More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2175 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_5374  amidohydrolase  87.72 
 
 
399 aa  700    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4896  amidohydrolase  87.12 
 
 
396 aa  701    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.873901  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0252  peptidase M20D, amidohydrolase  85.86 
 
 
396 aa  695    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24772  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3769  amidohydrolase  83.84 
 
 
396 aa  686    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5935  amidohydrolase  96.72 
 
 
396 aa  775    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2175  peptidase M20D, amidohydrolase  100 
 
 
396 aa  813    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.20985 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  85.17 
 
 
395 aa  701    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2992  peptidase M20D, amidohydrolase  87.72 
 
 
399 aa  700    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5250  amidohydrolase  86.11 
 
 
396 aa  695    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4721  amidohydrolase  85.61 
 
 
396 aa  694    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1494  hippurate hydrolase  81.38 
 
 
395 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213987  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0378  amidohydrolase family protein  81.38 
 
 
395 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0794  hippurate hydrolase  81.38 
 
 
395 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2111  hippurate hydrolase  81.38 
 
 
395 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.216397  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1808  peptidase  81.12 
 
 
753 aa  609  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0476  amidohydrolase family protein  81.38 
 
 
395 aa  610  1e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.504077  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4728  amidohydrolase  64.36 
 
 
393 aa  518  1e-146  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.848291 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  63.14 
 
 
425 aa  512  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5569  amidohydrolase  61.6 
 
 
401 aa  498  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544377  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  60.57 
 
 
399 aa  491  9.999999999999999e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0051  peptidase M20D, amidohydrolase  62.66 
 
 
407 aa  489  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5222  hippurate hydrolase  62.02 
 
 
398 aa  488  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.22678 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5220  amidohydrolase  59.02 
 
 
393 aa  464  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5405  amidohydrolase  59.79 
 
 
396 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  59.26 
 
 
387 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  59.26 
 
 
387 aa  450  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  59.26 
 
 
387 aa  451  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  59.43 
 
 
390 aa  449  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  58.64 
 
 
387 aa  449  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  57.25 
 
 
396 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  58.47 
 
 
387 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  57.25 
 
 
396 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4012  amidohydrolase  58.1 
 
 
392 aa  446  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.873821 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1245  hippurate hydolase  57.25 
 
 
396 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689013  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2379  amidohydrolase  59.79 
 
 
402 aa  445  1.0000000000000001e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  58.2 
 
 
387 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  58.47 
 
 
387 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  57.25 
 
 
396 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  56.99 
 
 
396 aa  443  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  57.33 
 
 
390 aa  442  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  56.99 
 
 
396 aa  443  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  58.99 
 
 
387 aa  444  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  57.25 
 
 
396 aa  444  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  56.99 
 
 
396 aa  443  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  57.81 
 
 
389 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  57.33 
 
 
387 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  57.66 
 
 
406 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  56.66 
 
 
389 aa  436  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5133  amidohydrolase  58.78 
 
 
407 aa  432  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.519765  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  55.18 
 
 
394 aa  431  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  55.18 
 
 
394 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  55.7 
 
 
394 aa  429  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  56.15 
 
 
412 aa  429  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4914  putative hydrolase  57.4 
 
 
405 aa  428  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1298  peptidase M20D, amidohydrolase  55.18 
 
 
394 aa  430  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  55.18 
 
 
394 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4433  amidohydrolase  55.18 
 
 
394 aa  430  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  55.18 
 
 
394 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6019  amidohydrolase  58.33 
 
 
389 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  56.03 
 
 
379 aa  415  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5140  amidohydrolase  59.14 
 
 
389 aa  414  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.778625 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  55.12 
 
 
388 aa  414  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6319  amidohydrolase  58.87 
 
 
373 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.834758  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2611  amidohydrolase  57.07 
 
 
391 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2753  amidohydrolase  57.07 
 
 
391 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114457  normal  0.226959 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1291  peptidase M20D, amidohydrolase  57.85 
 
 
391 aa  409  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.214577  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2598  peptidase M20D, amidohydrolase  58.6 
 
 
396 aa  408  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.572475  normal  0.542589 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2549  amidohydrolase  57.33 
 
 
389 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.475258  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5424  hippuricase  55.15 
 
 
388 aa  409  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4353  amidohydrolase  55.38 
 
 
399 aa  400  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.980853  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1302  amidohydrolase  54.96 
 
 
409 aa  399  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.580399  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  51.91 
 
 
396 aa  391  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  51.14 
 
 
396 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  52.42 
 
 
399 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0143  amidohydrolase  50.9 
 
 
385 aa  386  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  49.87 
 
 
397 aa  386  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3289  peptidase M20D, amidohydrolase  53.95 
 
 
404 aa  385  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  51.14 
 
 
396 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  52.69 
 
 
403 aa  384  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2229  amidohydrolase  52.01 
 
 
395 aa  383  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  48.35 
 
 
398 aa  380  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  49.36 
 
 
397 aa  380  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4507  hippurate hydrolase  53.16 
 
 
403 aa  381  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0151662 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1410  amidohydrolase  53.95 
 
 
404 aa  378  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.044641  normal  0.934375 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1452  amidohydrolase  53.95 
 
 
404 aa  376  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.127453 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0333  amidohydrolase  47.59 
 
 
401 aa  373  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5843  amidohydrolase  49.87 
 
 
396 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575611  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  48.68 
 
 
397 aa  370  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3715  peptidase M20D, amidohydrolase  49.38 
 
 
415 aa  368  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410848  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5626  amidohydrolase  50 
 
 
399 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.528848  normal  0.0552178 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  47.49 
 
 
404 aa  369  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4653  amidohydrolase  49.38 
 
 
415 aa  368  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0295739  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4873  amidohydrolase  49.87 
 
 
389 aa  371  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.458115 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  47.34 
 
 
396 aa  367  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5651  amidohydrolase  49.87 
 
 
396 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.146235 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5812  peptidase M20D, amidohydrolase  55.5 
 
 
394 aa  365  1e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.586057  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2533  peptidase M20D, amidohydrolase  50.65 
 
 
397 aa  363  3e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0030908 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  48.68 
 
 
397 aa  363  4e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  51.34 
 
 
388 aa  362  9e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5896  amidohydrolase  53.35 
 
 
395 aa  361  1e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0480348 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>