More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0651 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0651  amidohydrolase  100 
 
 		 447 aa  919    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0326492  normal  0.115252 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0749  peptidase M20D, amidohydrolase  86.46 
 
 		 427 aa  756    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0878973  normal  0.8802 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0935  amidohydrolase  72 
 
 		 415 aa  628  1e-179  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0687  amidohydrolase  71.22 
 
 		 408 aa  609  1e-173  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.422759  normal  0.057643 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0665  amidohydrolase  71.22 
 
 		 408 aa  610  1e-173  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5679  amidohydrolase  71.63 
 
 		 408 aa  605  9.999999999999999e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613587 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1301  amidohydrolase  70.33 
 
 		 404 aa  600  1e-170  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.855359 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1090  amidohydrolase  69.38 
 
 		 424 aa  596  1e-169  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  49.27 
 
 		 397 aa  390  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  48.77 
 
 		 397 aa  387  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  47.56 
 
 		 402 aa  374  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  45.81 
 
 		 396 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  46.06 
 
 		 396 aa  373  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2229  amidohydrolase  46.1 
 
 		 395 aa  372  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  46.12 
 
 		 396 aa  366  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2692  amidohydrolase  48.65 
 
 		 388 aa  366  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2919  amidohydrolase  48.65 
 
 		 388 aa  367  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.068301  normal  0.124085 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  48.51 
 
 		 388 aa  367  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  48.72 
 
 		 403 aa  367  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2343  peptidase M20D, amidohydrolase  47.91 
 
 		 386 aa  364  1e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0732987  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  45.32 
 
 		 398 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3187  amidohydrolase  47.67 
 
 		 388 aa  361  1e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0033512 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  45.57 
 
 		 423 aa  362  1e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  46.87 
 
 		 397 aa  361  2e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0333  amidohydrolase  47.12 
 
 		 401 aa  360  2e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  46.72 
 
 		 398 aa  359  6e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  46.08 
 
 		 397 aa  358  9e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3584  amidohydrolase  48.16 
 
 		 390 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0132191 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  43.98 
 
 		 396 aa  358  9.999999999999999e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  46.32 
 
 		 388 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2533  peptidase M20D, amidohydrolase  45.59 
 
 		 397 aa  357  2.9999999999999997e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030908 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2260  putative amidohydrolase family protein  46.44 
 
 		 390 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3314  amidohydrolase  46.38 
 
 		 390 aa  356  3.9999999999999996e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2910  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  45.1 
 
 		 388 aa  356  5e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1555  amidohydrolase  45.1 
 
 		 388 aa  356  5e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2815  amidohydrolase  47.91 
 
 		 390 aa  355  5.999999999999999e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.575474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4834  amidohydrolase  49.63 
 
 		 385 aa  356  5.999999999999999e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0546494  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1729  peptidase M20D, amidohydrolase  47.04 
 
 		 390 aa  355  8.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0022862 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0937  peptidase M20D, amidohydrolase  45.7 
 
 		 387 aa  353  2e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.47047  normal  0.0807888 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  46.12 
 
 		 389 aa  353  2.9999999999999997e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0984  peptidase M20D, amidohydrolase  47.04 
 
 		 397 aa  351  1e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5260  putative amidohydrolase family protein  44.74 
 
 		 387 aa  351  1e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0497165  normal  0.313624 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  47.36 
 
 		 388 aa  351  1e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0245  amidohydrolase  48.16 
 
 		 388 aa  351  2e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.352854  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  45.14 
 
 		 397 aa  350  2e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  44.09 
 
 		 387 aa  350  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  45.86 
 
 		 404 aa  350  4e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1248  amidohydrolase  45.89 
 
 		 425 aa  350  4e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.144528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0444  amidohydrolase  46.39 
 
 		 401 aa  349  5e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186163  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4686  amidohydrolase  49.75 
 
 		 385 aa  349  5e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.694379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2871  peptidase M20D, amidohydrolase  47.16 
 
 		 391 aa  349  6e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2982  putative amidohydrolase family protein  44.83 
 
 		 389 aa  348  1e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0453  amidohydrolase  46.13 
 
 		 401 aa  347  2e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2611  amidohydrolase  45.95 
 
 		 391 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1161  amidohydrolase  46.08 
 
 		 386 aa  347  2e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  45.71 
 
 		 387 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  45.71 
 
 		 387 aa  346  4e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1813  peptidase M20D, amidohydrolase  45.27 
 
 		 388 aa  347  4e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.301487  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3715  peptidase M20D, amidohydrolase  45.89 
 
 		 415 aa  346  5e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410848  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2573  amidohydrolase  46.38 
 
 		 387 aa  346  5e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0165265  normal  0.498174 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4653  amidohydrolase  45.89 
 
 		 415 aa  346  5e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0295739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4317  amidohydrolase  49.5 
 
 		 385 aa  345  7e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0319433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5651  amidohydrolase  45.89 
 
 		 396 aa  345  7e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.146235 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1132  amidohydrolase  48.14 
 
 		 402 aa  345  1e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3565  peptidase M20D, amidohydrolase  44.83 
 
 		 390 aa  344  1e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5843  amidohydrolase  45.89 
 
 		 396 aa  345  1e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575611  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  43.35 
 
 		 387 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4250  amidohydrolase  46.55 
 
 		 390 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.456638  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4586  putative amidohydrolase family protein  43.6 
 
 		 389 aa  342  5.999999999999999e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0901  amidohydrolase  45.86 
 
 		 387 aa  342  5.999999999999999e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1734  peptidase M20D, amidohydrolase  44.83 
 
 		 389 aa  342  7e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.0172136 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  45.3 
 
 		 388 aa  342  7e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2753  amidohydrolase  46.37 
 
 		 391 aa  342  1e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114457  normal  0.226959 
 
 
-
 
NC_004310  BR2037  M20/M25/M40 family peptidase  45.16 
 
 		 387 aa  342  1e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.403946  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5626  amidohydrolase  45.64 
 
 		 399 aa  342  1e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.528848  normal  0.0552178 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2549  amidohydrolase  46.37 
 
 		 389 aa  341  2e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.475258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0610  amidohydrolase  46.57 
 
 		 389 aa  341  2e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00962709  normal  0.632979 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2671  peptidase M20D, amidohydrolase  43.84 
 
 		 394 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00976662  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1959  M20/M25/M40 family peptidase  44.91 
 
 		 387 aa  340  4e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3872  hippurate hydrolase  44.61 
 
 		 387 aa  339  5.9999999999999996e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2466  amidohydrolase  48.61 
 
 		 390 aa  338  9.999999999999999e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.293537  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  45.2 
 
 		 387 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4367  amidohydrolase  45.23 
 
 		 388 aa  338  1.9999999999999998e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1110  amidohydrolase  44.36 
 
 		 388 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.247548  normal  0.0143187 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  44.31 
 
 		 389 aa  336  5.999999999999999e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2262  peptidase M20D, amidohydrolase  43.1 
 
 		 389 aa  335  1e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.891111  normal  0.0931897 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3289  peptidase M20D, amidohydrolase  43.52 
 
 		 387 aa  335  1e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.286044 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  43.94 
 
 		 387 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  43.94 
 
 		 387 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  45.3 
 
 		 425 aa  333  4e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  43.69 
 
 		 387 aa  332  6e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2126  peptidase M20D, amidohydrolase  44.01 
 
 		 390 aa  332  7.000000000000001e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.587793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  43.07 
 
 		 406 aa  332  9e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3086  peptidase M20D, amidohydrolase  47.04 
 
 		 389 aa  332  1e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.985379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  43.86 
 
 		 390 aa  331  1e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5220  amidohydrolase  45.3 
 
 		 393 aa  332  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5569  amidohydrolase  45.66 
 
 		 401 aa  331  2e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4728  amidohydrolase  44.44 
 
 		 393 aa  331  2e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.848291 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  44.79 
 
 		 395 aa  330  3e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  44.44 
 
 		 387 aa  330  3e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>