More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2919 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  100 
 
 		 388 aa  786    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4367  amidohydrolase  65.72 
 
 		 388 aa  516  1.0000000000000001e-145  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1734  peptidase M20D, amidohydrolase  63.92 
 
 		 389 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.0172136 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3187  amidohydrolase  62.53 
 
 		 388 aa  482  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0033512 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4586  putative amidohydrolase family protein  59.13 
 
 		 389 aa  481  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  58.76 
 
 		 387 aa  478  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3584  amidohydrolase  60.47 
 
 		 390 aa  479  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0132191 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2692  amidohydrolase  60.98 
 
 		 388 aa  480  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  58.76 
 
 		 387 aa  478  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2919  amidohydrolase  60.47 
 
 		 388 aa  476  1e-133  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.068301  normal  0.124085 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3565  peptidase M20D, amidohydrolase  63.33 
 
 		 390 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2982  putative amidohydrolase family protein  62.37 
 
 		 389 aa  471  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1729  peptidase M20D, amidohydrolase  62.47 
 
 		 390 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0022862 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0245  amidohydrolase  62.27 
 
 		 388 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.352854  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2573  amidohydrolase  59.07 
 
 		 387 aa  461  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0165265  normal  0.498174 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2229  amidohydrolase  58.18 
 
 		 395 aa  462  1e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3872  hippurate hydrolase  58.55 
 
 		 387 aa  462  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2815  amidohydrolase  60.47 
 
 		 390 aa  463  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.575474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2671  peptidase M20D, amidohydrolase  60.81 
 
 		 394 aa  460  9.999999999999999e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00976662  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2262  peptidase M20D, amidohydrolase  61.34 
 
 		 389 aa  457  1e-127  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.891111  normal  0.0931897 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4250  amidohydrolase  59.13 
 
 		 390 aa  448  1e-125  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.456638  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2037  M20/M25/M40 family peptidase  57.51 
 
 		 387 aa  450  1e-125  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.403946  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3314  amidohydrolase  55.41 
 
 		 390 aa  450  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0901  amidohydrolase  58.03 
 
 		 387 aa  450  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1288  amidohydrolase  56.92 
 
 		 388 aa  445  1.0000000000000001e-124  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0866095  normal  0.389955 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3289  peptidase M20D, amidohydrolase  55.93 
 
 		 387 aa  445  1.0000000000000001e-124  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.286044 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4062  amidohydrolase  58.55 
 
 		 387 aa  447  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1959  M20/M25/M40 family peptidase  56.99 
 
 		 387 aa  446  1.0000000000000001e-124  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2260  putative amidohydrolase family protein  56.44 
 
 		 390 aa  443  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5364  putative amidohydrolase family protein  55.15 
 
 		 390 aa  437  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00388806 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0719  peptidase M20D, amidohydrolase  55.01 
 
 		 387 aa  434  1e-120  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.093275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3056  amidohydrolase  57.62 
 
 		 387 aa  429  1e-119  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0718  peptidase M20D, amidohydrolase  52.84 
 
 		 390 aa  421  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.178083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0610  amidohydrolase  56.3 
 
 		 389 aa  412  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00962709  normal  0.632979 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3086  peptidase M20D, amidohydrolase  56.19 
 
 		 389 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.985379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0687  amidohydrolase  54.33 
 
 		 408 aa  397  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.422759  normal  0.057643 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0665  amidohydrolase  54.07 
 
 		 408 aa  395  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  50.63 
 
 		 396 aa  392  1e-108  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  50.25 
 
 		 396 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  51.03 
 
 		 388 aa  389  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1090  amidohydrolase  51.04 
 
 		 424 aa  389  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0935  amidohydrolase  50.9 
 
 		 415 aa  388  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  49.5 
 
 		 397 aa  387  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  54.28 
 
 		 395 aa  385  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  50.25 
 
 		 396 aa  388  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  49.12 
 
 		 397 aa  385  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0937  peptidase M20D, amidohydrolase  49.87 
 
 		 387 aa  387  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.47047  normal  0.0807888 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  49.75 
 
 		 396 aa  382  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2910  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  49.23 
 
 		 388 aa  383  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1555  amidohydrolase  49.23 
 
 		 388 aa  383  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1813  peptidase M20D, amidohydrolase  54.84 
 
 		 388 aa  381  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.301487  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  53.12 
 
 		 388 aa  381  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5679  amidohydrolase  49.61 
 
 		 408 aa  375  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613587 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  50 
 
 		 412 aa  375  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0252  peptidase M20D, amidohydrolase  52.14 
 
 		 396 aa  376  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  53.3 
 
 		 388 aa  376  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  49.37 
 
 		 398 aa  377  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  50.78 
 
 		 389 aa  375  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4721  amidohydrolase  52.64 
 
 		 396 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4834  amidohydrolase  51.98 
 
 		 385 aa  374  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0546494  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  47.86 
 
 		 397 aa  373  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5250  amidohydrolase  52.39 
 
 		 396 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  52.49 
 
 		 387 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4896  amidohydrolase  52.14 
 
 		 396 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.873901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  50.26 
 
 		 394 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  51.7 
 
 		 394 aa  373  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5374  amidohydrolase  53.68 
 
 		 399 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3769  amidohydrolase  51.13 
 
 		 396 aa  373  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  51.28 
 
 		 387 aa  374  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  53.28 
 
 		 387 aa  372  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  49.62 
 
 		 404 aa  372  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  51.45 
 
 		 379 aa  374  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  52.49 
 
 		 387 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2992  peptidase M20D, amidohydrolase  53.68 
 
 		 399 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  50.26 
 
 		 394 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  50.26 
 
 		 394 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  51.84 
 
 		 387 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  48.36 
 
 		 398 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  49.34 
 
 		 406 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  51.55 
 
 		 396 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  49.87 
 
 		 389 aa  370  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1245  hippurate hydolase  51.55 
 
 		 396 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689013  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  52.23 
 
 		 387 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1298  peptidase M20D, amidohydrolase  50.52 
 
 		 394 aa  369  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  51.55 
 
 		 396 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  50.51 
 
 		 390 aa  369  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  51.55 
 
 		 396 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2343  peptidase M20D, amidohydrolase  49.61 
 
 		 386 aa  369  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0732987  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2379  amidohydrolase  52.22 
 
 		 402 aa  369  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  50.13 
 
 		 387 aa  368  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5222  hippurate hydrolase  51.94 
 
 		 398 aa  371  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.22678 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  51.32 
 
 		 387 aa  371  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  49.48 
 
 		 399 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  50.79 
 
 		 399 aa  366  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  49.24 
 
 		 403 aa  367  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  51.55 
 
 		 396 aa  368  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2871  peptidase M20D, amidohydrolase  51.94 
 
 		 391 aa  367  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  51.55 
 
 		 396 aa  367  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4317  amidohydrolase  52.48 
 
 		 385 aa  365  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0319433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4686  amidohydrolase  52.22 
 
 		 385 aa  365  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.694379  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>