More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0164 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0164  peptidase M20D, amidohydrolase  100 
 
 
392 aa  777    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0120  peptidase M20D, amidohydrolase  81.75 
 
 
393 aa  643    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000983179 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01951  Zinc metallopeptidase M20/M25/M40 family protein  71.47 
 
 
398 aa  548  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17381  zinc metallopeptidase  67.64 
 
 
393 aa  521  1e-147  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.467436  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20651  zinc metallopeptidase  61.3 
 
 
394 aa  501  1e-141  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1190  peptidase M20D, amidohydrolase  61.3 
 
 
394 aa  500  1e-140  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18021  zinc metallopeptidase  53.05 
 
 
386 aa  434  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1706  peptidase M20D, amidohydrolase  52.01 
 
 
394 aa  430  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18051  zinc metallopeptidase  51.74 
 
 
392 aa  429  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.309423  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18231  zinc metallopeptidase  50 
 
 
394 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.852941  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1059  peptidase M20D, amidohydrolase  53.58 
 
 
392 aa  399  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996259  decreased coverage  0.0000027158 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1205  amidohydrolase  53.03 
 
 
398 aa  398  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.811982  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1178  amidohydrolase  53.03 
 
 
398 aa  398  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1491  amidohydrolase  53.78 
 
 
396 aa  396  1e-109  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3690  amidohydrolase  52.57 
 
 
400 aa  389  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.824469 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2091  amidohydrolase  51.65 
 
 
395 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000150957 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4687  amidohydrolase  51.44 
 
 
395 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1971  peptidase M20D, amidohydrolase  63.2 
 
 
252 aa  282  7.000000000000001e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1843  amidohydrolase  40 
 
 
405 aa  279  5e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0528  amidohydrolase  37.11 
 
 
390 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4430  amidohydrolase  38.92 
 
 
403 aa  269  7e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4368  amidohydrolase  38.65 
 
 
403 aa  266  5.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3955  amidohydrolase  40.82 
 
 
412 aa  265  1e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393946  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0776  amidohydrolase  42.74 
 
 
391 aa  263  4.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4094  peptidase M20D, amidohydrolase  40.26 
 
 
392 aa  261  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.665516  normal  0.883146 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2218  peptidase M20D, amidohydrolase  38.06 
 
 
405 aa  260  3e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2022  amidohydrolase  40.66 
 
 
396 aa  260  4e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0256  peptidase M20D, amidohydrolase  40.16 
 
 
408 aa  259  8e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3542  amidohydrolase  45.33 
 
 
406 aa  258  1e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0576858  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  41.8 
 
 
395 aa  258  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  40.22 
 
 
403 aa  257  2e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3557  amidohydrolase  38.21 
 
 
405 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0217903 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2224  amidohydrolase  40.42 
 
 
396 aa  258  2e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.355102  normal  0.809475 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0675  amidohydrolase  39.41 
 
 
420 aa  256  3e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.925294  normal  0.238039 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3340  amidohydrolase  38.76 
 
 
394 aa  256  4e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0180  peptidase M20D, amidohydrolase  41.24 
 
 
393 aa  256  7e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1012  amidohydrolase  43.64 
 
 
400 aa  255  8e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1741  amidohydrolase  40.41 
 
 
395 aa  255  9e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0022  amidohydrolase  36.78 
 
 
380 aa  254  2.0000000000000002e-66  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2175  peptidase M20D, amidohydrolase  43.41 
 
 
396 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.20985 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3950  amidohydrolase  43.55 
 
 
415 aa  253  3e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00661247 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5935  amidohydrolase  42.86 
 
 
396 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3681  thermostable carboxypeptidase 1  36.91 
 
 
381 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  42.27 
 
 
389 aa  252  8.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1268  Aminoacylase  39.95 
 
 
412 aa  251  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3419  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  36.9 
 
 
381 aa  251  1e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000697071  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1431  amidohydrolase  41.51 
 
 
396 aa  250  2e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00950334  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3175  amidohydrolase  37.57 
 
 
394 aa  251  2e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4199  amidohydrolase  39.58 
 
 
440 aa  250  3e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3350  amidohydrolase  37.16 
 
 
388 aa  249  5e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028515  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2319  amidohydrolase  36.87 
 
 
386 aa  249  6e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00292059  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  39.34 
 
 
389 aa  249  6e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2708  amidohydrolase  37.01 
 
 
415 aa  249  6e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2791  amidohydrolase  36.87 
 
 
390 aa  249  6e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3705  thermostable carboxypeptidase 1  36.46 
 
 
381 aa  248  1e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0493  amidohydrolase  39.19 
 
 
391 aa  248  1e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.642244  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1597  amidohydrolase  40.26 
 
 
399 aa  247  2e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0486539 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2564  peptidase M20D, amidohydrolase  38.93 
 
 
410 aa  247  2e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1426  aminoacylase  35.75 
 
 
389 aa  248  2e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1532  aminoacylase  36.02 
 
 
389 aa  247  3e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0066  amidohydrolase  35.01 
 
 
390 aa  246  4e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3918  aminoacylase  36.29 
 
 
389 aa  246  4e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  40.11 
 
 
388 aa  246  4e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  40.58 
 
 
394 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1188  amidohydrolase  39.22 
 
 
387 aa  246  6e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1490  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  35.06 
 
 
389 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4433  amidohydrolase  40.58 
 
 
394 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1298  peptidase M20D, amidohydrolase  40.85 
 
 
394 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  40.58 
 
 
394 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  40.58 
 
 
394 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0130  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  38.42 
 
 
401 aa  245  9.999999999999999e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0750166  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  40.58 
 
 
394 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3698  M20/M25/M40 family peptidase  35.77 
 
 
381 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1096  hypothetical protein  37.73 
 
 
400 aa  244  1.9999999999999999e-63  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081293 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  37.89 
 
 
388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6019  amidohydrolase  41.07 
 
 
389 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2758  amidohydrolase  36.63 
 
 
393 aa  244  3e-63  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00285471  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5424  hippuricase  37.93 
 
 
388 aa  243  3e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1020  peptidase M20D, amidohydrolase  38.44 
 
 
407 aa  243  3e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0205344 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  41.26 
 
 
425 aa  243  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4353  amidohydrolase  39.29 
 
 
399 aa  243  3e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.980853  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  39.84 
 
 
412 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2992  peptidase M20D, amidohydrolase  42.86 
 
 
399 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3771  thermostable carboxypeptidase 1  35.92 
 
 
381 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.406616  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5250  amidohydrolase  42.86 
 
 
396 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5374  amidohydrolase  42.86 
 
 
399 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1790  amidohydrolase  40.73 
 
 
392 aa  243  5e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1417  amidohydrolase  41.95 
 
 
458 aa  243  5e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  41.01 
 
 
384 aa  243  5e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0678  amidohydrolase  40.83 
 
 
394 aa  243  5e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.000000231632  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  40.58 
 
 
394 aa  243  6e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  40.21 
 
 
396 aa  243  6e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  40.21 
 
 
396 aa  243  6e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  40.21 
 
 
396 aa  243  6e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  40.21 
 
 
396 aa  243  6e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  40.21 
 
 
396 aa  243  6e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1245  hippurate hydolase  40.21 
 
 
396 aa  243  6e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689013  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1544  thermostable carboxypeptidase 1  36.34 
 
 
381 aa  243  6e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.192988  normal  0.0195635 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  40.21 
 
 
396 aa  243  6e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1030  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  35.81 
 
 
379 aa  242  7e-63  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>