More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5843 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5651  amidohydrolase  97.47 
 
 
396 aa  768    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.146235 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5626  amidohydrolase  98.48 
 
 
399 aa  790    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.528848  normal  0.0552178 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3715  peptidase M20D, amidohydrolase  97.47 
 
 
415 aa  769    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410848  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5843  amidohydrolase  100 
 
 
396 aa  803    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575611  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4653  amidohydrolase  97.47 
 
 
415 aa  769    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0295739  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  64.97 
 
 
397 aa  549  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  64.39 
 
 
423 aa  550  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  63.38 
 
 
398 aa  544  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  64.47 
 
 
396 aa  534  1e-151  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  64.14 
 
 
397 aa  535  1e-151  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  63.89 
 
 
396 aa  531  1e-150  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  63.45 
 
 
397 aa  532  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  63.89 
 
 
396 aa  531  1e-150  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  61.36 
 
 
396 aa  509  1e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  60.96 
 
 
403 aa  494  9.999999999999999e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  59.09 
 
 
398 aa  494  9.999999999999999e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  60.41 
 
 
397 aa  488  1e-137  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2533  peptidase M20D, amidohydrolase  61.42 
 
 
397 aa  489  1e-137  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0030908 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1248  amidohydrolase  58.69 
 
 
425 aa  475  1e-133  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.144528  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  58.38 
 
 
397 aa  477  1e-133  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  59.54 
 
 
402 aa  475  1e-133  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  57.64 
 
 
404 aa  471  1e-132  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0453  amidohydrolase  57.14 
 
 
401 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0444  amidohydrolase  57.39 
 
 
401 aa  468  9.999999999999999e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186163  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0333  amidohydrolase  57.32 
 
 
401 aa  462  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1132  amidohydrolase  59.8 
 
 
402 aa  453  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5224  amidohydrolase  55.42 
 
 
401 aa  431  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  52.08 
 
 
387 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  53.4 
 
 
389 aa  409  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  51.3 
 
 
387 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  51.3 
 
 
387 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  50.26 
 
 
387 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  52.08 
 
 
387 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  52.16 
 
 
388 aa  402  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0943  amidohydrolase  55.53 
 
 
417 aa  403  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  51.04 
 
 
387 aa  404  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5260  putative amidohydrolase family protein  51.28 
 
 
387 aa  403  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0497165  normal  0.313624 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  50.26 
 
 
387 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  51.91 
 
 
388 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  52.04 
 
 
390 aa  400  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  50.65 
 
 
387 aa  397  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  48.98 
 
 
390 aa  389  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4834  amidohydrolase  52.3 
 
 
385 aa  385  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0546494  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4012  amidohydrolase  50 
 
 
392 aa  387  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.873821 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  50.51 
 
 
396 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  50.13 
 
 
395 aa  385  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  50.77 
 
 
396 aa  385  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  50.51 
 
 
396 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  49.24 
 
 
387 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  50.51 
 
 
396 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1245  hippurate hydolase  50.26 
 
 
396 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689013  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  50.26 
 
 
396 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  50.26 
 
 
396 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4896  amidohydrolase  50.89 
 
 
396 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.873901  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0252  peptidase M20D, amidohydrolase  50.63 
 
 
396 aa  382  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24772  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1298  peptidase M20D, amidohydrolase  49.74 
 
 
394 aa  382  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  50.26 
 
 
396 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  49.49 
 
 
394 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6067  amidohydrolase  49.36 
 
 
395 aa  378  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2466  amidohydrolase  53.92 
 
 
390 aa  380  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.293537  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  48.85 
 
 
412 aa  380  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4317  amidohydrolase  53.32 
 
 
385 aa  380  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0319433  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5374  amidohydrolase  50.38 
 
 
399 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  50.51 
 
 
394 aa  381  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  48.71 
 
 
399 aa  381  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4686  amidohydrolase  53.06 
 
 
385 aa  380  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.694379  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4433  amidohydrolase  49.49 
 
 
394 aa  381  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  49.49 
 
 
394 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2992  peptidase M20D, amidohydrolase  50.38 
 
 
399 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  49.49 
 
 
394 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  49.49 
 
 
394 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6670  amidohydrolase  49.36 
 
 
395 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  48.47 
 
 
389 aa  375  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4353  amidohydrolase  48.72 
 
 
399 aa  377  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.980853  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3769  amidohydrolase  51.43 
 
 
396 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1193  peptidase M20D, amidohydrolase  52.15 
 
 
388 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.95754  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6268  amidohydrolase  49.36 
 
 
395 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.843577  normal  0.0558872 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5250  amidohydrolase  50.63 
 
 
396 aa  378  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6435  peptidase M20D, amidohydrolase  49.36 
 
 
395 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4721  amidohydrolase  50.63 
 
 
396 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4914  putative hydrolase  50.65 
 
 
405 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4728  amidohydrolase  49.22 
 
 
393 aa  372  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.848291 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3928  amidohydrolase  52.41 
 
 
395 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.530582  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6364  amidohydrolase  49.1 
 
 
395 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.557183  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  50.51 
 
 
389 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3187  amidohydrolase  51.89 
 
 
388 aa  373  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0033512 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  47.84 
 
 
399 aa  369  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5569  amidohydrolase  48.19 
 
 
401 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544377  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1813  peptidase M20D, amidohydrolase  51.89 
 
 
388 aa  370  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.301487  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2175  peptidase M20D, amidohydrolase  49.87 
 
 
396 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.20985 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  49.35 
 
 
425 aa  369  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  47.33 
 
 
403 aa  369  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  46.85 
 
 
387 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2229  amidohydrolase  49.35 
 
 
395 aa  366  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2871  peptidase M20D, amidohydrolase  51.69 
 
 
391 aa  367  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2379  amidohydrolase  48.74 
 
 
402 aa  367  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5519  amidohydrolase  47.04 
 
 
396 aa  365  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.5258  normal  0.111633 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5935  amidohydrolase  48.86 
 
 
396 aa  366  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  48.96 
 
 
406 aa  368  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3584  amidohydrolase  51.13 
 
 
390 aa  364  1e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0132191 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>