More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1519 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  87.31 
 
 		 387 aa  706    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  100 
 
 		 390 aa  800    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  95.85 
 
 		 387 aa  759    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  77.89 
 
 		 387 aa  630  1e-180  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  77.89 
 
 		 387 aa  632  1e-180  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  77.63 
 
 		 387 aa  628  1e-179  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  77.63 
 
 		 387 aa  628  1e-179  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  77.63 
 
 		 387 aa  630  1e-179  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  77.12 
 
 		 387 aa  625  1e-178  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  76.86 
 
 		 387 aa  617  1e-176  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5133  amidohydrolase  69.69 
 
 		 407 aa  542  1e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.519765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  67.18 
 
 		 389 aa  536  1e-151  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  63.66 
 
 		 389 aa  507  9.999999999999999e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6019  amidohydrolase  64.1 
 
 		 389 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2598  peptidase M20D, amidohydrolase  65.35 
 
 		 396 aa  490  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.572475  normal  0.542589 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5140  amidohydrolase  63.85 
 
 		 389 aa  488  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.778625 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6319  amidohydrolase  65.78 
 
 		 373 aa  482  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.834758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  63.4 
 
 		 390 aa  477  1e-133  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  62.14 
 
 		 394 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  61.14 
 
 		 394 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  61.14 
 
 		 394 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  61.14 
 
 		 394 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  60.84 
 
 		 394 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  62.14 
 
 		 396 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  62.14 
 
 		 396 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  62.14 
 
 		 396 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4433  amidohydrolase  60.57 
 
 		 394 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1298  peptidase M20D, amidohydrolase  60.84 
 
 		 394 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  62.14 
 
 		 396 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1245  hippurate hydolase  62.14 
 
 		 396 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689013  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4012  amidohydrolase  60 
 
 		 392 aa  462  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873821 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  58.79 
 
 		 412 aa  464  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  61.88 
 
 		 396 aa  464  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  61.88 
 
 		 396 aa  464  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  61.88 
 
 		 396 aa  464  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2379  amidohydrolase  60.63 
 
 		 402 aa  459  9.999999999999999e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  56.25 
 
 		 399 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5424  hippuricase  57.33 
 
 		 388 aa  445  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3769  amidohydrolase  59.22 
 
 		 396 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  56.81 
 
 		 395 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  55.41 
 
 		 425 aa  438  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5222  hippurate hydrolase  60 
 
 		 398 aa  440  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.22678 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  56.12 
 
 		 403 aa  439  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  57.14 
 
 		 399 aa  436  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4728  amidohydrolase  56.1 
 
 		 393 aa  437  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.848291 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5374  amidohydrolase  56.68 
 
 		 399 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0252  peptidase M20D, amidohydrolase  56.6 
 
 		 396 aa  433  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5250  amidohydrolase  56.85 
 
 		 396 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4896  amidohydrolase  56.6 
 
 		 396 aa  433  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.873901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2175  peptidase M20D, amidohydrolase  57.33 
 
 		 396 aa  434  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.20985 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4353  amidohydrolase  55.91 
 
 		 399 aa  433  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.980853  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2992  peptidase M20D, amidohydrolase  56.68 
 
 		 399 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  56.36 
 
 		 406 aa  432  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4721  amidohydrolase  56.85 
 
 		 396 aa  434  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4914  putative hydrolase  57.55 
 
 		 405 aa  428  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5935  amidohydrolase  56.54 
 
 		 396 aa  429  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3289  peptidase M20D, amidohydrolase  57.14 
 
 		 404 aa  426  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4507  hippurate hydrolase  57.03 
 
 		 403 aa  425  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0151662 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2611  amidohydrolase  56.1 
 
 		 391 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5569  amidohydrolase  54.88 
 
 		 401 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1410  amidohydrolase  57.56 
 
 		 404 aa  419  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.044641  normal  0.934375 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1291  peptidase M20D, amidohydrolase  55.99 
 
 		 391 aa  418  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.214577  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1452  amidohydrolase  57.41 
 
 		 404 aa  420  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.127453 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2753  amidohydrolase  56.1 
 
 		 391 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114457  normal  0.226959 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2549  amidohydrolase  54.95 
 
 		 389 aa  411  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.475258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  51.94 
 
 		 388 aa  412  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0948  peptidase M20D, amidohydrolase  55.78 
 
 		 395 aa  410  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  52.49 
 
 		 397 aa  408  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5419  peptidase, M20D subfamily  54.08 
 
 		 393 aa  409  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.880964 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1302  amidohydrolase  56.15 
 
 		 409 aa  409  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.580399  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0051  peptidase M20D, amidohydrolase  53.83 
 
 		 407 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  51.84 
 
 		 398 aa  406  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5896  amidohydrolase  55.53 
 
 		 395 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0480348 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1494  hippurate hydrolase  57.7 
 
 		 395 aa  401  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213987  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1808  peptidase  57.7 
 
 		 753 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0378  amidohydrolase family protein  57.7 
 
 		 395 aa  401  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0794  hippurate hydrolase  57.7 
 
 		 395 aa  401  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5516  amidohydrolase  57.18 
 
 		 395 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  51.44 
 
 		 404 aa  401  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2111  hippurate hydrolase  57.7 
 
 		 395 aa  401  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.216397  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3600  peptidase M20D, amidohydrolase  57.18 
 
 		 395 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4767  amidohydrolase  57.18 
 
 		 395 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0476  amidohydrolase family protein  57.59 
 
 		 395 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.504077  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  50.38 
 
 		 396 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5812  peptidase M20D, amidohydrolase  56.59 
 
 		 394 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.586057  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  52.8 
 
 		 379 aa  399  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  48.48 
 
 		 397 aa  395  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  49.74 
 
 		 396 aa  396  1e-109  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  50.38 
 
 		 396 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  49.62 
 
 		 402 aa  395  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  51.17 
 
 		 396 aa  392  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2533  peptidase M20D, amidohydrolase  52.84 
 
 		 397 aa  395  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030908 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  50.91 
 
 		 398 aa  394  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  49.48 
 
 		 397 aa  390  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5405  amidohydrolase  51.45 
 
 		 396 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0444  amidohydrolase  49.48 
 
 		 401 aa  388  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186163  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  48.84 
 
 		 397 aa  391  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1698  amidohydrolase  54.1 
 
 		 406 aa  391  1e-107  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.31217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0453  amidohydrolase  49.48 
 
 		 401 aa  387  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  50.39 
 
 		 423 aa  388  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>