More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4367 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_4367  amidohydrolase  100 
 
 
388 aa  774    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  65.72 
 
 
388 aa  521  1e-146  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2919  amidohydrolase  62.53 
 
 
388 aa  473  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.068301  normal  0.124085 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2260  putative amidohydrolase family protein  60.31 
 
 
390 aa  474  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2692  amidohydrolase  62.27 
 
 
388 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3187  amidohydrolase  60.72 
 
 
388 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0033512 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1734  peptidase M20D, amidohydrolase  61.34 
 
 
389 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.0172136 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1729  peptidase M20D, amidohydrolase  62.47 
 
 
390 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0022862 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2815  amidohydrolase  61.76 
 
 
390 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.575474  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2037  M20/M25/M40 family peptidase  58.96 
 
 
387 aa  452  1.0000000000000001e-126  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.403946  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0901  amidohydrolase  58.44 
 
 
387 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3565  peptidase M20D, amidohydrolase  60.93 
 
 
390 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5364  putative amidohydrolase family protein  59.02 
 
 
390 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00388806 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2229  amidohydrolase  58.42 
 
 
395 aa  449  1e-125  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2671  peptidase M20D, amidohydrolase  59.29 
 
 
394 aa  449  1e-125  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00976662  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  55.3 
 
 
387 aa  448  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1959  M20/M25/M40 family peptidase  58.44 
 
 
387 aa  449  1e-125  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4586  putative amidohydrolase family protein  56.19 
 
 
389 aa  450  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  55.04 
 
 
387 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2262  peptidase M20D, amidohydrolase  59.28 
 
 
389 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.891111  normal  0.0931897 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4250  amidohydrolase  60.41 
 
 
390 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.456638  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3584  amidohydrolase  58.1 
 
 
390 aa  442  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0132191 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2982  putative amidohydrolase family protein  58.25 
 
 
389 aa  444  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0245  amidohydrolase  60.98 
 
 
388 aa  444  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.352854  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3872  hippurate hydrolase  55.58 
 
 
387 aa  439  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2573  amidohydrolase  56.88 
 
 
387 aa  437  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0165265  normal  0.498174 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0718  peptidase M20D, amidohydrolase  55.13 
 
 
390 aa  429  1e-119  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.178083  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3314  amidohydrolase  55.27 
 
 
390 aa  431  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3289  peptidase M20D, amidohydrolase  54.76 
 
 
387 aa  426  1e-118  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.286044 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1288  amidohydrolase  53.85 
 
 
388 aa  422  1e-117  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0866095  normal  0.389955 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0719  peptidase M20D, amidohydrolase  52.58 
 
 
387 aa  423  1e-117  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.093275  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4062  amidohydrolase  54.03 
 
 
387 aa  422  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0610  amidohydrolase  57.84 
 
 
389 aa  419  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00962709  normal  0.632979 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3056  amidohydrolase  56.22 
 
 
387 aa  418  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2910  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  51.94 
 
 
388 aa  409  1e-113  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1555  amidohydrolase  51.94 
 
 
388 aa  409  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435924  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1813  peptidase M20D, amidohydrolase  56.49 
 
 
388 aa  394  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.301487  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3086  peptidase M20D, amidohydrolase  55.67 
 
 
389 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.985379  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  52.74 
 
 
397 aa  391  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  52.08 
 
 
397 aa  387  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  50.26 
 
 
396 aa  386  1e-106  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  52.48 
 
 
396 aa  382  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  53.12 
 
 
399 aa  385  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1161  amidohydrolase  50.52 
 
 
386 aa  381  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  50.77 
 
 
396 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0937  peptidase M20D, amidohydrolase  48.05 
 
 
387 aa  383  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.47047  normal  0.0807888 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  54.05 
 
 
388 aa  384  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  50.9 
 
 
396 aa  383  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  54.16 
 
 
395 aa  377  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0665  amidohydrolase  52.58 
 
 
408 aa  375  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2379  amidohydrolase  53.7 
 
 
402 aa  377  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0935  amidohydrolase  50.39 
 
 
415 aa  372  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0687  amidohydrolase  52.58 
 
 
408 aa  374  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.422759  normal  0.057643 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  49.62 
 
 
398 aa  373  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  50 
 
 
404 aa  371  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1110  amidohydrolase  50.9 
 
 
388 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.247548  normal  0.0143187 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1248  amidohydrolase  51.02 
 
 
425 aa  370  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.144528  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  50.53 
 
 
379 aa  368  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  50.25 
 
 
403 aa  368  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4721  amidohydrolase  54.37 
 
 
396 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  50.93 
 
 
389 aa  365  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6019  amidohydrolase  53.87 
 
 
389 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4896  amidohydrolase  53.83 
 
 
396 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.873901  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  49.35 
 
 
388 aa  366  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5374  amidohydrolase  53.55 
 
 
399 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4914  putative hydrolase  51.4 
 
 
405 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  49.49 
 
 
397 aa  365  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3769  amidohydrolase  51.78 
 
 
396 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  53.3 
 
 
388 aa  367  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2992  peptidase M20D, amidohydrolase  53.55 
 
 
399 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5250  amidohydrolase  54.1 
 
 
396 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  52.76 
 
 
389 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  50.77 
 
 
406 aa  366  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1301  amidohydrolase  49.87 
 
 
404 aa  364  1e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.855359 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0252  peptidase M20D, amidohydrolase  53.28 
 
 
396 aa  364  1e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24772  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2533  peptidase M20D, amidohydrolase  50.52 
 
 
397 aa  365  1e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0030908 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  51.41 
 
 
390 aa  364  1e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  51.19 
 
 
399 aa  363  2e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  52.11 
 
 
384 aa  363  2e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1090  amidohydrolase  49.74 
 
 
424 aa  363  3e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  50.65 
 
 
387 aa  363  3e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  52.23 
 
 
387 aa  362  4e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  51.71 
 
 
390 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  50.39 
 
 
387 aa  361  1e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  49.22 
 
 
398 aa  361  1e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  50.66 
 
 
389 aa  361  1e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  51.59 
 
 
387 aa  360  2e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4834  amidohydrolase  52.12 
 
 
385 aa  360  2e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0546494  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5222  hippurate hydrolase  54.09 
 
 
398 aa  359  5e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.22678 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  51.68 
 
 
387 aa  358  7e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  51.85 
 
 
387 aa  358  8e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  51.85 
 
 
387 aa  358  8e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  50.52 
 
 
403 aa  358  9e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  52.07 
 
 
387 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2611  amidohydrolase  50.9 
 
 
391 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2343  peptidase M20D, amidohydrolase  47.79 
 
 
386 aa  358  9.999999999999999e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0732987  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2175  peptidase M20D, amidohydrolase  51.3 
 
 
396 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.20985 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5935  amidohydrolase  50.78 
 
 
396 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  48.44 
 
 
423 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  50.13 
 
 
387 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>