More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1288 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1288  amidohydrolase  100 
 
 		 388 aa  796    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0866095  normal  0.389955 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0719  peptidase M20D, amidohydrolase  75.97 
 
 		 387 aa  613  9.999999999999999e-175  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.093275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3289  peptidase M20D, amidohydrolase  73.39 
 
 		 387 aa  594  1e-169  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.286044 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0718  peptidase M20D, amidohydrolase  61.99 
 
 		 390 aa  512  1e-144  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.178083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0610  amidohydrolase  67.7 
 
 		 389 aa  500  1e-140  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00962709  normal  0.632979 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4586  putative amidohydrolase family protein  59.38 
 
 		 389 aa  484  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  61.24 
 
 		 387 aa  484  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1734  peptidase M20D, amidohydrolase  61.08 
 
 		 389 aa  485  1e-136  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.0172136 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2671  peptidase M20D, amidohydrolase  61.07 
 
 		 394 aa  488  1e-136  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00976662  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  60.72 
 
 		 387 aa  484  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2262  peptidase M20D, amidohydrolase  60.57 
 
 		 389 aa  478  1e-134  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.891111  normal  0.0931897 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3565  peptidase M20D, amidohydrolase  60.41 
 
 		 390 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3187  amidohydrolase  62.98 
 
 		 388 aa  480  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0033512 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4250  amidohydrolase  60.93 
 
 		 390 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.456638  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2260  putative amidohydrolase family protein  59.9 
 
 		 390 aa  473  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2982  putative amidohydrolase family protein  60.31 
 
 		 389 aa  474  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1729  peptidase M20D, amidohydrolase  59.64 
 
 		 390 aa  471  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0022862 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2229  amidohydrolase  59.16 
 
 		 395 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2037  M20/M25/M40 family peptidase  59.54 
 
 		 387 aa  464  9.999999999999999e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.403946  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2919  amidohydrolase  61.95 
 
 		 388 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.068301  normal  0.124085 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1959  M20/M25/M40 family peptidase  59.02 
 
 		 387 aa  461  1e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3872  hippurate hydrolase  60.21 
 
 		 387 aa  463  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2692  amidohydrolase  61.7 
 
 		 388 aa  462  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3584  amidohydrolase  59.38 
 
 		 390 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0132191 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  56.92 
 
 		 388 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0901  amidohydrolase  58.76 
 
 		 387 aa  456  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0245  amidohydrolase  64.27 
 
 		 388 aa  457  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.352854  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2815  amidohydrolase  60.93 
 
 		 390 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.575474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5364  putative amidohydrolase family protein  58.61 
 
 		 390 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00388806 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3056  amidohydrolase  59.54 
 
 		 387 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2573  amidohydrolase  60.57 
 
 		 387 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0165265  normal  0.498174 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4062  amidohydrolase  59.69 
 
 		 387 aa  447  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3314  amidohydrolase  54.48 
 
 		 390 aa  429  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4367  amidohydrolase  53.85 
 
 		 388 aa  423  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2910  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  52.96 
 
 		 388 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3086  peptidase M20D, amidohydrolase  54.31 
 
 		 389 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.985379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1555  amidohydrolase  52.96 
 
 		 388 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1161  amidohydrolase  53.73 
 
 		 386 aa  400  9.999999999999999e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0937  peptidase M20D, amidohydrolase  51.03 
 
 		 387 aa  396  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.47047  normal  0.0807888 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2343  peptidase M20D, amidohydrolase  50.9 
 
 		 386 aa  390  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0732987  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  49.5 
 
 		 397 aa  383  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1090  amidohydrolase  50.26 
 
 		 424 aa  382  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1110  amidohydrolase  51.41 
 
 		 388 aa  381  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.247548  normal  0.0143187 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  50.13 
 
 		 396 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  52.85 
 
 		 388 aa  375  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  49.87 
 
 		 396 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  51.68 
 
 		 388 aa  377  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  51.14 
 
 		 395 aa  377  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  49.87 
 
 		 404 aa  372  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  46.6 
 
 		 396 aa  373  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  49.48 
 
 		 396 aa  370  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  50.39 
 
 		 403 aa  371  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  48.84 
 
 		 397 aa  369  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0252  peptidase M20D, amidohydrolase  50.38 
 
 		 396 aa  368  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5374  amidohydrolase  51.76 
 
 		 399 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1301  amidohydrolase  47.95 
 
 		 404 aa  366  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.855359 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4896  amidohydrolase  50.13 
 
 		 396 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.873901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2992  peptidase M20D, amidohydrolase  51.76 
 
 		 399 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  48.7 
 
 		 398 aa  365  1e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  48.69 
 
 		 379 aa  364  1e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5260  putative amidohydrolase family protein  48.97 
 
 		 387 aa  363  3e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0497165  normal  0.313624 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  49.74 
 
 		 389 aa  362  5.0000000000000005e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4721  amidohydrolase  50.13 
 
 		 396 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5250  amidohydrolase  51.76 
 
 		 396 aa  362  6e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0935  amidohydrolase  46.02 
 
 		 415 aa  362  6e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  49.61 
 
 		 406 aa  362  8e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  48.19 
 
 		 403 aa  361  9e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0687  amidohydrolase  47.29 
 
 		 408 aa  359  4e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.422759  normal  0.057643 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0665  amidohydrolase  47.29 
 
 		 408 aa  359  5e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  47.95 
 
 		 388 aa  358  7e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  48.19 
 
 		 399 aa  358  9e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1248  amidohydrolase  47.36 
 
 		 425 aa  357  9.999999999999999e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.144528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1813  peptidase M20D, amidohydrolase  47.93 
 
 		 388 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.301487  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0444  amidohydrolase  47.64 
 
 		 401 aa  357  9.999999999999999e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186163  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  48.46 
 
 		 396 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  48.46 
 
 		 396 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  48.46 
 
 		 396 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  48.46 
 
 		 396 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  48.46 
 
 		 396 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  48.46 
 
 		 396 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  47.84 
 
 		 402 aa  357  1.9999999999999998e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2871  peptidase M20D, amidohydrolase  49.87 
 
 		 391 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  48.46 
 
 		 396 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4834  amidohydrolase  51.05 
 
 		 385 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0546494  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3769  amidohydrolase  51.49 
 
 		 396 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1245  hippurate hydolase  48.46 
 
 		 396 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689013  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5935  amidohydrolase  50 
 
 		 396 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  45.62 
 
 		 412 aa  356  3.9999999999999996e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0453  amidohydrolase  47.38 
 
 		 401 aa  355  5e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2175  peptidase M20D, amidohydrolase  50.26 
 
 		 396 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.20985 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4317  amidohydrolase  51.81 
 
 		 385 aa  353  2e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0319433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2323  amidohydrolase  53.14 
 
 		 386 aa  353  2e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.462875 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1132  amidohydrolase  49.37 
 
 		 402 aa  353  2e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  48.44 
 
 		 387 aa  353  2e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4686  amidohydrolase  51.81 
 
 		 385 aa  353  2e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.694379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5220  amidohydrolase  49.24 
 
 		 393 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  47.4 
 
 		 397 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  48.18 
 
 		 387 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  47.69 
 
 		 394 aa  352  7e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  47.83 
 
 		 387 aa  351  1e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>