More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4523 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_2379  amidohydrolase  80.36 
 
 
402 aa  644    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  100 
 
 
390 aa  788    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4012  amidohydrolase  79.49 
 
 
392 aa  634    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.873821 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  65.17 
 
 
387 aa  488  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  64.64 
 
 
387 aa  485  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  64.64 
 
 
387 aa  484  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  64.38 
 
 
387 aa  484  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  64.38 
 
 
387 aa  484  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  64.64 
 
 
387 aa  479  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  64.91 
 
 
387 aa  477  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  63.4 
 
 
390 aa  477  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  63.23 
 
 
387 aa  473  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  63.05 
 
 
396 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  63.05 
 
 
396 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  63.05 
 
 
396 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6019  amidohydrolase  63.71 
 
 
389 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  62.89 
 
 
396 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  61.7 
 
 
394 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  63.05 
 
 
396 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  63.05 
 
 
396 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1245  hippurate hydolase  63.05 
 
 
396 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689013  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  63.05 
 
 
396 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  60.93 
 
 
394 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  62.96 
 
 
387 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  63.12 
 
 
406 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4433  amidohydrolase  60.93 
 
 
394 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  60.15 
 
 
394 aa  461  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1298  peptidase M20D, amidohydrolase  60.41 
 
 
394 aa  462  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  60.15 
 
 
394 aa  461  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  60.47 
 
 
389 aa  464  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  60.15 
 
 
394 aa  461  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  58.46 
 
 
412 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4914  putative hydrolase  62.6 
 
 
405 aa  455  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  59.43 
 
 
395 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  60.88 
 
 
389 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4353  amidohydrolase  58.59 
 
 
399 aa  449  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.980853  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5140  amidohydrolase  63.45 
 
 
389 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.778625 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2753  amidohydrolase  61.92 
 
 
391 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114457  normal  0.226959 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2598  peptidase M20D, amidohydrolase  63.97 
 
 
396 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.572475  normal  0.542589 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6319  amidohydrolase  64.27 
 
 
373 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.834758  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2611  amidohydrolase  62.17 
 
 
391 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1291  peptidase M20D, amidohydrolase  61.4 
 
 
391 aa  442  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.214577  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  56.96 
 
 
399 aa  444  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4896  amidohydrolase  59.17 
 
 
396 aa  441  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.873901  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2992  peptidase M20D, amidohydrolase  59.17 
 
 
399 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5935  amidohydrolase  59.43 
 
 
396 aa  443  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5374  amidohydrolase  59.17 
 
 
399 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4721  amidohydrolase  59.17 
 
 
396 aa  442  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0252  peptidase M20D, amidohydrolase  58.66 
 
 
396 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24772  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5250  amidohydrolase  58.91 
 
 
396 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2175  peptidase M20D, amidohydrolase  59.43 
 
 
396 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.20985 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5133  amidohydrolase  60.67 
 
 
407 aa  437  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.519765  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4728  amidohydrolase  56.33 
 
 
393 aa  436  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.848291 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3769  amidohydrolase  59.89 
 
 
396 aa  434  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  56.85 
 
 
399 aa  434  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2549  amidohydrolase  60.1 
 
 
389 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.475258  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0948  peptidase M20D, amidohydrolase  59.07 
 
 
395 aa  430  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  55.94 
 
 
425 aa  429  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3289  peptidase M20D, amidohydrolase  57.88 
 
 
404 aa  427  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  54.69 
 
 
403 aa  426  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5896  amidohydrolase  60.53 
 
 
395 aa  428  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0480348 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5812  peptidase M20D, amidohydrolase  59.43 
 
 
394 aa  423  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.586057  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0051  peptidase M20D, amidohydrolase  56.46 
 
 
407 aa  419  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5516  amidohydrolase  59.38 
 
 
395 aa  418  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3600  peptidase M20D, amidohydrolase  59.38 
 
 
395 aa  418  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4767  amidohydrolase  59.38 
 
 
395 aa  418  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4507  hippurate hydrolase  55.93 
 
 
403 aa  415  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0151662 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1410  amidohydrolase  56.96 
 
 
404 aa  411  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.044641  normal  0.934375 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1452  amidohydrolase  57.11 
 
 
404 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.127453 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5222  hippurate hydrolase  57.69 
 
 
398 aa  410  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.22678 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  54.21 
 
 
388 aa  403  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  50.76 
 
 
396 aa  402  1e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0143  amidohydrolase  52.44 
 
 
385 aa  401  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5424  hippuricase  54.23 
 
 
388 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1494  hippurate hydrolase  59.17 
 
 
395 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213987  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  51.39 
 
 
397 aa  395  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  51.53 
 
 
396 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5220  amidohydrolase  51.68 
 
 
393 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1808  peptidase  59.17 
 
 
753 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5569  amidohydrolase  53.23 
 
 
401 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544377  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  51.39 
 
 
397 aa  395  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0378  amidohydrolase family protein  59.17 
 
 
395 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0476  amidohydrolase family protein  59.17 
 
 
395 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.504077  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0794  hippurate hydrolase  59.17 
 
 
395 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2111  hippurate hydrolase  59.17 
 
 
395 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.216397  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  52.04 
 
 
396 aa  394  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  51.53 
 
 
396 aa  392  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  49.49 
 
 
397 aa  389  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5419  peptidase, M20D subfamily  54.24 
 
 
393 aa  390  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.880964 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  50.51 
 
 
398 aa  390  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5405  amidohydrolase  51.68 
 
 
396 aa  391  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5843  amidohydrolase  52.04 
 
 
396 aa  391  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575611  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  48.98 
 
 
397 aa  385  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  49.37 
 
 
404 aa  386  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1248  amidohydrolase  49.87 
 
 
425 aa  386  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.144528  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5626  amidohydrolase  51.53 
 
 
399 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.528848  normal  0.0552178 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  48.98 
 
 
398 aa  387  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  50.51 
 
 
423 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  49.12 
 
 
402 aa  382  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  49.74 
 
 
397 aa  383  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>