More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0044 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0044  peptidase M20D, amidohydrolase  100 
 
 		 385 aa  778    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2179  amidohydrolase  74.41 
 
 		 393 aa  531  1e-150  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.833898  normal  0.575344 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2932  peptidase M20D, amidohydrolase  59.89 
 
 		 382 aa  443  1e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.886758  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  48.82 
 
 		 397 aa  375  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  49.08 
 
 		 397 aa  373  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  49.07 
 
 		 389 aa  370  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  52.21 
 
 		 384 aa  370  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0333  amidohydrolase  48.18 
 
 		 401 aa  363  2e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  50.53 
 
 		 388 aa  364  2e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5679  amidohydrolase  50.77 
 
 		 408 aa  362  5.0000000000000005e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613587 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  46.92 
 
 		 396 aa  361  1e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1813  peptidase M20D, amidohydrolase  51.6 
 
 		 388 aa  359  6e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.301487  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  46.74 
 
 		 396 aa  359  6e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  50.54 
 
 		 388 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  47.67 
 
 		 388 aa  355  5e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  46.48 
 
 		 396 aa  355  7.999999999999999e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  48.93 
 
 		 412 aa  355  1e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  45.93 
 
 		 398 aa  354  1e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6268  amidohydrolase  50.14 
 
 		 395 aa  353  2e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.843577  normal  0.0558872 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  46.34 
 
 		 397 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6670  amidohydrolase  49.86 
 
 		 395 aa  353  4e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6435  peptidase M20D, amidohydrolase  49.86 
 
 		 395 aa  353  4e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0069  peptidase M20D, amidohydrolase  51.48 
 
 		 384 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.53846  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  46.19 
 
 		 396 aa  352  8.999999999999999e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5260  putative amidohydrolase family protein  47.85 
 
 		 387 aa  351  1e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0497165  normal  0.313624 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  50.94 
 
 		 388 aa  351  1e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0665  amidohydrolase  50 
 
 		 408 aa  351  2e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0687  amidohydrolase  50 
 
 		 408 aa  350  2e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.422759  normal  0.057643 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2982  putative amidohydrolase family protein  49.35 
 
 		 389 aa  350  2e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0935  amidohydrolase  50 
 
 		 415 aa  350  2e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1288  amidohydrolase  49.48 
 
 		 388 aa  350  2e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0866095  normal  0.389955 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1090  amidohydrolase  49.47 
 
 		 424 aa  350  2e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4256  amidohydrolase  48.58 
 
 		 392 aa  350  3e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.545833 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1245  hippurate hydolase  47.35 
 
 		 396 aa  349  6e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689013  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  47.35 
 
 		 396 aa  349  6e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  47.35 
 
 		 396 aa  349  6e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  47.35 
 
 		 396 aa  349  6e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6067  amidohydrolase  49.05 
 
 		 395 aa  348  1e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5843  amidohydrolase  49.35 
 
 		 396 aa  348  1e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6364  amidohydrolase  49.32 
 
 		 395 aa  348  1e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.557183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  47.09 
 
 		 396 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  47.09 
 
 		 396 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  47.09 
 
 		 396 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  47.53 
 
 		 403 aa  346  3e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  45.5 
 
 		 402 aa  346  4e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  46.74 
 
 		 404 aa  345  5e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0984  peptidase M20D, amidohydrolase  47.67 
 
 		 397 aa  345  6e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  47.38 
 
 		 387 aa  344  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4433  amidohydrolase  46.83 
 
 		 394 aa  344  1e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  46.56 
 
 		 394 aa  344  1e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5626  amidohydrolase  48.83 
 
 		 399 aa  343  2e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.528848  normal  0.0552178 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5651  amidohydrolase  48.83 
 
 		 396 aa  343  2e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.146235 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3715  peptidase M20D, amidohydrolase  48.83 
 
 		 415 aa  343  2e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410848  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  46.56 
 
 		 394 aa  343  2e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  46.56 
 
 		 394 aa  343  2e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  46.56 
 
 		 394 aa  343  2e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4653  amidohydrolase  48.83 
 
 		 415 aa  343  2e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0295739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2466  amidohydrolase  50.8 
 
 		 390 aa  342  4e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.293537  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  47.09 
 
 		 379 aa  343  4e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3456  amidohydrolase  48.43 
 
 		 388 aa  343  4e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0444  amidohydrolase  47.11 
 
 		 401 aa  343  4e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186163  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  46.32 
 
 		 394 aa  341  1e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  46.83 
 
 		 396 aa  342  1e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0453  amidohydrolase  46.84 
 
 		 401 aa  341  1e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4586  putative amidohydrolase family protein  48.26 
 
 		 389 aa  340  2e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  46.44 
 
 		 398 aa  341  2e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  46.49 
 
 		 387 aa  340  2e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1298  peptidase M20D, amidohydrolase  46.3 
 
 		 394 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1734  peptidase M20D, amidohydrolase  47.79 
 
 		 389 aa  338  7e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.0172136 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5519  amidohydrolase  47.73 
 
 		 396 aa  338  7e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.5258  normal  0.111633 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1301  amidohydrolase  48.6 
 
 		 404 aa  338  8e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.855359 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  45.79 
 
 		 397 aa  338  8e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  46.19 
 
 		 423 aa  338  9e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  46.07 
 
 		 387 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1729  peptidase M20D, amidohydrolase  48.45 
 
 		 390 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0022862 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2871  peptidase M20D, amidohydrolase  48.81 
 
 		 391 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4367  amidohydrolase  47.67 
 
 		 388 aa  337  1.9999999999999998e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2229  amidohydrolase  47.48 
 
 		 395 aa  336  2.9999999999999997e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  45.93 
 
 		 397 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  47 
 
 		 406 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4012  amidohydrolase  47.58 
 
 		 392 aa  336  5e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873821 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3187  amidohydrolase  51.04 
 
 		 388 aa  335  7e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0033512 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1248  amidohydrolase  45.83 
 
 		 425 aa  335  1e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.144528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3314  amidohydrolase  47.89 
 
 		 390 aa  333  2e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2671  peptidase M20D, amidohydrolase  48.46 
 
 		 394 aa  334  2e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00976662  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4686  amidohydrolase  51.21 
 
 		 385 aa  333  3e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.694379  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3456  amidohydrolase  46.49 
 
 		 389 aa  333  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.960361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  47.91 
 
 		 403 aa  333  3e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  46.67 
 
 		 399 aa  333  4e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4834  amidohydrolase  50.41 
 
 		 385 aa  333  4e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0546494  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4317  amidohydrolase  51.48 
 
 		 385 aa  332  5e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0319433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2573  amidohydrolase  47.91 
 
 		 387 aa  332  5e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0165265  normal  0.498174 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2262  peptidase M20D, amidohydrolase  47.27 
 
 		 389 aa  332  6e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.891111  normal  0.0931897 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1193  peptidase M20D, amidohydrolase  50.13 
 
 		 388 aa  332  6e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.95754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4250  amidohydrolase  47.67 
 
 		 390 aa  332  6e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.456638  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4914  putative hydrolase  47.14 
 
 		 405 aa  332  9e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2476  amidohydrolase  47.92 
 
 		 398 aa  332  9e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.738512  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2260  putative amidohydrolase family protein  49.21 
 
 		 390 aa  332  1e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3289  peptidase M20D, amidohydrolase  46.19 
 
 		 387 aa  331  1e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.286044 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  45.45 
 
 		 387 aa  331  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>