More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1193 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5260  putative amidohydrolase family protein  80.88 
 
 		 387 aa  669    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0497165  normal  0.313624 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2126  peptidase M20D, amidohydrolase  85.05 
 
 		 390 aa  654    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.587793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1193  peptidase M20D, amidohydrolase  100 
 
 		 388 aa  788    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.95754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3928  amidohydrolase  82.99 
 
 		 395 aa  632  1e-180  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.530582  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3295  peptidase M20D, amidohydrolase  84.16 
 
 		 391 aa  620  1e-176  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.353614  normal  0.0242454 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  63.45 
 
 		 388 aa  503  1e-141  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  62.92 
 
 		 388 aa  501  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4834  amidohydrolase  65.01 
 
 		 385 aa  487  1e-136  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0546494  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4317  amidohydrolase  65.8 
 
 		 385 aa  483  1e-135  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0319433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4686  amidohydrolase  65.54 
 
 		 385 aa  481  1e-134  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.694379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7215  hippurate hydrolase  61.46 
 
 		 397 aa  479  1e-134  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0984  peptidase M20D, amidohydrolase  61.48 
 
 		 397 aa  475  1e-133  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2323  amidohydrolase  64.49 
 
 		 386 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.462875 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4653  amidohydrolase  52.91 
 
 		 415 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0295739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5651  amidohydrolase  52.91 
 
 		 396 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.146235 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3715  peptidase M20D, amidohydrolase  52.91 
 
 		 415 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410848  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5626  amidohydrolase  52.41 
 
 		 399 aa  388  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.528848  normal  0.0552178 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5843  amidohydrolase  52.15 
 
 		 396 aa  388  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3187  amidohydrolase  53.23 
 
 		 388 aa  379  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0033512 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  47.67 
 
 		 397 aa  376  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  48.3 
 
 		 397 aa  377  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4586  putative amidohydrolase family protein  49.48 
 
 		 389 aa  377  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  48.61 
 
 		 396 aa  372  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  48.35 
 
 		 396 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  47.85 
 
 		 396 aa  374  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  48.35 
 
 		 396 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2919  amidohydrolase  49.87 
 
 		 388 aa  368  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.068301  normal  0.124085 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  48.87 
 
 		 403 aa  370  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  49.87 
 
 		 388 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3584  amidohydrolase  50.39 
 
 		 390 aa  367  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0132191 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2692  amidohydrolase  49.87 
 
 		 388 aa  365  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  47.59 
 
 		 397 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  47.09 
 
 		 398 aa  366  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  49.47 
 
 		 390 aa  367  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  48.84 
 
 		 396 aa  363  2e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0937  peptidase M20D, amidohydrolase  45.85 
 
 		 387 aa  363  2e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.47047  normal  0.0807888 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  48.27 
 
 		 389 aa  363  3e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1298  peptidase M20D, amidohydrolase  48.32 
 
 		 394 aa  363  4e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  47.55 
 
 		 402 aa  363  4e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  48.17 
 
 		 412 aa  362  5.0000000000000005e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  51.32 
 
 		 384 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  48.58 
 
 		 396 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  48.58 
 
 		 396 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2533  peptidase M20D, amidohydrolase  49.25 
 
 		 397 aa  362  7.0000000000000005e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030908 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  48.58 
 
 		 396 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  48.58 
 
 		 396 aa  361  1e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  48.58 
 
 		 396 aa  361  1e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  48.58 
 
 		 396 aa  361  1e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1245  hippurate hydolase  48.58 
 
 		 396 aa  361  1e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689013  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  47.34 
 
 		 397 aa  360  2e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  46.84 
 
 		 423 aa  360  3e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4012  amidohydrolase  47.95 
 
 		 392 aa  359  4e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873821 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1288  amidohydrolase  48.72 
 
 		 388 aa  359  4e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0866095  normal  0.389955 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2910  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  45.74 
 
 		 388 aa  359  4e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1555  amidohydrolase  45.74 
 
 		 388 aa  359  4e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  46.35 
 
 		 404 aa  359  4e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1301  amidohydrolase  48.32 
 
 		 404 aa  359  5e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.855359 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  47.35 
 
 		 387 aa  359  5e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  48.06 
 
 		 394 aa  359  5e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  47.52 
 
 		 399 aa  358  6e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  47.8 
 
 		 394 aa  358  7e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  47.8 
 
 		 394 aa  358  7e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2262  peptidase M20D, amidohydrolase  50 
 
 		 389 aa  358  7e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.891111  normal  0.0931897 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  47.8 
 
 		 394 aa  358  7e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0444  amidohydrolase  47.1 
 
 		 401 aa  358  8e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186163  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0453  amidohydrolase  47.1 
 
 		 401 aa  358  8e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4433  amidohydrolase  47.8 
 
 		 394 aa  358  8e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  47.62 
 
 		 387 aa  358  9e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  47.62 
 
 		 387 aa  358  9e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  48.15 
 
 		 387 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  47.35 
 
 		 387 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  46.33 
 
 		 398 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2379  amidohydrolase  47.31 
 
 		 402 aa  357  1.9999999999999998e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  45.83 
 
 		 389 aa  357  2.9999999999999997e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  47.09 
 
 		 387 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  48.32 
 
 		 394 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2815  amidohydrolase  49.87 
 
 		 390 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.575474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  46.97 
 
 		 403 aa  355  6.999999999999999e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1248  amidohydrolase  46.7 
 
 		 425 aa  355  6.999999999999999e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.144528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  47.67 
 
 		 389 aa  355  7.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3565  peptidase M20D, amidohydrolase  49.87 
 
 		 390 aa  354  1e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  46.46 
 
 		 390 aa  353  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2229  amidohydrolase  47.78 
 
 		 395 aa  353  2.9999999999999997e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  47.09 
 
 		 387 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1090  amidohydrolase  47.29 
 
 		 424 aa  353  2.9999999999999997e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2932  peptidase M20D, amidohydrolase  50.41 
 
 		 382 aa  353  2.9999999999999997e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.886758  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  46.15 
 
 		 379 aa  353  2.9999999999999997e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0935  amidohydrolase  47.42 
 
 		 415 aa  353  4e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1734  peptidase M20D, amidohydrolase  50 
 
 		 389 aa  353  4e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.0172136 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  46.19 
 
 		 387 aa  353  4e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  47.23 
 
 		 406 aa  353  4e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  45.19 
 
 		 387 aa  352  5e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0665  amidohydrolase  47.8 
 
 		 408 aa  352  7e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0687  amidohydrolase  47.8 
 
 		 408 aa  352  7e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.422759  normal  0.057643 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2611  amidohydrolase  48.53 
 
 		 391 aa  351  1e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  45.48 
 
 		 397 aa  351  2e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3523  peptidase M20D, amidohydrolase  49.08 
 
 		 385 aa  350  2e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1161  amidohydrolase  47.03 
 
 		 386 aa  350  2e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2466  amidohydrolase  50.9 
 
 		 390 aa  351  2e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.293537  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4914  putative hydrolase  47.49 
 
 		 405 aa  350  3e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>