More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0610 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0610  amidohydrolase  100 
 
 		 389 aa  796    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00962709  normal  0.632979 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0719  peptidase M20D, amidohydrolase  66.84 
 
 		 387 aa  531  1e-149  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.093275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1288  amidohydrolase  67.7 
 
 		 388 aa  521  1e-147  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0866095  normal  0.389955 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0718  peptidase M20D, amidohydrolase  65.54 
 
 		 390 aa  520  1e-146  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.178083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3289  peptidase M20D, amidohydrolase  62.95 
 
 		 387 aa  496  1e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.286044 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2229  amidohydrolase  61.58 
 
 		 395 aa  479  1e-134  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5364  putative amidohydrolase family protein  63.24 
 
 		 390 aa  478  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00388806 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3187  amidohydrolase  64.69 
 
 		 388 aa  474  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0033512 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2260  putative amidohydrolase family protein  62.21 
 
 		 390 aa  472  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2919  amidohydrolase  61.6 
 
 		 388 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.068301  normal  0.124085 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2692  amidohydrolase  61.34 
 
 		 388 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4586  putative amidohydrolase family protein  58.61 
 
 		 389 aa  463  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2982  putative amidohydrolase family protein  60.52 
 
 		 389 aa  464  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1734  peptidase M20D, amidohydrolase  61.34 
 
 		 389 aa  464  1e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.0172136 
 
 
-
 
NC_004310  BR2037  M20/M25/M40 family peptidase  59.95 
 
 		 387 aa  458  9.999999999999999e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.403946  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2815  amidohydrolase  61.08 
 
 		 390 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.575474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3565  peptidase M20D, amidohydrolase  60.93 
 
 		 390 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1959  M20/M25/M40 family peptidase  59.43 
 
 		 387 aa  455  1e-127  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2262  peptidase M20D, amidohydrolase  59.28 
 
 		 389 aa  448  1e-125  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.891111  normal  0.0931897 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1729  peptidase M20D, amidohydrolase  58.61 
 
 		 390 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0022862 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2671  peptidase M20D, amidohydrolase  60.31 
 
 		 394 aa  451  1e-125  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00976662  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  56.33 
 
 		 387 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  56.85 
 
 		 387 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3872  hippurate hydrolase  59.38 
 
 		 387 aa  447  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0901  amidohydrolase  58.91 
 
 		 387 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  56.3 
 
 		 388 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0245  amidohydrolase  63.66 
 
 		 388 aa  444  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.352854  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4367  amidohydrolase  57.84 
 
 		 388 aa  444  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3584  amidohydrolase  57.47 
 
 		 390 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0132191 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2573  amidohydrolase  58.4 
 
 		 387 aa  437  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0165265  normal  0.498174 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4250  amidohydrolase  59.13 
 
 		 390 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.456638  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3314  amidohydrolase  56.81 
 
 		 390 aa  435  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4062  amidohydrolase  57.36 
 
 		 387 aa  431  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1090  amidohydrolase  52.06 
 
 		 424 aa  399  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0935  amidohydrolase  49.61 
 
 		 415 aa  393  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3086  peptidase M20D, amidohydrolase  54.1 
 
 		 389 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.985379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3056  amidohydrolase  55.41 
 
 		 387 aa  394  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0687  amidohydrolase  50.9 
 
 		 408 aa  387  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.422759  normal  0.057643 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2910  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  50.38 
 
 		 388 aa  386  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1555  amidohydrolase  50.38 
 
 		 388 aa  386  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0665  amidohydrolase  50.9 
 
 		 408 aa  388  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1301  amidohydrolase  49.74 
 
 		 404 aa  383  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.855359 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5679  amidohydrolase  48.33 
 
 		 408 aa  378  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613587 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0651  amidohydrolase  46.57 
 
 		 447 aa  371  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0326492  normal  0.115252 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0937  peptidase M20D, amidohydrolase  47.42 
 
 		 387 aa  369  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.47047  normal  0.0807888 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2343  peptidase M20D, amidohydrolase  48.97 
 
 		 386 aa  366  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0732987  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1161  amidohydrolase  48.84 
 
 		 386 aa  365  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  47.38 
 
 		 404 aa  362  9e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  47.4 
 
 		 398 aa  357  9.999999999999999e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  48.32 
 
 		 390 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1110  amidohydrolase  49.62 
 
 		 388 aa  356  2.9999999999999997e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.247548  normal  0.0143187 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2533  peptidase M20D, amidohydrolase  45.61 
 
 		 397 aa  357  2.9999999999999997e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030908 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  48.84 
 
 		 387 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  45.88 
 
 		 402 aa  356  3.9999999999999996e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  48.05 
 
 		 403 aa  356  3.9999999999999996e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  46.98 
 
 		 397 aa  352  8e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  49.49 
 
 		 396 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  47.16 
 
 		 387 aa  351  1e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0749  peptidase M20D, amidohydrolase  45.19 
 
 		 427 aa  350  3e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0878973  normal  0.8802 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1813  peptidase M20D, amidohydrolase  47.41 
 
 		 388 aa  349  6e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.301487  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  44.53 
 
 		 396 aa  349  6e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  48.72 
 
 		 394 aa  347  1e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  48.72 
 
 		 394 aa  347  1e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  48.01 
 
 		 406 aa  348  1e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  48.72 
 
 		 394 aa  347  1e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  46.95 
 
 		 403 aa  347  2e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5424  hippuricase  50 
 
 		 388 aa  347  2e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  46.35 
 
 		 396 aa  347  2e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  46.09 
 
 		 396 aa  347  3e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  48.16 
 
 		 387 aa  346  4e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  47.93 
 
 		 388 aa  346  4e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  48.72 
 
 		 396 aa  346  5e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  48.72 
 
 		 396 aa  346  5e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  48.72 
 
 		 396 aa  346  5e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1298  peptidase M20D, amidohydrolase  48.72 
 
 		 394 aa  346  5e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  48.46 
 
 		 394 aa  346  5e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  48.16 
 
 		 387 aa  345  7e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  48.72 
 
 		 396 aa  345  8e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  48.72 
 
 		 396 aa  345  8e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1245  hippurate hydolase  48.72 
 
 		 396 aa  345  8e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689013  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  48.72 
 
 		 396 aa  345  8e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4433  amidohydrolase  48.21 
 
 		 394 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  48.84 
 
 		 394 aa  345  1e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  48.68 
 
 		 399 aa  344  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  48.96 
 
 		 388 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  46.74 
 
 		 397 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  46.21 
 
 		 396 aa  343  4e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2549  amidohydrolase  47.72 
 
 		 389 aa  342  5e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.475258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0444  amidohydrolase  46.11 
 
 		 401 aa  342  5.999999999999999e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186163  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2611  amidohydrolase  46.21 
 
 		 391 aa  342  7e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  47.78 
 
 		 387 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  45.14 
 
 		 397 aa  341  1e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  47.78 
 
 		 387 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0453  amidohydrolase  45.84 
 
 		 401 aa  340  2e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  46.46 
 
 		 388 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1698  amidohydrolase  49.44 
 
 		 406 aa  340  4e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.31217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  48.3 
 
 		 387 aa  339  4e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  47.52 
 
 		 387 aa  339  5e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  45.18 
 
 		 397 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2379  amidohydrolase  48.18 
 
 		 402 aa  338  7e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>