More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3456 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_3456  amidohydrolase  100 
 
 		 388 aa  791    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1216  amidohydrolase  61.94 
 
 		 386 aa  495  1e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3523  peptidase M20D, amidohydrolase  60.42 
 
 		 385 aa  478  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2808  amidohydrolase  60.9 
 
 		 385 aa  473  1e-132  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1882  peptidase, M20/M25/M40 family  60.37 
 
 		 385 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.237725  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  49.47 
 
 		 384 aa  387  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0069  peptidase M20D, amidohydrolase  50.27 
 
 		 384 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.53846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  47.35 
 
 		 403 aa  354  2e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  47.59 
 
 		 389 aa  353  4e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4433  amidohydrolase  47.42 
 
 		 394 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  47.42 
 
 		 394 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4586  putative amidohydrolase family protein  46.86 
 
 		 389 aa  342  5.999999999999999e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  45.89 
 
 		 388 aa  341  1e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  47.11 
 
 		 394 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  47.11 
 
 		 394 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  46.13 
 
 		 389 aa  340  2e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  47.11 
 
 		 394 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  44.72 
 
 		 397 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  47.51 
 
 		 396 aa  340  4e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  46.01 
 
 		 399 aa  339  4e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  47.24 
 
 		 394 aa  339  5e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  46.72 
 
 		 396 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1245  hippurate hydolase  46.72 
 
 		 396 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689013  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  46.72 
 
 		 396 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  46.72 
 
 		 396 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  46.72 
 
 		 396 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  46.72 
 
 		 396 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  46.72 
 
 		 396 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2871  peptidase M20D, amidohydrolase  47.99 
 
 		 391 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0444  amidohydrolase  46.63 
 
 		 401 aa  336  5e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186163  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  46.3 
 
 		 402 aa  336  5e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1298  peptidase M20D, amidohydrolase  46.98 
 
 		 394 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0453  amidohydrolase  46.37 
 
 		 401 aa  334  1e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1813  peptidase M20D, amidohydrolase  48.12 
 
 		 388 aa  334  1e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.301487  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  45.12 
 
 		 396 aa  334  1e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  44.39 
 
 		 404 aa  334  2e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  44.44 
 
 		 397 aa  333  2e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2611  amidohydrolase  46.19 
 
 		 391 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  45.03 
 
 		 396 aa  333  2e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2549  amidohydrolase  45.5 
 
 		 389 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.475258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5843  amidohydrolase  47.27 
 
 		 396 aa  333  3e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3715  peptidase M20D, amidohydrolase  47.66 
 
 		 415 aa  333  4e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410848  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4653  amidohydrolase  47.66 
 
 		 415 aa  333  4e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0295739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  45.62 
 
 		 379 aa  332  5e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  44.76 
 
 		 396 aa  332  5e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5651  amidohydrolase  47.66 
 
 		 396 aa  332  5e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.146235 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5260  putative amidohydrolase family protein  45.24 
 
 		 387 aa  331  1e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0497165  normal  0.313624 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1193  peptidase M20D, amidohydrolase  46.93 
 
 		 388 aa  331  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.95754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2753  amidohydrolase  45.93 
 
 		 391 aa  331  1e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114457  normal  0.226959 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  43.58 
 
 		 389 aa  331  1e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5626  amidohydrolase  47.01 
 
 		 399 aa  330  2e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.528848  normal  0.0552178 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  45.87 
 
 		 390 aa  330  2e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2466  amidohydrolase  48.53 
 
 		 390 aa  331  2e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.293537  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  47.24 
 
 		 388 aa  330  3e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0937  peptidase M20D, amidohydrolase  44.71 
 
 		 387 aa  328  9e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.47047  normal  0.0807888 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  45.31 
 
 		 397 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3187  amidohydrolase  47.12 
 
 		 388 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0033512 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4834  amidohydrolase  48.68 
 
 		 385 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0546494  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2919  amidohydrolase  45.69 
 
 		 388 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.068301  normal  0.124085 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1248  amidohydrolase  46.48 
 
 		 425 aa  327  2.0000000000000001e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.144528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  44.59 
 
 		 397 aa  327  3e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0333  amidohydrolase  44.36 
 
 		 401 aa  327  3e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  45.5 
 
 		 406 aa  327  3e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  47.03 
 
 		 388 aa  326  5e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  46.67 
 
 		 388 aa  326  5e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0044  peptidase M20D, amidohydrolase  48.43 
 
 		 385 aa  325  6e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  44.47 
 
 		 398 aa  325  6e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  45.36 
 
 		 397 aa  325  7e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  42.57 
 
 		 396 aa  325  8.000000000000001e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3584  amidohydrolase  46.79 
 
 		 390 aa  325  9e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0132191 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4367  amidohydrolase  47.04 
 
 		 388 aa  325  1e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2037  M20/M25/M40 family peptidase  47.14 
 
 		 387 aa  323  2e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.403946  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0901  amidohydrolase  46.03 
 
 		 387 aa  323  2e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0935  amidohydrolase  44.74 
 
 		 415 aa  323  2e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7215  hippurate hydrolase  47.35 
 
 		 397 aa  323  3e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6019  amidohydrolase  45.31 
 
 		 389 aa  323  3e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  43.92 
 
 		 423 aa  323  3e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4353  amidohydrolase  46.01 
 
 		 399 aa  323  3e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.980853  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4012  amidohydrolase  46.26 
 
 		 392 aa  323  3e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873821 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4914  putative hydrolase  45.77 
 
 		 405 aa  323  4e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4917  amidohydrolase family protein  45.58 
 
 		 376 aa  322  5e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.863248  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2692  amidohydrolase  44.91 
 
 		 388 aa  322  5e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0665  amidohydrolase  45.26 
 
 		 408 aa  322  5e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0687  amidohydrolase  45.26 
 
 		 408 aa  322  7e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.422759  normal  0.057643 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1959  M20/M25/M40 family peptidase  46.88 
 
 		 387 aa  321  9.999999999999999e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2932  peptidase M20D, amidohydrolase  45.41 
 
 		 382 aa  322  9.999999999999999e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.886758  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1288  amidohydrolase  45.99 
 
 		 388 aa  321  9.999999999999999e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0866095  normal  0.389955 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1708  peptidase M20D, amidohydrolase  46.77 
 
 		 389 aa  321  9.999999999999999e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.971842  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1090  amidohydrolase  44.59 
 
 		 424 aa  322  9.999999999999999e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4686  amidohydrolase  47.48 
 
 		 385 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.694379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  43.39 
 
 		 398 aa  320  3e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4256  amidohydrolase  43.32 
 
 		 392 aa  319  5e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.545833 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0984  peptidase M20D, amidohydrolase  43.98 
 
 		 397 aa  318  1e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  44.21 
 
 		 387 aa  318  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3928  amidohydrolase  46.81 
 
 		 395 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.530582  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  43.64 
 
 		 403 aa  317  2e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2815  amidohydrolase  44.91 
 
 		 390 aa  317  2e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.575474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5679  amidohydrolase  43.12 
 
 		 408 aa  317  2e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613587 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1301  amidohydrolase  44.33 
 
 		 404 aa  317  3e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.855359 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4317  amidohydrolase  47.21 
 
 		 385 aa  317  3e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0319433  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>