More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1708 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1708  peptidase M20D, amidohydrolase  100 
 
 
389 aa  798    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.971842  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2871  peptidase M20D, amidohydrolase  54.4 
 
 
391 aa  385  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4586  putative amidohydrolase family protein  48.4 
 
 
389 aa  359  4e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  49.2 
 
 
389 aa  355  5.999999999999999e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2466  amidohydrolase  53.6 
 
 
390 aa  354  2e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.293537  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  49.87 
 
 
403 aa  352  5e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2932  peptidase M20D, amidohydrolase  50.94 
 
 
382 aa  351  1e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.886758  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  47.98 
 
 
387 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6268  amidohydrolase  49.33 
 
 
395 aa  344  1e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.843577  normal  0.0558872 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  47.44 
 
 
387 aa  344  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6670  amidohydrolase  49.33 
 
 
395 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1216  amidohydrolase  48.18 
 
 
386 aa  343  2e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6435  peptidase M20D, amidohydrolase  49.33 
 
 
395 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2808  amidohydrolase  49.35 
 
 
385 aa  342  9e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  49.46 
 
 
384 aa  341  1e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  49.19 
 
 
388 aa  341  1e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6067  amidohydrolase  48.79 
 
 
395 aa  339  5e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5626  amidohydrolase  48.71 
 
 
399 aa  338  7e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.528848  normal  0.0552178 
 
 
-
 
NC_004310  BR2037  M20/M25/M40 family peptidase  48.92 
 
 
387 aa  337  1.9999999999999998e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.403946  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6364  amidohydrolase  48.52 
 
 
395 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.557183  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0937  peptidase M20D, amidohydrolase  45.92 
 
 
387 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.47047  normal  0.0807888 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1959  M20/M25/M40 family peptidase  48.92 
 
 
387 aa  335  9e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  47.77 
 
 
404 aa  335  1e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4653  amidohydrolase  48.56 
 
 
415 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0295739  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3715  peptidase M20D, amidohydrolase  48.56 
 
 
415 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410848  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5843  amidohydrolase  48.83 
 
 
396 aa  333  2e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575611  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5651  amidohydrolase  48.56 
 
 
396 aa  333  4e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.146235 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0069  peptidase M20D, amidohydrolase  48.25 
 
 
384 aa  331  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.53846  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3456  amidohydrolase  47.58 
 
 
388 aa  330  3e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0901  amidohydrolase  47.84 
 
 
387 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0444  amidohydrolase  46.72 
 
 
401 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186163  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  43.78 
 
 
397 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3872  hippurate hydrolase  46.76 
 
 
387 aa  327  2.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4062  amidohydrolase  48.13 
 
 
387 aa  326  4.0000000000000003e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  48.53 
 
 
412 aa  326  5e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  45.69 
 
 
423 aa  325  6e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  44.13 
 
 
396 aa  325  6e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0453  amidohydrolase  46.46 
 
 
401 aa  325  7e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1813  peptidase M20D, amidohydrolase  48 
 
 
388 aa  325  7e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.301487  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1211  amidohydrolase  46.05 
 
 
384 aa  323  2e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.108173  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5679  amidohydrolase  45.45 
 
 
408 aa  323  2e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.613587 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3584  amidohydrolase  47.59 
 
 
390 aa  323  2e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0132191 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2229  amidohydrolase  45.53 
 
 
395 aa  324  2e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2692  amidohydrolase  47.98 
 
 
388 aa  323  2e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2671  peptidase M20D, amidohydrolase  46.7 
 
 
394 aa  323  3e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00976662  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2919  amidohydrolase  47.71 
 
 
388 aa  323  4e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.068301  normal  0.124085 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  44.39 
 
 
396 aa  323  4e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  44.19 
 
 
398 aa  323  5e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5519  amidohydrolase  46.36 
 
 
396 aa  322  7e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.5258  normal  0.111633 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0512  peptidase M20D, amidohydrolase  50 
 
 
379 aa  322  9.000000000000001e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.252109 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  45.05 
 
 
397 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4256  amidohydrolase  46.28 
 
 
392 aa  321  9.999999999999999e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.545833 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  44.13 
 
 
396 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2815  amidohydrolase  47.71 
 
 
390 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.575474  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1729  peptidase M20D, amidohydrolase  47.59 
 
 
390 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0022862 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4250  amidohydrolase  48 
 
 
390 aa  319  5e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.456638  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4367  amidohydrolase  47.17 
 
 
388 aa  319  6e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  44.13 
 
 
396 aa  318  7.999999999999999e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3523  peptidase M20D, amidohydrolase  46.61 
 
 
385 aa  318  1e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  46.7 
 
 
397 aa  317  2e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  44.91 
 
 
397 aa  317  3e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2573  amidohydrolase  47.61 
 
 
387 aa  316  4e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0165265  normal  0.498174 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2982  putative amidohydrolase family protein  45.26 
 
 
389 aa  316  4e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  45.69 
 
 
397 aa  315  8e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1248  amidohydrolase  45.85 
 
 
425 aa  315  9.999999999999999e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.144528  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3565  peptidase M20D, amidohydrolase  47.2 
 
 
390 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  46.98 
 
 
388 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3456  amidohydrolase  47.72 
 
 
389 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.960361  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3041  amidohydrolase  47.48 
 
 
402 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0143655 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2262  peptidase M20D, amidohydrolase  46.79 
 
 
389 aa  313  3.9999999999999997e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.891111  normal  0.0931897 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0665  amidohydrolase  45.43 
 
 
408 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2533  peptidase M20D, amidohydrolase  45.43 
 
 
397 aa  313  3.9999999999999997e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0030908 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0687  amidohydrolase  45.43 
 
 
408 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.422759  normal  0.057643 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  46.98 
 
 
388 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4834  amidohydrolase  47.83 
 
 
385 aa  312  4.999999999999999e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0546494  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0333  amidohydrolase  46.13 
 
 
401 aa  312  5.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5260  putative amidohydrolase family protein  44.77 
 
 
387 aa  312  6.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0497165  normal  0.313624 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0651  amidohydrolase  42.64 
 
 
447 aa  310  2e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0326492  normal  0.115252 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1734  peptidase M20D, amidohydrolase  46.52 
 
 
389 aa  310  2e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.0172136 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1882  peptidase, M20/M25/M40 family  45.69 
 
 
385 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.237725  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  45.19 
 
 
399 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2910  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  45.75 
 
 
388 aa  310  4e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1555  amidohydrolase  45.75 
 
 
388 aa  310  4e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435924  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0044  peptidase M20D, amidohydrolase  46.34 
 
 
385 aa  310  4e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4686  amidohydrolase  48.37 
 
 
385 aa  309  6.999999999999999e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.694379  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1161  amidohydrolase  46.47 
 
 
386 aa  309  6.999999999999999e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0935  amidohydrolase  43.7 
 
 
415 aa  308  9e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3056  amidohydrolase  46.77 
 
 
387 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  43.8 
 
 
398 aa  307  2.0000000000000002e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3314  amidohydrolase  42.59 
 
 
390 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  45.7 
 
 
388 aa  306  3e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  44.39 
 
 
402 aa  306  3e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  47.45 
 
 
390 aa  306  3e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1110  amidohydrolase  46.74 
 
 
388 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.247548  normal  0.0143187 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2476  amidohydrolase  44.36 
 
 
398 aa  305  8.000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.738512  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4612  amidohydrolase  46.79 
 
 
389 aa  305  9.000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.194835  normal  0.384238 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4317  amidohydrolase  48.1 
 
 
385 aa  305  9.000000000000001e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0319433  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1812  amidohydrolase  44.88 
 
 
400 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  44.27 
 
 
379 aa  304  2.0000000000000002e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3086  peptidase M20D, amidohydrolase  44.35 
 
 
389 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.985379  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>