa  261  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5222  hippurate hydrolase  43.52 
 
 
398 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.22678 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0740  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  38.38 
 
 
391 aa  261  1e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0340749  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3872  hippurate hydrolase  40.4 
 
 
387 aa  260  2e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2379  amidohydrolase  40.55 
 
 
402 aa  261  2e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3681  thermostable carboxypeptidase 1  39.58 
 
 
381 aa  261  2e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0594  amidohydrolase  37.73 
 
 
391 aa  261  2e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0130  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  38.35 
 
 
401 aa  261  2e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0750166  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  40.86 
 
 
388 aa  259  4e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0760  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  39.53 
 
 
391 aa  259  4e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000492942 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0164  peptidase M20D, amidohydrolase  40.66 
 
 
392 aa  260  4e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  40.25 
 
 
397 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4597  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  37.86 
 
 
391 aa  258  1e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00088705  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5896  amidohydrolase  44.13 
 
 
395 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0480348 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  40.51 
 
 
389 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2758  amidohydrolase  38.26 
 
 
393 aa  258  2e-67  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00285471  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3419  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  37.97 
 
 
381 aa  258  2e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000697071  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1544  thermostable carboxypeptidase 1  38.87 
 
 
381 aa  258  2e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.192988  normal  0.0195635 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0256  peptidase M20D, amidohydrolase  40.05 
 
 
408 aa  258  2e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18021  zinc metallopeptidase  37.56 
 
 
386 aa  258  2e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0586  amidohydrolase  36.13 
 
 
391 aa  258  2e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  41.21 
 
 
390 aa  257  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2175  peptidase M20D, amidohydrolase  44.25 
 
 
396 aa  257  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.20985 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0572  amidohydrolase  36.13 
 
 
391 aa  258  2e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.176394  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2549  amidohydrolase  41.79 
 
 
389 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.475258  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3705  thermostable carboxypeptidase 1  39.43 
 
 
381 aa  256  4e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2319  amidohydrolase  39.64 
 
 
386 aa  256  4e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00292059  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2343  peptidase M20D, amidohydrolase  42.27 
 
 
386 aa  256  4e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0732987  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3771  thermostable carboxypeptidase 1  38.62 
 
 
381 aa  256  4e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.406616  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1096  hypothetical protein  37.53 
 
 
400 aa  256  5e-67  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081293 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1591  amidohydrolase  40.92 
 
 
389 aa  256  7e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.653364 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5374  amidohydrolase  45.17 
 
 
399 aa  255  9e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2992  peptidase M20D, amidohydrolase  45.17 
 
 
399 aa  255  9e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4896  amidohydrolase  45.17 
 
 
396 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.873901  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  39.14 
 
 
397 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1706  peptidase M20D, amidohydrolase  37.4 
 
 
394 aa  255  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1431  amidohydrolase  39.24 
 
 
396 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00950334  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6019  amidohydrolase  41.65 
 
 
389 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2218  peptidase M20D, amidohydrolase  38.62 
 
 
405 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>