More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2533 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_2533  peptidase M20D, amidohydrolase  100 
 
 
397 aa  822    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0030908 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  69.29 
 
 
398 aa  585  1e-166  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  66.25 
 
 
404 aa  563  1.0000000000000001e-159  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  67.51 
 
 
403 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  64.48 
 
 
397 aa  561  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  66.16 
 
 
402 aa  558  1e-158  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  66.5 
 
 
397 aa  558  1e-158  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  64.99 
 
 
397 aa  560  1e-158  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  64.23 
 
 
396 aa  553  1e-156  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1248  amidohydrolase  65.49 
 
 
425 aa  553  1e-156  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.144528  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0444  amidohydrolase  65.49 
 
 
401 aa  551  1e-156  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186163  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0453  amidohydrolase  65.24 
 
 
401 aa  549  1e-155  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  64.47 
 
 
398 aa  548  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  64.21 
 
 
396 aa  548  1e-155  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  63.96 
 
 
397 aa  548  1e-155  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  64.47 
 
 
396 aa  550  1e-155  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  64.72 
 
 
423 aa  548  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  64.9 
 
 
397 aa  549  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  63.54 
 
 
396 aa  537  1e-151  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0333  amidohydrolase  63.45 
 
 
401 aa  524  1e-147  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5651  amidohydrolase  61.68 
 
 
396 aa  494  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.146235 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3715  peptidase M20D, amidohydrolase  61.68 
 
 
415 aa  495  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410848  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5843  amidohydrolase  61.42 
 
 
396 aa  497  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575611  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5626  amidohydrolase  61.68 
 
 
399 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.528848  normal  0.0552178 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4653  amidohydrolase  61.68 
 
 
415 aa  495  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0295739  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1132  amidohydrolase  63.07 
 
 
402 aa  488  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5224  amidohydrolase  53.63 
 
 
401 aa  433  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  52.74 
 
 
389 aa  425  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2229  amidohydrolase  53.81 
 
 
395 aa  420  1e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0943  amidohydrolase  55.06 
 
 
417 aa  412  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  53.61 
 
 
387 aa  413  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  52.84 
 
 
390 aa  411  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  53.4 
 
 
387 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  53.4 
 
 
387 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  52.58 
 
 
387 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  52.62 
 
 
387 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  52.62 
 
 
387 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  53.14 
 
 
387 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  52.62 
 
 
387 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  53.4 
 
 
387 aa  404  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4012  amidohydrolase  50.76 
 
 
392 aa  401  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.873821 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  50 
 
 
387 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1298  peptidase M20D, amidohydrolase  50.25 
 
 
394 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  50.25 
 
 
387 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  50.25 
 
 
394 aa  398  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  50.25 
 
 
394 aa  398  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  50.25 
 
 
394 aa  398  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2466  amidohydrolase  54.57 
 
 
390 aa  392  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.293537  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4433  amidohydrolase  49.49 
 
 
394 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  50.51 
 
 
396 aa  395  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  51.28 
 
 
390 aa  392  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4586  putative amidohydrolase family protein  49.75 
 
 
389 aa  392  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  49.24 
 
 
394 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  51.28 
 
 
389 aa  393  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  50.25 
 
 
396 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  50 
 
 
396 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  47.34 
 
 
403 aa  391  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  50.25 
 
 
396 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  50.25 
 
 
396 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  51.96 
 
 
395 aa  390  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  50 
 
 
396 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1245  hippurate hydolase  50.25 
 
 
396 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689013  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  49.87 
 
 
425 aa  390  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  50 
 
 
396 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  49.49 
 
 
394 aa  387  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5374  amidohydrolase  52.22 
 
 
399 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6019  amidohydrolase  50.77 
 
 
389 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  48.98 
 
 
388 aa  382  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2992  peptidase M20D, amidohydrolase  52.22 
 
 
399 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2260  putative amidohydrolase family protein  51 
 
 
390 aa  382  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5250  amidohydrolase  52.22 
 
 
396 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4896  amidohydrolase  51.96 
 
 
396 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.873901  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0252  peptidase M20D, amidohydrolase  51.7 
 
 
396 aa  380  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24772  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  46.13 
 
 
399 aa  381  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6067  amidohydrolase  49.08 
 
 
395 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4834  amidohydrolase  50.64 
 
 
385 aa  380  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0546494  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4721  amidohydrolase  52.22 
 
 
396 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  50 
 
 
388 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  48.09 
 
 
412 aa  378  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  47.96 
 
 
388 aa  376  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6268  amidohydrolase  49.6 
 
 
395 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.843577  normal  0.0558872 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2598  peptidase M20D, amidohydrolase  52.03 
 
 
396 aa  376  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.572475  normal  0.542589 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3769  amidohydrolase  51.17 
 
 
396 aa  375  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2871  peptidase M20D, amidohydrolase  51.3 
 
 
391 aa  375  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5260  putative amidohydrolase family protein  47.99 
 
 
387 aa  376  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0497165  normal  0.313624 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4728  amidohydrolase  48.35 
 
 
393 aa  378  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.848291 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6435  peptidase M20D, amidohydrolase  49.6 
 
 
395 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6670  amidohydrolase  49.6 
 
 
395 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  48.6 
 
 
389 aa  375  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6364  amidohydrolase  49.08 
 
 
395 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.557183  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4686  amidohydrolase  50.13 
 
 
385 aa  372  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.694379  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2982  putative amidohydrolase family protein  48.13 
 
 
389 aa  372  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2175  peptidase M20D, amidohydrolase  50.65 
 
 
396 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.20985 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2573  amidohydrolase  48.62 
 
 
387 aa  372  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0165265  normal  0.498174 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4062  amidohydrolase  48.23 
 
 
387 aa  372  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5140  amidohydrolase  51.29 
 
 
389 aa  372  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.778625 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2919  amidohydrolase  48.87 
 
 
388 aa  369  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.068301  normal  0.124085 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5679  amidohydrolase  47.85 
 
 
408 aa  369  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.613587 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1734  peptidase M20D, amidohydrolase  48.51 
 
 
389 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.0172136 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1729  peptidase M20D, amidohydrolase  49.25 
 
 
390 aa  368  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0022862 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>