More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5679 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0665  amidohydrolase  79.45 
 
 		 408 aa  660    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0935  amidohydrolase  79 
 
 		 415 aa  655    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1301  amidohydrolase  77.67 
 
 		 404 aa  641    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.855359 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5679  amidohydrolase  100 
 
 		 408 aa  833    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613587 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0687  amidohydrolase  79.7 
 
 		 408 aa  660    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.422759  normal  0.057643 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1090  amidohydrolase  74.19 
 
 		 424 aa  613  9.999999999999999e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0651  amidohydrolase  70.95 
 
 		 447 aa  598  1e-170  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0326492  normal  0.115252 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0749  peptidase M20D, amidohydrolase  70 
 
 		 427 aa  585  1e-166  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0878973  normal  0.8802 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2229  amidohydrolase  49.87 
 
 		 395 aa  393  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  49.87 
 
 		 397 aa  387  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  50.25 
 
 		 397 aa  384  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2919  amidohydrolase  51.55 
 
 		 388 aa  382  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.068301  normal  0.124085 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2692  amidohydrolase  51.29 
 
 		 388 aa  379  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3584  amidohydrolase  51.8 
 
 		 390 aa  380  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0132191 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  49.61 
 
 		 388 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2815  amidohydrolase  51.29 
 
 		 390 aa  374  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.575474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3187  amidohydrolase  53.02 
 
 		 388 aa  369  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0033512 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  47.37 
 
 		 396 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  47.37 
 
 		 396 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  50.39 
 
 		 388 aa  367  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  48.2 
 
 		 396 aa  364  1e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2343  peptidase M20D, amidohydrolase  49.74 
 
 		 386 aa  363  3e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0732987  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2533  peptidase M20D, amidohydrolase  46.45 
 
 		 397 aa  360  2e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030908 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0245  amidohydrolase  53.35 
 
 		 388 aa  360  2e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.352854  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0937  peptidase M20D, amidohydrolase  48.71 
 
 		 387 aa  360  4e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.47047  normal  0.0807888 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2260  putative amidohydrolase family protein  49.87 
 
 		 390 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4586  putative amidohydrolase family protein  47.29 
 
 		 389 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2932  peptidase M20D, amidohydrolase  49.22 
 
 		 382 aa  356  3.9999999999999996e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.886758  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  46.75 
 
 		 398 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1161  amidohydrolase  48.59 
 
 		 386 aa  354  1e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  46.75 
 
 		 423 aa  355  1e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5260  putative amidohydrolase family protein  46.13 
 
 		 387 aa  354  1e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0497165  normal  0.313624 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1813  peptidase M20D, amidohydrolase  50.52 
 
 		 388 aa  353  2e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.301487  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0610  amidohydrolase  48.33 
 
 		 389 aa  353  2.9999999999999997e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00962709  normal  0.632979 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  49.35 
 
 		 388 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1555  amidohydrolase  47.06 
 
 		 388 aa  352  5e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2910  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  47.06 
 
 		 388 aa  352  5e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  46.25 
 
 		 397 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  47.12 
 
 		 402 aa  352  5.9999999999999994e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  48.3 
 
 		 397 aa  352  8e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  48.06 
 
 		 404 aa  350  2e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  47.55 
 
 		 403 aa  350  3e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4367  amidohydrolase  48.33 
 
 		 388 aa  350  3e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4834  amidohydrolase  49.23 
 
 		 385 aa  350  3e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0546494  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3289  peptidase M20D, amidohydrolase  46.13 
 
 		 387 aa  349  4e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.286044 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3314  amidohydrolase  46.09 
 
 		 390 aa  349  4e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  46.84 
 
 		 389 aa  349  5e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  44.92 
 
 		 396 aa  349  5e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0333  amidohydrolase  47.93 
 
 		 401 aa  348  7e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  47.3 
 
 		 397 aa  347  2e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4686  amidohydrolase  50.39 
 
 		 385 aa  346  3e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.694379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0044  peptidase M20D, amidohydrolase  50.77 
 
 		 385 aa  345  1e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5364  putative amidohydrolase family protein  48.59 
 
 		 390 aa  344  1e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00388806 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0444  amidohydrolase  47.4 
 
 		 401 aa  343  2.9999999999999997e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186163  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  47.14 
 
 		 394 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  47.14 
 
 		 394 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  47.14 
 
 		 394 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0984  peptidase M20D, amidohydrolase  46.41 
 
 		 397 aa  342  5e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3086  peptidase M20D, amidohydrolase  49.1 
 
 		 389 aa  342  5e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.985379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4317  amidohydrolase  50.13 
 
 		 385 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0319433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  45.85 
 
 		 398 aa  342  8e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0453  amidohydrolase  47.14 
 
 		 401 aa  341  1e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4256  amidohydrolase  47.51 
 
 		 392 aa  341  2e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.545833 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  46.35 
 
 		 394 aa  340  2e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  48.31 
 
 		 406 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2871  peptidase M20D, amidohydrolase  48.45 
 
 		 391 aa  339  4e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1288  amidohydrolase  46.17 
 
 		 388 aa  339  5e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0866095  normal  0.389955 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  47.14 
 
 		 394 aa  338  7e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1248  amidohydrolase  47.26 
 
 		 425 aa  338  9.999999999999999e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.144528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4914  putative hydrolase  48.05 
 
 		 405 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1298  peptidase M20D, amidohydrolase  46.61 
 
 		 394 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4433  amidohydrolase  45.83 
 
 		 394 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2466  amidohydrolase  50.79 
 
 		 390 aa  336  5e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.293537  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1729  peptidase M20D, amidohydrolase  46.92 
 
 		 390 aa  335  5.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0022862 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  46.3 
 
 		 387 aa  335  7e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  46.3 
 
 		 387 aa  334  1e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  46.61 
 
 		 396 aa  335  1e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  44.7 
 
 		 387 aa  335  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  44.19 
 
 		 387 aa  335  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  46.61 
 
 		 396 aa  333  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  46.61 
 
 		 396 aa  333  2e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  46.61 
 
 		 396 aa  333  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  46.61 
 
 		 396 aa  333  2e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1245  hippurate hydolase  46.61 
 
 		 396 aa  333  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689013  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  46.61 
 
 		 396 aa  333  2e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  46.61 
 
 		 396 aa  333  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1110  amidohydrolase  47.06 
 
 		 388 aa  332  6e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.247548  normal  0.0143187 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3872  hippurate hydrolase  46.32 
 
 		 387 aa  330  3e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2323  amidohydrolase  47.79 
 
 		 386 aa  330  4e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.462875 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1734  peptidase M20D, amidohydrolase  47.04 
 
 		 389 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.0172136 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2549  amidohydrolase  47.63 
 
 		 389 aa  329  6e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.475258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  45.34 
 
 		 412 aa  328  7e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5651  amidohydrolase  46.19 
 
 		 396 aa  328  8e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.146235 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4653  amidohydrolase  46.19 
 
 		 415 aa  328  8e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0295739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0719  peptidase M20D, amidohydrolase  42.78 
 
 		 387 aa  328  8e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.093275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3715  peptidase M20D, amidohydrolase  46.19 
 
 		 415 aa  328  8e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410848  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2982  putative amidohydrolase family protein  45.24 
 
 		 389 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0901  amidohydrolase  45.79 
 
 		 387 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5220  amidohydrolase  46.72 
 
 		 393 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  45.77 
 
 		 387 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>