More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1090 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1090  amidohydrolase  100 
 
 		 424 aa  858    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0665  amidohydrolase  76.37 
 
 		 408 aa  641    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0935  amidohydrolase  77.59 
 
 		 415 aa  656    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0687  amidohydrolase  76.37 
 
 		 408 aa  640    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.422759  normal  0.057643 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1301  amidohydrolase  75.38 
 
 		 404 aa  625  1e-178  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.855359 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5679  amidohydrolase  74.06 
 
 		 408 aa  615  1e-175  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613587 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0651  amidohydrolase  68.9 
 
 		 447 aa  593  1e-168  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0326492  normal  0.115252 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0749  peptidase M20D, amidohydrolase  67.47 
 
 		 427 aa  573  1.0000000000000001e-162  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0878973  normal  0.8802 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  54.01 
 
 		 397 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  53.59 
 
 		 397 aa  404  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  52.43 
 
 		 396 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  52.43 
 
 		 396 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  51.04 
 
 		 388 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3584  amidohydrolase  53.09 
 
 		 390 aa  388  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0132191 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3187  amidohydrolase  54.29 
 
 		 388 aa  385  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0033512 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2919  amidohydrolase  52.99 
 
 		 388 aa  383  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.068301  normal  0.124085 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  51.95 
 
 		 396 aa  380  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2229  amidohydrolase  49.62 
 
 		 395 aa  379  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2692  amidohydrolase  52.73 
 
 		 388 aa  381  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  50.79 
 
 		 398 aa  378  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  52.09 
 
 		 388 aa  376  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2260  putative amidohydrolase family protein  51.81 
 
 		 390 aa  373  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  52.09 
 
 		 388 aa  374  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  50.26 
 
 		 423 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  50.13 
 
 		 397 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3314  amidohydrolase  50.79 
 
 		 390 aa  374  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1288  amidohydrolase  50.26 
 
 		 388 aa  374  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0866095  normal  0.389955 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2815  amidohydrolase  51.95 
 
 		 390 aa  371  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.575474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4586  putative amidohydrolase family protein  50.53 
 
 		 389 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  50.13 
 
 		 397 aa  368  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0610  amidohydrolase  52.06 
 
 		 389 aa  364  1e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00962709  normal  0.632979 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  48.57 
 
 		 396 aa  364  2e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5260  putative amidohydrolase family protein  49.1 
 
 		 387 aa  363  2e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0497165  normal  0.313624 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3289  peptidase M20D, amidohydrolase  48.06 
 
 		 387 aa  363  4e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.286044 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  49.61 
 
 		 403 aa  363  4e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  48.81 
 
 		 389 aa  362  5.0000000000000005e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  49.48 
 
 		 398 aa  361  1e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0333  amidohydrolase  50.26 
 
 		 401 aa  361  1e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  48.59 
 
 		 404 aa  360  2e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2533  peptidase M20D, amidohydrolase  48.23 
 
 		 397 aa  360  4e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030908 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1813  peptidase M20D, amidohydrolase  50.8 
 
 		 388 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.301487  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4367  amidohydrolase  49.74 
 
 		 388 aa  357  1.9999999999999998e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1729  peptidase M20D, amidohydrolase  50.39 
 
 		 390 aa  356  2.9999999999999997e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0022862 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4834  amidohydrolase  51.04 
 
 		 385 aa  355  1e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0546494  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0937  peptidase M20D, amidohydrolase  47.79 
 
 		 387 aa  355  1e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.47047  normal  0.0807888 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0444  amidohydrolase  48.83 
 
 		 401 aa  353  4e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186163  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4686  amidohydrolase  51.57 
 
 		 385 aa  353  4e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.694379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4317  amidohydrolase  51.83 
 
 		 385 aa  353  5e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0319433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  46.75 
 
 		 402 aa  352  5.9999999999999994e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1248  amidohydrolase  50 
 
 		 425 aa  352  8e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.144528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0453  amidohydrolase  48.56 
 
 		 401 aa  351  1e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0245  amidohydrolase  52.47 
 
 		 388 aa  350  2e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.352854  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2932  peptidase M20D, amidohydrolase  49.09 
 
 		 382 aa  350  3e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.886758  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  49.07 
 
 		 387 aa  350  3e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1734  peptidase M20D, amidohydrolase  50 
 
 		 389 aa  349  5e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.0172136 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  48.81 
 
 		 387 aa  348  9e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1132  amidohydrolase  51.54 
 
 		 402 aa  348  1e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  46.75 
 
 		 387 aa  348  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0719  peptidase M20D, amidohydrolase  45.99 
 
 		 387 aa  347  3e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.093275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  48.06 
 
 		 406 aa  346  4e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4914  putative hydrolase  48.96 
 
 		 405 aa  346  5e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  48.04 
 
 		 389 aa  345  7e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  49.34 
 
 		 387 aa  345  7e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  46.23 
 
 		 387 aa  345  7e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2982  putative amidohydrolase family protein  48.19 
 
 		 389 aa  344  2e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2871  peptidase M20D, amidohydrolase  50.39 
 
 		 391 aa  343  2e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2343  peptidase M20D, amidohydrolase  48.83 
 
 		 386 aa  344  2e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0732987  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3565  peptidase M20D, amidohydrolase  49.22 
 
 		 390 aa  344  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  48.32 
 
 		 394 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  48.32 
 
 		 394 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  48.32 
 
 		 394 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2573  amidohydrolase  48.16 
 
 		 387 aa  343  4e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0165265  normal  0.498174 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  47.87 
 
 		 387 aa  343  4e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2611  amidohydrolase  48.45 
 
 		 391 aa  343  4e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  47.87 
 
 		 387 aa  343  4e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  47.87 
 
 		 387 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4256  amidohydrolase  49.08 
 
 		 392 aa  341  1e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.545833 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4062  amidohydrolase  48.03 
 
 		 387 aa  341  2e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2549  amidohydrolase  48.94 
 
 		 389 aa  341  2e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.475258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5569  amidohydrolase  50 
 
 		 401 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5364  putative amidohydrolase family protein  49.48 
 
 		 390 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00388806 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  47.35 
 
 		 390 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1161  amidohydrolase  48.45 
 
 		 386 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1298  peptidase M20D, amidohydrolase  48.06 
 
 		 394 aa  340  4e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3086  peptidase M20D, amidohydrolase  49.35 
 
 		 389 aa  339  4e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.985379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  46.13 
 
 		 397 aa  338  8e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2753  amidohydrolase  48.68 
 
 		 391 aa  338  8e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114457  normal  0.226959 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  47.75 
 
 		 387 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  48.81 
 
 		 394 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2037  M20/M25/M40 family peptidase  46.3 
 
 		 387 aa  337  1.9999999999999998e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.403946  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0901  amidohydrolase  46.3 
 
 		 387 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0718  peptidase M20D, amidohydrolase  44.99 
 
 		 390 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.178083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  47.55 
 
 		 394 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3872  hippurate hydrolase  46.56 
 
 		 387 aa  335  7.999999999999999e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1959  M20/M25/M40 family peptidase  46.03 
 
 		 387 aa  335  7.999999999999999e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0984  peptidase M20D, amidohydrolase  46.91 
 
 		 397 aa  335  7.999999999999999e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  48.15 
 
 		 387 aa  335  1e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2126  peptidase M20D, amidohydrolase  49.36 
 
 		 390 aa  335  1e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.587793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  47.09 
 
 		 387 aa  335  1e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  45.93 
 
 		 379 aa  335  1e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>