More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4586 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4586  putative amidohydrolase family protein  100 
 
 		 389 aa  785    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1734  peptidase M20D, amidohydrolase  63.75 
 
 		 389 aa  504  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.0172136 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3565  peptidase M20D, amidohydrolase  63.33 
 
 		 390 aa  498  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1729  peptidase M20D, amidohydrolase  63.59 
 
 		 390 aa  497  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0022862 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2671  peptidase M20D, amidohydrolase  60.66 
 
 		 394 aa  487  1e-136  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00976662  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  59.13 
 
 		 388 aa  481  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2982  putative amidohydrolase family protein  60.67 
 
 		 389 aa  481  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4250  amidohydrolase  62.82 
 
 		 390 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.456638  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  60.05 
 
 		 387 aa  479  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3187  amidohydrolase  62.37 
 
 		 388 aa  480  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0033512 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2262  peptidase M20D, amidohydrolase  60.93 
 
 		 389 aa  476  1e-133  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.891111  normal  0.0931897 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  59.27 
 
 		 387 aa  477  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1288  amidohydrolase  59.38 
 
 		 388 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0866095  normal  0.389955 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3872  hippurate hydrolase  58.03 
 
 		 387 aa  468  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2260  putative amidohydrolase family protein  61.44 
 
 		 390 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2037  M20/M25/M40 family peptidase  56.48 
 
 		 387 aa  458  9.999999999999999e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.403946  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4062  amidohydrolase  60.05 
 
 		 387 aa  458  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0245  amidohydrolase  61.6 
 
 		 388 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.352854  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2229  amidohydrolase  58.9 
 
 		 395 aa  457  1e-127  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5364  putative amidohydrolase family protein  60.93 
 
 		 390 aa  455  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00388806 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1959  M20/M25/M40 family peptidase  56.22 
 
 		 387 aa  456  1e-127  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3289  peptidase M20D, amidohydrolase  58.25 
 
 		 387 aa  452  1.0000000000000001e-126  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.286044 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2573  amidohydrolase  60.05 
 
 		 387 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0165265  normal  0.498174 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2919  amidohydrolase  58.76 
 
 		 388 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.068301  normal  0.124085 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0901  amidohydrolase  55.44 
 
 		 387 aa  448  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2692  amidohydrolase  58.25 
 
 		 388 aa  449  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0719  peptidase M20D, amidohydrolase  57.22 
 
 		 387 aa  448  1e-125  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.093275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4367  amidohydrolase  56.19 
 
 		 388 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2815  amidohydrolase  58.51 
 
 		 390 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.575474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0937  peptidase M20D, amidohydrolase  54.5 
 
 		 387 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.47047  normal  0.0807888 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3584  amidohydrolase  57.47 
 
 		 390 aa  444  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0132191 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3056  amidohydrolase  58.91 
 
 		 387 aa  442  1e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0610  amidohydrolase  58.61 
 
 		 389 aa  434  1e-121  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00962709  normal  0.632979 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1555  amidohydrolase  53.61 
 
 		 388 aa  421  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2910  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  53.61 
 
 		 388 aa  421  1e-117  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0718  peptidase M20D, amidohydrolase  53.09 
 
 		 390 aa  424  1e-117  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.178083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1161  amidohydrolase  55.15 
 
 		 386 aa  419  1e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1110  amidohydrolase  55.15 
 
 		 388 aa  414  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.247548  normal  0.0143187 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3314  amidohydrolase  53.47 
 
 		 390 aa  410  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  50 
 
 		 396 aa  400  9.999999999999999e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  50.5 
 
 		 397 aa  395  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2343  peptidase M20D, amidohydrolase  50.65 
 
 		 386 aa  395  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0732987  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  51.44 
 
 		 388 aa  392  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  53.55 
 
 		 388 aa  388  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4834  amidohydrolase  51.44 
 
 		 385 aa  385  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0546494  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  48.87 
 
 		 396 aa  384  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  48.61 
 
 		 396 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  48.87 
 
 		 396 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  48.48 
 
 		 397 aa  381  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2533  peptidase M20D, amidohydrolase  47.74 
 
 		 397 aa  376  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030908 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0665  amidohydrolase  51.16 
 
 		 408 aa  372  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5260  putative amidohydrolase family protein  48.32 
 
 		 387 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0497165  normal  0.313624 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  50.26 
 
 		 394 aa  372  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4433  amidohydrolase  50.26 
 
 		 394 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0687  amidohydrolase  51.16 
 
 		 408 aa  372  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.422759  normal  0.057643 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4686  amidohydrolase  50.91 
 
 		 385 aa  371  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.694379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  51.09 
 
 		 389 aa  370  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1301  amidohydrolase  49.87 
 
 		 404 aa  370  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.855359 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1298  peptidase M20D, amidohydrolase  50 
 
 		 394 aa  370  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0935  amidohydrolase  48.45 
 
 		 415 aa  368  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1813  peptidase M20D, amidohydrolase  52.56 
 
 		 388 aa  368  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.301487  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3086  peptidase M20D, amidohydrolase  52.7 
 
 		 389 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.985379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4317  amidohydrolase  51.17 
 
 		 385 aa  371  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0319433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  49.74 
 
 		 394 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  49.74 
 
 		 394 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  49.74 
 
 		 394 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  49.74 
 
 		 394 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1090  amidohydrolase  49.61 
 
 		 424 aa  367  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  49.09 
 
 		 406 aa  363  2e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  45.84 
 
 		 398 aa  363  3e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  46.63 
 
 		 397 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  52.83 
 
 		 399 aa  362  9e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  48.51 
 
 		 399 aa  362  9e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4012  amidohydrolase  49.47 
 
 		 392 aa  361  1e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873821 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5569  amidohydrolase  51.44 
 
 		 401 aa  359  5e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2323  amidohydrolase  51.44 
 
 		 386 aa  358  9e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.462875 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  50.94 
 
 		 395 aa  358  9e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4914  putative hydrolase  49.61 
 
 		 405 aa  358  9e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2379  amidohydrolase  51.19 
 
 		 402 aa  358  9.999999999999999e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2871  peptidase M20D, amidohydrolase  50.66 
 
 		 391 aa  356  2.9999999999999997e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  47.84 
 
 		 403 aa  357  2.9999999999999997e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5679  amidohydrolase  47.29 
 
 		 408 aa  356  3.9999999999999996e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613587 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  47.67 
 
 		 396 aa  356  5e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  47.67 
 
 		 396 aa  356  5e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1245  hippurate hydolase  47.67 
 
 		 396 aa  356  5e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689013  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  47.67 
 
 		 396 aa  356  5e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  47.67 
 
 		 396 aa  356  5e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  47.67 
 
 		 396 aa  356  5e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  47.67 
 
 		 396 aa  356  5e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  44.7 
 
 		 404 aa  355  6.999999999999999e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2611  amidohydrolase  50.13 
 
 		 391 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  47.93 
 
 		 396 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  48.55 
 
 		 387 aa  354  2e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1193  peptidase M20D, amidohydrolase  49.48 
 
 		 388 aa  353  2e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.95754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  50.52 
 
 		 384 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0252  peptidase M20D, amidohydrolase  51.1 
 
 		 396 aa  352  5e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5843  amidohydrolase  47.46 
 
 		 396 aa  352  5e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  48.42 
 
 		 389 aa  352  7e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  45.85 
 
 		 398 aa  352  8e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  44.91 
 
 		 397 aa  351  1e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>