More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5419 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5419  peptidase, M20D subfamily  100 
 
 		 393 aa  799    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.880964 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4507  hippurate hydrolase  58.16 
 
 		 403 aa  445  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0151662 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3289  peptidase M20D, amidohydrolase  58.38 
 
 		 404 aa  443  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1410  amidohydrolase  58.95 
 
 		 404 aa  442  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.044641  normal  0.934375 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1452  amidohydrolase  59.21 
 
 		 404 aa  441  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.127453 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2995  amidohydrolase  56.12 
 
 		 394 aa  435  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.505357  normal  0.131384 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  55.1 
 
 		 387 aa  428  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  54.08 
 
 		 390 aa  426  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  55.1 
 
 		 387 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  54.85 
 
 		 387 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  53.08 
 
 		 412 aa  424  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  54.85 
 
 		 387 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  54.85 
 
 		 387 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  54.59 
 
 		 387 aa  421  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  54.26 
 
 		 387 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  54.85 
 
 		 387 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  54.26 
 
 		 387 aa  414  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5812  peptidase M20D, amidohydrolase  57.85 
 
 		 394 aa  412  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.586057  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  54.85 
 
 		 394 aa  414  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  53.47 
 
 		 396 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  53.47 
 
 		 396 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  53.47 
 
 		 396 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  53.47 
 
 		 396 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  53.47 
 
 		 396 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  53.47 
 
 		 396 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1245  hippurate hydolase  53.47 
 
 		 396 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689013  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4433  amidohydrolase  53.59 
 
 		 394 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  52.55 
 
 		 396 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  54.24 
 
 		 390 aa  406  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  53.85 
 
 		 394 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  53.85 
 
 		 394 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  53.85 
 
 		 394 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  53.45 
 
 		 394 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3048  amidohydrolase  53.97 
 
 		 394 aa  401  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0406772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1298  peptidase M20D, amidohydrolase  53.85 
 
 		 394 aa  404  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3083  amidohydrolase  53.89 
 
 		 394 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.684536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2379  amidohydrolase  55.27 
 
 		 402 aa  400  9.999999999999999e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2704  M20/M25/M40 family peptidase  53.17 
 
 		 394 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.516059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4012  amidohydrolase  53.12 
 
 		 392 aa  392  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873821 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0948  peptidase M20D, amidohydrolase  53.61 
 
 		 395 aa  389  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  52.3 
 
 		 389 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5896  amidohydrolase  53.35 
 
 		 395 aa  386  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0480348 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5133  amidohydrolase  52.93 
 
 		 407 aa  383  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.519765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4914  putative hydrolase  53.09 
 
 		 405 aa  385  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  51.29 
 
 		 406 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6019  amidohydrolase  51.66 
 
 		 389 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4767  amidohydrolase  54.78 
 
 		 395 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  52.48 
 
 		 389 aa  377  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5516  amidohydrolase  54.78 
 
 		 395 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3600  peptidase M20D, amidohydrolase  54.78 
 
 		 395 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2611  amidohydrolase  51.3 
 
 		 391 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  50.13 
 
 		 395 aa  366  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4728  amidohydrolase  49.47 
 
 		 393 aa  365  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.848291 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2753  amidohydrolase  51.55 
 
 		 391 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114457  normal  0.226959 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5935  amidohydrolase  50.78 
 
 		 396 aa  364  1e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6319  amidohydrolase  54.03 
 
 		 373 aa  364  2e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.834758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2549  amidohydrolase  50.65 
 
 		 389 aa  362  6e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.475258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1291  peptidase M20D, amidohydrolase  50.39 
 
 		 391 aa  362  9e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.214577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5424  hippuricase  49.33 
 
 		 388 aa  362  9e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1302  amidohydrolase  52.15 
 
 		 409 aa  360  2e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.580399  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2175  peptidase M20D, amidohydrolase  50 
 
 		 396 aa  360  3e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.20985 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5140  amidohydrolase  51.66 
 
 		 389 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.778625 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2598  peptidase M20D, amidohydrolase  53.23 
 
 		 396 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.572475  normal  0.542589 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  47.44 
 
 		 398 aa  357  9.999999999999999e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  48.58 
 
 		 388 aa  356  2.9999999999999997e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3769  amidohydrolase  50.26 
 
 		 396 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5250  amidohydrolase  50.66 
 
 		 396 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  46.94 
 
 		 397 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4721  amidohydrolase  50.66 
 
 		 396 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5374  amidohydrolase  50.66 
 
 		 399 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4896  amidohydrolase  50.66 
 
 		 396 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.873901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2992  peptidase M20D, amidohydrolase  50.66 
 
 		 399 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  49.07 
 
 		 425 aa  355  6.999999999999999e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  48.72 
 
 		 399 aa  354  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  47.57 
 
 		 396 aa  353  2e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5222  hippurate hydrolase  51.46 
 
 		 398 aa  352  5e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.22678 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0252  peptidase M20D, amidohydrolase  49.61 
 
 		 396 aa  350  3e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24772  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5405  amidohydrolase  49.47 
 
 		 396 aa  348  7e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  47.69 
 
 		 397 aa  347  3e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  49.73 
 
 		 399 aa  345  5e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  46.31 
 
 		 404 aa  343  2.9999999999999997e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  44.76 
 
 		 402 aa  341  2e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5569  amidohydrolase  47.26 
 
 		 401 aa  339  4e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1808  peptidase  51.2 
 
 		 753 aa  339  4e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0444  amidohydrolase  45.55 
 
 		 401 aa  339  5.9999999999999996e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186163  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2111  hippurate hydrolase  50.53 
 
 		 395 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.216397  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1494  hippurate hydrolase  50.53 
 
 		 395 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213987  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0794  hippurate hydrolase  50.53 
 
 		 395 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0378  amidohydrolase family protein  50.53 
 
 		 395 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4353  amidohydrolase  46.74 
 
 		 399 aa  338  9.999999999999999e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.980853  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  46.41 
 
 		 397 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0476  amidohydrolase family protein  50.53 
 
 		 395 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.504077  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0453  amidohydrolase  45.29 
 
 		 401 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  48 
 
 		 403 aa  337  2.9999999999999997e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  48.13 
 
 		 379 aa  336  2.9999999999999997e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2533  peptidase M20D, amidohydrolase  48.31 
 
 		 397 aa  334  1e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030908 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5220  amidohydrolase  45.83 
 
 		 393 aa  334  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  44.88 
 
 		 397 aa  333  3e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1248  amidohydrolase  44.81 
 
 		 425 aa  333  4e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.144528  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0333  amidohydrolase  44.87 
 
 		 401 aa  333  4e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>