More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0719 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3289  peptidase M20D, amidohydrolase  81.4 
 
 		 387 aa  650    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.286044 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0719  peptidase M20D, amidohydrolase  100 
 
 		 387 aa  801    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.093275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1288  amidohydrolase  75.97 
 
 		 388 aa  612  9.999999999999999e-175  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0866095  normal  0.389955 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0718  peptidase M20D, amidohydrolase  63.14 
 
 		 390 aa  522  1e-147  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.178083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0610  amidohydrolase  66.84 
 
 		 389 aa  511  1e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00962709  normal  0.632979 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1734  peptidase M20D, amidohydrolase  59.49 
 
 		 389 aa  478  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.0172136 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  58.14 
 
 		 387 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3565  peptidase M20D, amidohydrolase  58.31 
 
 		 390 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  58.4 
 
 		 387 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2982  putative amidohydrolase family protein  58.21 
 
 		 389 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2260  putative amidohydrolase family protein  57.95 
 
 		 390 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1729  peptidase M20D, amidohydrolase  58.31 
 
 		 390 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0022862 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2229  amidohydrolase  56.89 
 
 		 395 aa  464  1e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4586  putative amidohydrolase family protein  57.22 
 
 		 389 aa  463  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2671  peptidase M20D, amidohydrolase  57.72 
 
 		 394 aa  462  1e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00976662  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5364  putative amidohydrolase family protein  59.49 
 
 		 390 aa  460  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00388806 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2262  peptidase M20D, amidohydrolase  57.95 
 
 		 389 aa  459  9.999999999999999e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.891111  normal  0.0931897 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3187  amidohydrolase  59.13 
 
 		 388 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0033512 
 
 
-
 
NC_004310  BR2037  M20/M25/M40 family peptidase  57.69 
 
 		 387 aa  457  1e-127  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.403946  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4250  amidohydrolase  56.78 
 
 		 390 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.456638  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4062  amidohydrolase  59.28 
 
 		 387 aa  452  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1959  M20/M25/M40 family peptidase  57.18 
 
 		 387 aa  454  1.0000000000000001e-126  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2573  amidohydrolase  58.72 
 
 		 387 aa  450  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0165265  normal  0.498174 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0901  amidohydrolase  56.92 
 
 		 387 aa  450  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  55.01 
 
 		 388 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3872  hippurate hydrolase  56.41 
 
 		 387 aa  442  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2692  amidohydrolase  55.9 
 
 		 388 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2919  amidohydrolase  55.9 
 
 		 388 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.068301  normal  0.124085 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3314  amidohydrolase  54.43 
 
 		 390 aa  441  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0245  amidohydrolase  59.74 
 
 		 388 aa  437  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.352854  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2815  amidohydrolase  55.9 
 
 		 390 aa  428  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.575474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3056  amidohydrolase  56.04 
 
 		 387 aa  425  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4367  amidohydrolase  52.58 
 
 		 388 aa  426  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3584  amidohydrolase  54.76 
 
 		 390 aa  424  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0132191 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3086  peptidase M20D, amidohydrolase  52.19 
 
 		 389 aa  388  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.985379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0937  peptidase M20D, amidohydrolase  49.36 
 
 		 387 aa  385  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.47047  normal  0.0807888 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2910  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  49.74 
 
 		 388 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1555  amidohydrolase  49.74 
 
 		 388 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1161  amidohydrolase  50.52 
 
 		 386 aa  379  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2343  peptidase M20D, amidohydrolase  49.1 
 
 		 386 aa  375  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0732987  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  48.58 
 
 		 396 aa  366  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  48.84 
 
 		 396 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0665  amidohydrolase  47.8 
 
 		 408 aa  365  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0687  amidohydrolase  47.8 
 
 		 408 aa  365  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.422759  normal  0.057643 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0935  amidohydrolase  45.62 
 
 		 415 aa  365  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  49.61 
 
 		 388 aa  360  2e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3769  amidohydrolase  51.09 
 
 		 396 aa  360  3e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1301  amidohydrolase  45.88 
 
 		 404 aa  358  7e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.855359 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  49.11 
 
 		 395 aa  358  7e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  45.64 
 
 		 397 aa  355  6.999999999999999e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  49.36 
 
 		 388 aa  355  6.999999999999999e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4896  amidohydrolase  48.24 
 
 		 396 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.873901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  44.84 
 
 		 396 aa  355  8.999999999999999e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1090  amidohydrolase  45.99 
 
 		 424 aa  355  1e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  48.16 
 
 		 388 aa  353  2e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0252  peptidase M20D, amidohydrolase  47.87 
 
 		 396 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5374  amidohydrolase  50.14 
 
 		 399 aa  352  5e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2992  peptidase M20D, amidohydrolase  50.14 
 
 		 399 aa  352  5e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1110  amidohydrolase  47.16 
 
 		 388 aa  352  5.9999999999999994e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.247548  normal  0.0143187 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  48.6 
 
 		 396 aa  352  7e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  49.36 
 
 		 394 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5250  amidohydrolase  48.37 
 
 		 396 aa  350  3e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  47.11 
 
 		 379 aa  350  3e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4721  amidohydrolase  47.99 
 
 		 396 aa  350  3e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  48.03 
 
 		 387 aa  349  5e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1298  peptidase M20D, amidohydrolase  47.97 
 
 		 394 aa  348  7e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  47.89 
 
 		 387 aa  348  7e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  46.41 
 
 		 396 aa  348  8e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  47.72 
 
 		 394 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5220  amidohydrolase  46.72 
 
 		 393 aa  348  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  46.23 
 
 		 404 aa  348  1e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  47.24 
 
 		 398 aa  348  1e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  47.89 
 
 		 387 aa  348  1e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  47.72 
 
 		 394 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  47.72 
 
 		 394 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  48.09 
 
 		 396 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  48.09 
 
 		 396 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  48.09 
 
 		 396 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5260  putative amidohydrolase family protein  47.95 
 
 		 387 aa  347  3e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0497165  normal  0.313624 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4433  amidohydrolase  47.72 
 
 		 394 aa  346  3e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  47.97 
 
 		 396 aa  346  4e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1245  hippurate hydolase  47.97 
 
 		 396 aa  346  4e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689013  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  47.97 
 
 		 396 aa  346  4e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  47.97 
 
 		 396 aa  346  4e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  47.77 
 
 		 387 aa  346  4e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  47.77 
 
 		 387 aa  346  4e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  47.51 
 
 		 387 aa  345  7e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5935  amidohydrolase  48.45 
 
 		 396 aa  344  1e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  45.62 
 
 		 387 aa  344  1e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  47.46 
 
 		 394 aa  344  2e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  45.99 
 
 		 403 aa  343  2e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  44.47 
 
 		 402 aa  343  2.9999999999999997e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6067  amidohydrolase  46.56 
 
 		 395 aa  343  4e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2175  peptidase M20D, amidohydrolase  48.7 
 
 		 396 aa  343  4e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.20985 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6670  amidohydrolase  46.51 
 
 		 395 aa  342  7e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6435  peptidase M20D, amidohydrolase  46.51 
 
 		 395 aa  342  7e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6268  amidohydrolase  46.51 
 
 		 395 aa  342  9e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.843577  normal  0.0558872 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  45.88 
 
 		 387 aa  341  1e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  48.03 
 
 		 387 aa  341  2e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6364  amidohydrolase  47.04 
 
 		 395 aa  340  2e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.557183  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>