More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0071 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  100 
 
 		 389 aa  800    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  56.92 
 
 		 397 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  56.4 
 
 		 397 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  57.44 
 
 		 396 aa  448  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  57.07 
 
 		 396 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  56.81 
 
 		 396 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2466  amidohydrolase  61.38 
 
 		 390 aa  441  9.999999999999999e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.293537  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  53 
 
 		 398 aa  435  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  55.09 
 
 		 396 aa  434  1e-120  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  54.92 
 
 		 403 aa  432  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  53.37 
 
 		 404 aa  434  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1248  amidohydrolase  54.52 
 
 		 425 aa  431  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.144528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  52.09 
 
 		 398 aa  429  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  53.14 
 
 		 397 aa  427  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  52.48 
 
 		 397 aa  424  1e-118  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  52.62 
 
 		 423 aa  427  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0453  amidohydrolase  53.02 
 
 		 401 aa  422  1e-117  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2871  peptidase M20D, amidohydrolase  55.67 
 
 		 391 aa  423  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  53.12 
 
 		 397 aa  424  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0444  amidohydrolase  53.28 
 
 		 401 aa  424  1e-117  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186163  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  51.13 
 
 		 402 aa  420  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1132  amidohydrolase  56.22 
 
 		 402 aa  414  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0333  amidohydrolase  52.22 
 
 		 401 aa  412  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2533  peptidase M20D, amidohydrolase  52.73 
 
 		 397 aa  409  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030908 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5843  amidohydrolase  53.4 
 
 		 396 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4653  amidohydrolase  53.66 
 
 		 415 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0295739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0069  peptidase M20D, amidohydrolase  51.19 
 
 		 384 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.53846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5626  amidohydrolase  53.4 
 
 		 399 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.528848  normal  0.0552178 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3715  peptidase M20D, amidohydrolase  53.66 
 
 		 415 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410848  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5651  amidohydrolase  53.66 
 
 		 396 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.146235 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4834  amidohydrolase  54.13 
 
 		 385 aa  394  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0546494  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  50.93 
 
 		 394 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  52.82 
 
 		 388 aa  390  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  50.93 
 
 		 394 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  50.93 
 
 		 394 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  52.8 
 
 		 388 aa  387  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1298  peptidase M20D, amidohydrolase  50.93 
 
 		 394 aa  385  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4686  amidohydrolase  54.4 
 
 		 385 aa  385  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.694379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3565  peptidase M20D, amidohydrolase  52.89 
 
 		 390 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4317  amidohydrolase  54.4 
 
 		 385 aa  385  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0319433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  50.67 
 
 		 394 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4433  amidohydrolase  50.67 
 
 		 394 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6067  amidohydrolase  50 
 
 		 395 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4256  amidohydrolase  51.06 
 
 		 392 aa  382  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.545833 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2476  amidohydrolase  50.13 
 
 		 398 aa  382  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.738512  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  50.93 
 
 		 396 aa  384  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  49.73 
 
 		 390 aa  382  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5519  amidohydrolase  50.54 
 
 		 396 aa  382  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.5258  normal  0.111633 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  50.93 
 
 		 394 aa  384  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1245  hippurate hydolase  50.13 
 
 		 396 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689013  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  50.13 
 
 		 396 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  50.13 
 
 		 396 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  50.13 
 
 		 396 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  50.13 
 
 		 396 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3165  amidohydrolase  52.48 
 
 		 389 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  50.13 
 
 		 396 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1734  peptidase M20D, amidohydrolase  51.72 
 
 		 389 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.0172136 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4612  amidohydrolase  50.78 
 
 		 389 aa  379  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.194835  normal  0.384238 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  47.86 
 
 		 387 aa  378  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  49.73 
 
 		 387 aa  378  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  50.13 
 
 		 396 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2671  peptidase M20D, amidohydrolase  49.75 
 
 		 394 aa  378  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00976662  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6670  amidohydrolase  49.47 
 
 		 395 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4917  amidohydrolase family protein  50 
 
 		 376 aa  375  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.863248  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2919  amidohydrolase  50.9 
 
 		 388 aa  378  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.068301  normal  0.124085 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2692  amidohydrolase  50.64 
 
 		 388 aa  378  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  48.4 
 
 		 387 aa  377  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0665  amidohydrolase  50.66 
 
 		 408 aa  375  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  49.2 
 
 		 387 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5224  amidohydrolase  52.45 
 
 		 401 aa  376  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0687  amidohydrolase  50.66 
 
 		 408 aa  375  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.422759  normal  0.057643 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6435  peptidase M20D, amidohydrolase  49.47 
 
 		 395 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6364  amidohydrolase  49.2 
 
 		 395 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.557183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  47.59 
 
 		 387 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  48 
 
 		 412 aa  373  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  48.66 
 
 		 387 aa  372  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  50.27 
 
 		 388 aa  374  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0935  amidohydrolase  48.95 
 
 		 415 aa  374  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  47.86 
 
 		 387 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6268  amidohydrolase  49.47 
 
 		 395 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.843577  normal  0.0558872 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  47.59 
 
 		 387 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  47.59 
 
 		 387 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4250  amidohydrolase  53.16 
 
 		 390 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.456638  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4586  putative amidohydrolase family protein  51.09 
 
 		 389 aa  369  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3456  amidohydrolase  50.65 
 
 		 389 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.960361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  49.47 
 
 		 425 aa  369  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  49.87 
 
 		 388 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  47.48 
 
 		 403 aa  369  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  48.67 
 
 		 387 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2815  amidohydrolase  50.64 
 
 		 390 aa  367  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.575474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4914  putative hydrolase  50.8 
 
 		 405 aa  366  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5569  amidohydrolase  48.59 
 
 		 401 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3584  amidohydrolase  50 
 
 		 390 aa  367  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0132191 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  49.73 
 
 		 406 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1090  amidohydrolase  48.69 
 
 		 424 aa  364  1e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4728  amidohydrolase  47.88 
 
 		 393 aa  365  1e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.848291 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1729  peptidase M20D, amidohydrolase  50.26 
 
 		 390 aa  365  1e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0022862 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5260  putative amidohydrolase family protein  47.33 
 
 		 387 aa  364  1e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0497165  normal  0.313624 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2262  peptidase M20D, amidohydrolase  48.35 
 
 		 389 aa  363  2e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.891111  normal  0.0931897 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2179  amidohydrolase  51.41 
 
 		 393 aa  364  2e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.833898  normal  0.575344 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>