More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1555 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_2910  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  100 
 
 
388 aa  783    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1555  amidohydrolase  100 
 
 
388 aa  783    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435924  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1110  amidohydrolase  95.1 
 
 
388 aa  716    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.247548  normal  0.0143187 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0937  peptidase M20D, amidohydrolase  67.01 
 
 
387 aa  542  1e-153  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.47047  normal  0.0807888 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2343  peptidase M20D, amidohydrolase  65.19 
 
 
386 aa  528  1e-149  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0732987  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1161  amidohydrolase  62.95 
 
 
386 aa  509  1e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  54.57 
 
 
387 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  54.05 
 
 
387 aa  431  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3872  hippurate hydrolase  55.24 
 
 
387 aa  424  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4586  putative amidohydrolase family protein  53.61 
 
 
389 aa  421  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2037  M20/M25/M40 family peptidase  54.43 
 
 
387 aa  418  1e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.403946  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2919  amidohydrolase  54.52 
 
 
388 aa  418  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.068301  normal  0.124085 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1959  M20/M25/M40 family peptidase  53.91 
 
 
387 aa  415  9.999999999999999e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3187  amidohydrolase  54.78 
 
 
388 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0033512 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1734  peptidase M20D, amidohydrolase  53.51 
 
 
389 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.0172136 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2692  amidohydrolase  54.26 
 
 
388 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4250  amidohydrolase  54.4 
 
 
390 aa  411  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.456638  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3565  peptidase M20D, amidohydrolase  53.63 
 
 
390 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2573  amidohydrolase  54.45 
 
 
387 aa  409  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0165265  normal  0.498174 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0901  amidohydrolase  53.12 
 
 
387 aa  410  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2815  amidohydrolase  54.26 
 
 
390 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.575474  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2982  putative amidohydrolase family protein  52.47 
 
 
389 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2229  amidohydrolase  51.82 
 
 
395 aa  401  1e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0245  amidohydrolase  54.26 
 
 
388 aa  403  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.352854  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2671  peptidase M20D, amidohydrolase  52.05 
 
 
394 aa  402  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00976662  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4367  amidohydrolase  51.94 
 
 
388 aa  398  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2262  peptidase M20D, amidohydrolase  52.73 
 
 
389 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.891111  normal  0.0931897 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1288  amidohydrolase  52.96 
 
 
388 aa  389  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0866095  normal  0.389955 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3056  amidohydrolase  55.18 
 
 
387 aa  389  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1729  peptidase M20D, amidohydrolase  51.3 
 
 
390 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0022862 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  49.23 
 
 
388 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3289  peptidase M20D, amidohydrolase  52.58 
 
 
387 aa  385  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.286044 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3584  amidohydrolase  50.77 
 
 
390 aa  376  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0132191 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5364  putative amidohydrolase family protein  51.55 
 
 
390 aa  378  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00388806 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2260  putative amidohydrolase family protein  50.51 
 
 
390 aa  373  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  46.56 
 
 
397 aa  370  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0718  peptidase M20D, amidohydrolase  49.74 
 
 
390 aa  369  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.178083  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4062  amidohydrolase  48.3 
 
 
387 aa  370  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0610  amidohydrolase  50.38 
 
 
389 aa  366  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00962709  normal  0.632979 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4834  amidohydrolase  49.74 
 
 
385 aa  367  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0546494  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  46.46 
 
 
397 aa  363  2e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0719  peptidase M20D, amidohydrolase  49.74 
 
 
387 aa  364  2e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.093275  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  47.33 
 
 
396 aa  362  5.0000000000000005e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  47.07 
 
 
396 aa  362  8e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  47.58 
 
 
396 aa  360  2e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  48.7 
 
 
388 aa  360  2e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5260  putative amidohydrolase family protein  45.34 
 
 
387 aa  360  3e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0497165  normal  0.313624 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4686  amidohydrolase  50.52 
 
 
385 aa  359  3e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.694379  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3314  amidohydrolase  46.53 
 
 
390 aa  359  4e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  49.08 
 
 
379 aa  357  1.9999999999999998e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4317  amidohydrolase  50.26 
 
 
385 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0319433  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  44.16 
 
 
396 aa  355  5.999999999999999e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  46.97 
 
 
403 aa  353  4e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  48.04 
 
 
388 aa  353  4e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5679  amidohydrolase  47.06 
 
 
408 aa  352  5e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.613587 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0651  amidohydrolase  44.36 
 
 
447 aa  352  8.999999999999999e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0326492  normal  0.115252 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  47.51 
 
 
399 aa  350  3e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  47.52 
 
 
389 aa  349  4e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0749  peptidase M20D, amidohydrolase  44.33 
 
 
427 aa  349  5e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0878973  normal  0.8802 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  44.67 
 
 
397 aa  348  1e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  47.21 
 
 
387 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  48.11 
 
 
395 aa  346  3e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  45.15 
 
 
398 aa  346  3e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  47.72 
 
 
389 aa  346  5e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2533  peptidase M20D, amidohydrolase  44.7 
 
 
397 aa  345  5e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0030908 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0665  amidohydrolase  47.8 
 
 
408 aa  345  8.999999999999999e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  46.95 
 
 
387 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0687  amidohydrolase  47.8 
 
 
408 aa  345  1e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.422759  normal  0.057643 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  47.78 
 
 
388 aa  344  2e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3086  peptidase M20D, amidohydrolase  48.97 
 
 
389 aa  344  2e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.985379  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1193  peptidase M20D, amidohydrolase  45.74 
 
 
388 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.95754  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  44.79 
 
 
390 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  47.53 
 
 
399 aa  343  4e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  46.68 
 
 
387 aa  343  4e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  46.68 
 
 
387 aa  343  4e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  44.08 
 
 
404 aa  342  5e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  46.42 
 
 
387 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4653  amidohydrolase  45.8 
 
 
415 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0295739  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5651  amidohydrolase  45.8 
 
 
396 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.146235 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3715  peptidase M20D, amidohydrolase  45.8 
 
 
415 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410848  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  46.95 
 
 
387 aa  340  2e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  44.95 
 
 
403 aa  340  2e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4728  amidohydrolase  46.07 
 
 
393 aa  340  2e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.848291 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  47.88 
 
 
387 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  46.48 
 
 
389 aa  340  2.9999999999999998e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  46.03 
 
 
387 aa  339  5e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  43.26 
 
 
398 aa  338  8e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5626  amidohydrolase  45.04 
 
 
399 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.528848  normal  0.0552178 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5843  amidohydrolase  44.78 
 
 
396 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575611  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2871  peptidase M20D, amidohydrolase  49.34 
 
 
391 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  43.62 
 
 
397 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5405  amidohydrolase  45.66 
 
 
396 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5220  amidohydrolase  46.94 
 
 
393 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3769  amidohydrolase  48.48 
 
 
396 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0935  amidohydrolase  44.47 
 
 
415 aa  336  5e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  44.79 
 
 
387 aa  336  5e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  43.26 
 
 
423 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0984  peptidase M20D, amidohydrolase  45.78 
 
 
397 aa  335  1e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3928  amidohydrolase  47.03 
 
 
395 aa  335  1e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.530582  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2323  amidohydrolase  49.35 
 
 
386 aa  334  2e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.462875 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>