More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2476 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2476  amidohydrolase  100 
 
 		 398 aa  816    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.738512  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  51.36 
 
 		 403 aa  402  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5519  amidohydrolase  53.09 
 
 		 396 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.5258  normal  0.111633 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  49.63 
 
 		 398 aa  392  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  50.13 
 
 		 397 aa  391  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6067  amidohydrolase  51.85 
 
 		 395 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  49.12 
 
 		 404 aa  389  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6364  amidohydrolase  52.12 
 
 		 395 aa  391  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.557183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0444  amidohydrolase  50.78 
 
 		 401 aa  385  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186163  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  49.62 
 
 		 396 aa  384  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6670  amidohydrolase  50.26 
 
 		 395 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  49 
 
 		 397 aa  384  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6268  amidohydrolase  50.26 
 
 		 395 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.843577  normal  0.0558872 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  49.25 
 
 		 396 aa  385  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0453  amidohydrolase  50.52 
 
 		 401 aa  383  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6435  peptidase M20D, amidohydrolase  50.26 
 
 		 395 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  48.64 
 
 		 398 aa  381  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  50.66 
 
 		 389 aa  379  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  49 
 
 		 396 aa  381  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1248  amidohydrolase  51.31 
 
 		 425 aa  377  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.144528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  50.78 
 
 		 402 aa  375  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  48.39 
 
 		 423 aa  375  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  48.87 
 
 		 397 aa  378  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  47.87 
 
 		 396 aa  378  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0333  amidohydrolase  49.37 
 
 		 401 aa  374  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1132  amidohydrolase  52.42 
 
 		 402 aa  370  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  47.89 
 
 		 397 aa  367  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  47.85 
 
 		 389 aa  362  6e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  46.13 
 
 		 397 aa  360  2e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2466  amidohydrolase  50.38 
 
 		 390 aa  359  5e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.293537  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  48.73 
 
 		 388 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2533  peptidase M20D, amidohydrolase  49.12 
 
 		 397 aa  352  5e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030908 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2692  amidohydrolase  50.94 
 
 		 388 aa  349  5e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3314  amidohydrolase  48.57 
 
 		 390 aa  348  7e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5569  amidohydrolase  48.86 
 
 		 401 aa  348  1e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5843  amidohydrolase  48 
 
 		 396 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0069  peptidase M20D, amidohydrolase  49.87 
 
 		 384 aa  347  3e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.53846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2919  amidohydrolase  50.94 
 
 		 388 aa  345  1e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.068301  normal  0.124085 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5651  amidohydrolase  47.76 
 
 		 396 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.146235 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5626  amidohydrolase  47.39 
 
 		 399 aa  343  2e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.528848  normal  0.0552178 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  47.34 
 
 		 389 aa  343  2e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2611  amidohydrolase  48.42 
 
 		 391 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3715  peptidase M20D, amidohydrolase  47.76 
 
 		 415 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410848  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4653  amidohydrolase  47.76 
 
 		 415 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0295739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4012  amidohydrolase  47.91 
 
 		 392 aa  342  5e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873821 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  48.03 
 
 		 387 aa  342  5e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  48.03 
 
 		 390 aa  341  2e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  48.34 
 
 		 399 aa  340  2.9999999999999998e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2753  amidohydrolase  47.89 
 
 		 391 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114457  normal  0.226959 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  46.41 
 
 		 394 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  46.41 
 
 		 394 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  46.41 
 
 		 394 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2379  amidohydrolase  47.4 
 
 		 402 aa  339  5e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2175  peptidase M20D, amidohydrolase  48.46 
 
 		 396 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.20985 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1298  peptidase M20D, amidohydrolase  46.41 
 
 		 394 aa  338  7e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  46.15 
 
 		 396 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  47.46 
 
 		 395 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  46.15 
 
 		 396 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  46.15 
 
 		 396 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  46.15 
 
 		 396 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1245  hippurate hydolase  46.15 
 
 		 396 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689013  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  46.67 
 
 		 394 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  46.15 
 
 		 396 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  46.15 
 
 		 396 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  46.41 
 
 		 396 aa  334  1e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  47.51 
 
 		 387 aa  334  1e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2549  amidohydrolase  47.11 
 
 		 389 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.475258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  43.37 
 
 		 403 aa  333  2e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  45.64 
 
 		 394 aa  333  2e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  45.38 
 
 		 387 aa  333  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6019  amidohydrolase  46.68 
 
 		 389 aa  333  3e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2037  M20/M25/M40 family peptidase  48.82 
 
 		 387 aa  333  4e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.403946  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4433  amidohydrolase  45.38 
 
 		 394 aa  333  4e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0943  amidohydrolase  48.25 
 
 		 417 aa  333  4e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  48.95 
 
 		 384 aa  332  6e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1959  M20/M25/M40 family peptidase  48.82 
 
 		 387 aa  331  1e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5935  amidohydrolase  47.58 
 
 		 396 aa  332  1e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  46.58 
 
 		 387 aa  331  1e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  45.53 
 
 		 406 aa  331  1e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2598  peptidase M20D, amidohydrolase  48.07 
 
 		 396 aa  330  2e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.572475  normal  0.542589 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  46.72 
 
 		 390 aa  330  2e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4914  putative hydrolase  47 
 
 		 405 aa  330  3e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  45.12 
 
 		 387 aa  330  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4062  amidohydrolase  48.02 
 
 		 387 aa  329  5.0000000000000004e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  46.32 
 
 		 387 aa  329  6e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4586  putative amidohydrolase family protein  47.06 
 
 		 389 aa  328  8e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5250  amidohydrolase  47.72 
 
 		 396 aa  328  8e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  44.94 
 
 		 388 aa  328  8e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5374  amidohydrolase  47.19 
 
 		 399 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4896  amidohydrolase  47.18 
 
 		 396 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.873901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0901  amidohydrolase  47.77 
 
 		 387 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1216  amidohydrolase  45.95 
 
 		 386 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2992  peptidase M20D, amidohydrolase  47.19 
 
 		 399 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6319  amidohydrolase  48.95 
 
 		 373 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.834758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  44.68 
 
 		 388 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5628  amidohydrolase  46.75 
 
 		 394 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.509819  hitchhiker  0.00594833 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5231  peptidase M20D, amidohydrolase  46.75 
 
 		 394 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  45.55 
 
 		 388 aa  326  4.0000000000000003e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4601  amidohydrolase  47.01 
 
 		 394 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0856359  hitchhiker  0.00046008 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2815  amidohydrolase  50.13 
 
 		 390 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.575474  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>