More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3382 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  100 
 
 		 402 aa  835    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  74.81 
 
 		 398 aa  642    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  73.99 
 
 		 397 aa  639    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  73.74 
 
 		 403 aa  619  1e-176  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  73.42 
 
 		 404 aa  614  1e-175  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1248  amidohydrolase  71.65 
 
 		 425 aa  609  1e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.144528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0444  amidohydrolase  74.28 
 
 		 401 aa  606  9.999999999999999e-173  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186163  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0453  amidohydrolase  74.02 
 
 		 401 aa  604  9.999999999999999e-173  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  70.66 
 
 		 397 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0333  amidohydrolase  70.15 
 
 		 401 aa  591  1e-168  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1132  amidohydrolase  69.44 
 
 		 402 aa  562  1.0000000000000001e-159  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  63.87 
 
 		 397 aa  538  9.999999999999999e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2533  peptidase M20D, amidohydrolase  66.16 
 
 		 397 aa  539  9.999999999999999e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030908 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  63.45 
 
 		 397 aa  540  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  64.05 
 
 		 396 aa  535  1e-151  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  63.8 
 
 		 396 aa  535  1e-151  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  62.44 
 
 		 396 aa  532  1e-150  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  63.96 
 
 		 396 aa  531  1e-149  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  61.46 
 
 		 398 aa  518  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  60.45 
 
 		 423 aa  513  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  61.84 
 
 		 397 aa  502  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5626  amidohydrolase  59.8 
 
 		 399 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.528848  normal  0.0552178 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5843  amidohydrolase  59.54 
 
 		 396 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5651  amidohydrolase  59.39 
 
 		 396 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.146235 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4653  amidohydrolase  59.39 
 
 		 415 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0295739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3715  peptidase M20D, amidohydrolase  59.39 
 
 		 415 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410848  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5224  amidohydrolase  52.91 
 
 		 401 aa  424  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  52.23 
 
 		 389 aa  417  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  50.92 
 
 		 387 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  50.92 
 
 		 387 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2466  amidohydrolase  56.63 
 
 		 390 aa  400  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.293537  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  50.92 
 
 		 387 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4012  amidohydrolase  50.51 
 
 		 392 aa  398  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873821 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  49.62 
 
 		 390 aa  395  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0943  amidohydrolase  51.73 
 
 		 417 aa  395  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  50.39 
 
 		 387 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  50.39 
 
 		 387 aa  398  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  50.39 
 
 		 387 aa  392  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  48.98 
 
 		 394 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  50.39 
 
 		 387 aa  391  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  49.49 
 
 		 387 aa  391  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  48.98 
 
 		 394 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  48.98 
 
 		 394 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1298  peptidase M20D, amidohydrolase  48.48 
 
 		 394 aa  386  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  48.49 
 
 		 396 aa  385  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  49.24 
 
 		 387 aa  385  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4433  amidohydrolase  48.09 
 
 		 394 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  48.12 
 
 		 396 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  48.12 
 
 		 396 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  46.37 
 
 		 412 aa  382  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  48.12 
 
 		 396 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  48.12 
 
 		 396 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  48.12 
 
 		 396 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  48.12 
 
 		 396 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  49.12 
 
 		 390 aa  382  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1245  hippurate hydolase  48.12 
 
 		 396 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689013  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  48.22 
 
 		 394 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6670  amidohydrolase  50.26 
 
 		 395 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6067  amidohydrolase  50.66 
 
 		 395 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  47.84 
 
 		 394 aa  379  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  48.76 
 
 		 395 aa  378  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6435  peptidase M20D, amidohydrolase  50.26 
 
 		 395 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5519  amidohydrolase  49.36 
 
 		 396 aa  380  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.5258  normal  0.111633 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  47.23 
 
 		 403 aa  375  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6268  amidohydrolase  50.26 
 
 		 395 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.843577  normal  0.0558872 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  49.35 
 
 		 387 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2871  peptidase M20D, amidohydrolase  51.24 
 
 		 391 aa  377  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2476  amidohydrolase  50.78 
 
 		 398 aa  375  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.738512  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  46.45 
 
 		 388 aa  375  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  48.43 
 
 		 389 aa  376  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  47.14 
 
 		 379 aa  372  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3769  amidohydrolase  50 
 
 		 396 aa  374  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  48.44 
 
 		 425 aa  374  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6364  amidohydrolase  50.39 
 
 		 395 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.557183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5628  amidohydrolase  50.53 
 
 		 394 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.509819  hitchhiker  0.00594833 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  48.57 
 
 		 387 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0252  peptidase M20D, amidohydrolase  48.85 
 
 		 396 aa  369  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4728  amidohydrolase  47.59 
 
 		 393 aa  370  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.848291 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2992  peptidase M20D, amidohydrolase  49.11 
 
 		 399 aa  368  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5231  peptidase M20D, amidohydrolase  50.53 
 
 		 394 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5374  amidohydrolase  49.11 
 
 		 399 aa  368  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5133  amidohydrolase  48.49 
 
 		 407 aa  368  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.519765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0935  amidohydrolase  48.24 
 
 		 415 aa  367  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4601  amidohydrolase  50.53 
 
 		 394 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0856359  hitchhiker  0.00046008 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4896  amidohydrolase  48.85 
 
 		 396 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.873901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2379  amidohydrolase  48.18 
 
 		 402 aa  364  1e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5250  amidohydrolase  48.6 
 
 		 396 aa  365  1e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2229  amidohydrolase  47.09 
 
 		 395 aa  363  3e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4721  amidohydrolase  48.6 
 
 		 396 aa  363  3e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4914  putative hydrolase  47.7 
 
 		 405 aa  363  3e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0651  amidohydrolase  47.07 
 
 		 447 aa  362  8e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0326492  normal  0.115252 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  46.82 
 
 		 406 aa  361  1e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6019  amidohydrolase  47.89 
 
 		 389 aa  361  1e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  47.61 
 
 		 389 aa  361  1e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  43.83 
 
 		 399 aa  361  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5455  amidohydrolase  50.79 
 
 		 394 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.914482  normal  0.653715 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1301  amidohydrolase  47.24 
 
 		 404 aa  357  2.9999999999999997e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.855359 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0749  peptidase M20D, amidohydrolase  46.23 
 
 		 427 aa  357  2.9999999999999997e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0878973  normal  0.8802 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5220  amidohydrolase  47.12 
 
 		 393 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0058  peptidase M20D, amidohydrolase  49.74 
 
 		 391 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>