More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5896 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5516  amidohydrolase  85.2 
 
 		 395 aa  634    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0948  peptidase M20D, amidohydrolase  96.19 
 
 		 395 aa  748    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3600  peptidase M20D, amidohydrolase  85.2 
 
 		 395 aa  634    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5896  amidohydrolase  100 
 
 		 395 aa  805    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0480348 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4767  amidohydrolase  85.2 
 
 		 395 aa  634    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5812  peptidase M20D, amidohydrolase  61.07 
 
 		 394 aa  450  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.586057  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  58.61 
 
 		 390 aa  448  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4012  amidohydrolase  58.61 
 
 		 392 aa  442  1e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873821 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  58.4 
 
 		 387 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  59.73 
 
 		 387 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  58.4 
 
 		 387 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  58.62 
 
 		 387 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2379  amidohydrolase  58.27 
 
 		 402 aa  434  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  58.36 
 
 		 387 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  58.36 
 
 		 387 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  54.9 
 
 		 412 aa  428  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  56.66 
 
 		 387 aa  429  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  57.14 
 
 		 387 aa  426  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  56.92 
 
 		 387 aa  427  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  55.53 
 
 		 390 aa  425  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  54.52 
 
 		 396 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  54.52 
 
 		 396 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  54.52 
 
 		 396 aa  420  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  54.52 
 
 		 396 aa  420  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  54.52 
 
 		 394 aa  419  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  55.04 
 
 		 396 aa  420  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  54.52 
 
 		 396 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  54.52 
 
 		 396 aa  420  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1245  hippurate hydolase  54.52 
 
 		 396 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689013  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1298  peptidase M20D, amidohydrolase  52.79 
 
 		 394 aa  412  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4433  amidohydrolase  52.54 
 
 		 394 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  52.54 
 
 		 394 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  53.52 
 
 		 388 aa  412  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  52.54 
 
 		 394 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  52.54 
 
 		 394 aa  413  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  54.12 
 
 		 406 aa  413  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  52.54 
 
 		 394 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3289  peptidase M20D, amidohydrolase  55.08 
 
 		 404 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  55.84 
 
 		 389 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  53.74 
 
 		 379 aa  404  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6019  amidohydrolase  55.44 
 
 		 389 aa  401  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  55.06 
 
 		 389 aa  404  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2549  amidohydrolase  54.55 
 
 		 389 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.475258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4914  putative hydrolase  53.87 
 
 		 405 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4507  hippurate hydrolase  55.08 
 
 		 403 aa  398  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0151662 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  52.67 
 
 		 395 aa  395  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1291  peptidase M20D, amidohydrolase  54.26 
 
 		 391 aa  397  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.214577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5133  amidohydrolase  55.38 
 
 		 407 aa  392  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.519765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2753  amidohydrolase  53.45 
 
 		 391 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114457  normal  0.226959 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  53.02 
 
 		 425 aa  393  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2611  amidohydrolase  53.2 
 
 		 391 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1410  amidohydrolase  55.08 
 
 		 404 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.044641  normal  0.934375 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2598  peptidase M20D, amidohydrolase  55.7 
 
 		 396 aa  389  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.572475  normal  0.542589 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1452  amidohydrolase  55.08 
 
 		 404 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.127453 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  53.68 
 
 		 399 aa  388  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5419  peptidase, M20D subfamily  53.35 
 
 		 393 aa  387  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.880964 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3769  amidohydrolase  52.96 
 
 		 396 aa  383  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4896  amidohydrolase  54.16 
 
 		 396 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.873901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4728  amidohydrolase  51.05 
 
 		 393 aa  384  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.848291 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6319  amidohydrolase  55.88 
 
 		 373 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.834758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5250  amidohydrolase  53.89 
 
 		 396 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0252  peptidase M20D, amidohydrolase  54.16 
 
 		 396 aa  380  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4353  amidohydrolase  52.24 
 
 		 399 aa  379  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.980853  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  48.47 
 
 		 397 aa  380  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2992  peptidase M20D, amidohydrolase  53.89 
 
 		 399 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5374  amidohydrolase  53.89 
 
 		 399 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  48.21 
 
 		 397 aa  375  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5140  amidohydrolase  55.44 
 
 		 389 aa  376  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.778625 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5569  amidohydrolase  49.87 
 
 		 401 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5073  amidohydrolase  51.77 
 
 		 387 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.546308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4721  amidohydrolase  51.91 
 
 		 396 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  49.87 
 
 		 399 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5220  amidohydrolase  49.36 
 
 		 393 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2175  peptidase M20D, amidohydrolase  51.65 
 
 		 396 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.20985 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5935  amidohydrolase  50.89 
 
 		 396 aa  371  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2995  amidohydrolase  51.06 
 
 		 394 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.505357  normal  0.131384 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  47.7 
 
 		 396 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5424  hippuricase  49.09 
 
 		 388 aa  368  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5405  amidohydrolase  48.48 
 
 		 396 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5626  amidohydrolase  50.39 
 
 		 399 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.528848  normal  0.0552178 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3715  peptidase M20D, amidohydrolase  50.66 
 
 		 415 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410848  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5651  amidohydrolase  50.66 
 
 		 396 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.146235 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5843  amidohydrolase  50.13 
 
 		 396 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4653  amidohydrolase  50.66 
 
 		 415 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0295739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  51.94 
 
 		 388 aa  363  2e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0051  peptidase M20D, amidohydrolase  51.3 
 
 		 407 aa  363  3e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  47.74 
 
 		 396 aa  362  7.0000000000000005e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  47.45 
 
 		 396 aa  361  1e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  47.57 
 
 		 403 aa  360  3e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5222  hippurate hydrolase  53.99 
 
 		 398 aa  359  5e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.22678 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  50 
 
 		 388 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1302  amidohydrolase  52.85 
 
 		 409 aa  357  9.999999999999999e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.580399  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  49.21 
 
 		 388 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1004  hippurate hydrolase  47.55 
 
 		 383 aa  357  1.9999999999999998e-97  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0794  hippurate hydrolase  53.94 
 
 		 395 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0378  amidohydrolase family protein  53.94 
 
 		 395 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1494  hippurate hydrolase  53.94 
 
 		 395 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213987  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2111  hippurate hydrolase  53.94 
 
 		 395 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.216397  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0476  amidohydrolase family protein  53.94 
 
 		 395 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.504077  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1067  hippurate hydrolase  47.55 
 
 		 383 aa  354  1e-96  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.956056  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>