More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3484 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  100 
 
 		 398 aa  823    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  85.89 
 
 		 397 aa  728    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  97.24 
 
 		 423 aa  803    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  70.2 
 
 		 396 aa  605  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  70.45 
 
 		 396 aa  607  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  69.7 
 
 		 397 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  69.11 
 
 		 397 aa  600  1e-170  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  69.37 
 
 		 396 aa  593  1e-168  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  66.67 
 
 		 396 aa  563  1.0000000000000001e-159  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  62.37 
 
 		 398 aa  535  1e-151  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5843  amidohydrolase  63.38 
 
 		 396 aa  536  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4653  amidohydrolase  62.88 
 
 		 415 aa  531  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0295739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3715  peptidase M20D, amidohydrolase  62.88 
 
 		 415 aa  531  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410848  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5626  amidohydrolase  62.56 
 
 		 399 aa  530  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.528848  normal  0.0552178 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  62.59 
 
 		 403 aa  528  1e-149  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  62.97 
 
 		 397 aa  528  1e-149  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2533  peptidase M20D, amidohydrolase  64.47 
 
 		 397 aa  529  1e-149  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030908 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5651  amidohydrolase  62.88 
 
 		 396 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.146235 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  61.06 
 
 		 397 aa  522  1e-147  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  61.46 
 
 		 402 aa  518  1e-146  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1248  amidohydrolase  61.71 
 
 		 425 aa  513  1e-144  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.144528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  59.9 
 
 		 404 aa  507  9.999999999999999e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0333  amidohydrolase  60.61 
 
 		 401 aa  508  9.999999999999999e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0444  amidohydrolase  60.4 
 
 		 401 aa  500  1e-140  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186163  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0453  amidohydrolase  60.4 
 
 		 401 aa  500  1e-140  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1132  amidohydrolase  60.25 
 
 		 402 aa  482  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5224  amidohydrolase  54 
 
 		 401 aa  447  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  52.09 
 
 		 389 aa  430  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0943  amidohydrolase  53.77 
 
 		 417 aa  405  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  50 
 
 		 387 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  50 
 
 		 387 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  50 
 
 		 387 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  50 
 
 		 387 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  50 
 
 		 387 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  49.74 
 
 		 387 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  50 
 
 		 387 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2466  amidohydrolase  53.05 
 
 		 390 aa  396  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.293537  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  47.84 
 
 		 394 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  47.84 
 
 		 394 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  47.84 
 
 		 394 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  48.35 
 
 		 396 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  48.35 
 
 		 396 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  48.35 
 
 		 396 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4012  amidohydrolase  48.1 
 
 		 392 aa  391  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873821 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  48.35 
 
 		 396 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1298  peptidase M20D, amidohydrolase  47.84 
 
 		 394 aa  394  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1245  hippurate hydolase  48.35 
 
 		 396 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689013  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  48.35 
 
 		 396 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  50.91 
 
 		 390 aa  394  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  47.58 
 
 		 394 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  48.35 
 
 		 396 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4433  amidohydrolase  47.07 
 
 		 394 aa  388  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  48.09 
 
 		 396 aa  389  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  50.51 
 
 		 390 aa  390  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  49.21 
 
 		 387 aa  388  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  49.37 
 
 		 395 aa  385  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  47.33 
 
 		 394 aa  385  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  47.99 
 
 		 388 aa  384  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  48.09 
 
 		 412 aa  382  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  49.74 
 
 		 387 aa  385  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2476  amidohydrolase  48.64 
 
 		 398 aa  381  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.738512  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  47.49 
 
 		 388 aa  379  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6067  amidohydrolase  48.99 
 
 		 395 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6019  amidohydrolase  47.97 
 
 		 389 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1090  amidohydrolase  50.79 
 
 		 424 aa  377  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0252  peptidase M20D, amidohydrolase  48.61 
 
 		 396 aa  376  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2871  peptidase M20D, amidohydrolase  50 
 
 		 391 aa  377  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  48.83 
 
 		 425 aa  377  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  48.6 
 
 		 389 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  48.04 
 
 		 406 aa  378  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5374  amidohydrolase  48.86 
 
 		 399 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4896  amidohydrolase  48.61 
 
 		 396 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.873901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  48.36 
 
 		 388 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3769  amidohydrolase  48.61 
 
 		 396 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4834  amidohydrolase  50.26 
 
 		 385 aa  374  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0546494  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5250  amidohydrolase  48.86 
 
 		 396 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2992  peptidase M20D, amidohydrolase  48.86 
 
 		 399 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6435  peptidase M20D, amidohydrolase  47.98 
 
 		 395 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6268  amidohydrolase  47.98 
 
 		 395 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.843577  normal  0.0558872 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6670  amidohydrolase  47.98 
 
 		 395 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6364  amidohydrolase  47.98 
 
 		 395 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.557183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4317  amidohydrolase  50.51 
 
 		 385 aa  369  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0319433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  47.22 
 
 		 388 aa  370  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  46.17 
 
 		 389 aa  370  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  48.18 
 
 		 387 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4686  amidohydrolase  50.51 
 
 		 385 aa  369  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.694379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1813  peptidase M20D, amidohydrolase  48.86 
 
 		 388 aa  371  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.301487  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  44.92 
 
 		 403 aa  370  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4914  putative hydrolase  47.91 
 
 		 405 aa  371  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0069  peptidase M20D, amidohydrolase  49.21 
 
 		 384 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.53846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2229  amidohydrolase  48.48 
 
 		 395 aa  370  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  48.18 
 
 		 387 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5519  amidohydrolase  48.41 
 
 		 396 aa  369  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.5258  normal  0.111633 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4721  amidohydrolase  48.35 
 
 		 396 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2573  amidohydrolase  50.26 
 
 		 387 aa  366  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0165265  normal  0.498174 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  45.1 
 
 		 399 aa  364  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4728  amidohydrolase  45.55 
 
 		 393 aa  364  1e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.848291 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3289  peptidase M20D, amidohydrolase  48.22 
 
 		 404 aa  364  2e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2379  amidohydrolase  46.85 
 
 		 402 aa  364  2e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5260  putative amidohydrolase family protein  45.15 
 
 		 387 aa  363  3e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0497165  normal  0.313624 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>