More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6319 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_5140  amidohydrolase  90.08 
 
 		 389 aa  655    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.778625 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2598  peptidase M20D, amidohydrolase  93.57 
 
 		 396 aa  676    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.572475  normal  0.542589 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6019  amidohydrolase  97.86 
 
 		 389 aa  733    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6319  amidohydrolase  100 
 
 		 373 aa  753    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.834758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  70.51 
 
 		 389 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  68.55 
 
 		 389 aa  527  1e-148  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  69.17 
 
 		 387 aa  519  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  69.17 
 
 		 387 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  68.9 
 
 		 387 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  68.9 
 
 		 387 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  68.9 
 
 		 387 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  68.36 
 
 		 387 aa  513  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  68.36 
 
 		 387 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  65.95 
 
 		 387 aa  503  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  65.78 
 
 		 390 aa  503  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  65.68 
 
 		 387 aa  499  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  64.27 
 
 		 390 aa  469  1.0000000000000001e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5133  amidohydrolase  64.29 
 
 		 407 aa  462  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.519765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2379  amidohydrolase  61.84 
 
 		 402 aa  458  9.999999999999999e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  60.05 
 
 		 399 aa  455  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4012  amidohydrolase  61.33 
 
 		 392 aa  454  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873821 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  60.8 
 
 		 394 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1298  peptidase M20D, amidohydrolase  60.8 
 
 		 394 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  60.8 
 
 		 394 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  60.8 
 
 		 394 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  61.33 
 
 		 394 aa  449  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4433  amidohydrolase  60.8 
 
 		 394 aa  450  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  57.75 
 
 		 403 aa  450  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  60.86 
 
 		 395 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4353  amidohydrolase  58.71 
 
 		 399 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.980853  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  60.53 
 
 		 394 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1245  hippurate hydolase  60.53 
 
 		 396 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689013  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  60.53 
 
 		 396 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  60.53 
 
 		 396 aa  444  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  60.53 
 
 		 396 aa  444  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  60.27 
 
 		 396 aa  443  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  60.53 
 
 		 396 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  60.53 
 
 		 396 aa  444  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  60.53 
 
 		 396 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4896  amidohydrolase  60.22 
 
 		 396 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.873901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4728  amidohydrolase  58.4 
 
 		 393 aa  428  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.848291 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4721  amidohydrolase  60.22 
 
 		 396 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5935  amidohydrolase  59.95 
 
 		 396 aa  430  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0252  peptidase M20D, amidohydrolase  59.95 
 
 		 396 aa  427  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2753  amidohydrolase  60.75 
 
 		 391 aa  424  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114457  normal  0.226959 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2992  peptidase M20D, amidohydrolase  59.95 
 
 		 399 aa  428  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  56.15 
 
 		 388 aa  426  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5250  amidohydrolase  59.95 
 
 		 396 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5374  amidohydrolase  59.95 
 
 		 399 aa  428  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2611  amidohydrolase  60.48 
 
 		 391 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  56.68 
 
 		 412 aa  422  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2175  peptidase M20D, amidohydrolase  58.87 
 
 		 396 aa  422  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.20985 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2549  amidohydrolase  59.84 
 
 		 389 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.475258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3769  amidohydrolase  58.6 
 
 		 396 aa  421  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  57.37 
 
 		 425 aa  419  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1291  peptidase M20D, amidohydrolase  59.84 
 
 		 391 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.214577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  58.87 
 
 		 406 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  54.42 
 
 		 379 aa  410  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  57.6 
 
 		 399 aa  409  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5569  amidohydrolase  55.47 
 
 		 401 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5424  hippuricase  55.38 
 
 		 388 aa  402  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4914  putative hydrolase  59.3 
 
 		 405 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5222  hippurate hydrolase  58.24 
 
 		 398 aa  396  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.22678 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0051  peptidase M20D, amidohydrolase  56.42 
 
 		 407 aa  394  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1698  amidohydrolase  56.52 
 
 		 406 aa  392  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.31217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  50.26 
 
 		 396 aa  384  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1494  hippurate hydrolase  60.59 
 
 		 395 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213987  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3289  peptidase M20D, amidohydrolase  54.52 
 
 		 404 aa  384  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1808  peptidase  60.59 
 
 		 753 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0794  hippurate hydrolase  60.59 
 
 		 395 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  51.19 
 
 		 396 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1302  amidohydrolase  55.15 
 
 		 409 aa  383  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.580399  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0476  amidohydrolase family protein  60.48 
 
 		 395 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.504077  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0378  amidohydrolase family protein  60.59 
 
 		 395 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2111  hippurate hydrolase  60.59 
 
 		 395 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.216397  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  51.45 
 
 		 396 aa  379  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0948  peptidase M20D, amidohydrolase  55.61 
 
 		 395 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5220  amidohydrolase  52.37 
 
 		 393 aa  378  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  50.92 
 
 		 397 aa  380  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5896  amidohydrolase  55.88 
 
 		 395 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0480348 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  50.66 
 
 		 396 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5405  amidohydrolase  52.27 
 
 		 396 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1410  amidohydrolase  54.67 
 
 		 404 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.044641  normal  0.934375 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  48.94 
 
 		 397 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  48.42 
 
 		 402 aa  369  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  49.08 
 
 		 398 aa  371  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  49.34 
 
 		 397 aa  368  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4507  hippurate hydrolase  53.33 
 
 		 403 aa  370  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0151662 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1452  amidohydrolase  54.52 
 
 		 404 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.127453 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  48.56 
 
 		 404 aa  369  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5812  peptidase M20D, amidohydrolase  56.42 
 
 		 394 aa  365  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.586057  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  48.95 
 
 		 398 aa  367  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2533  peptidase M20D, amidohydrolase  51.98 
 
 		 397 aa  368  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030908 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5419  peptidase, M20D subfamily  54.03 
 
 		 393 aa  366  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.880964 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  48.28 
 
 		 423 aa  364  1e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4767  amidohydrolase  54.28 
 
 		 395 aa  361  1e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3600  peptidase M20D, amidohydrolase  54.28 
 
 		 395 aa  361  1e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5516  amidohydrolase  54.28 
 
 		 395 aa  361  1e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0453  amidohydrolase  47.12 
 
 		 401 aa  360  2e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5073  amidohydrolase  51.21 
 
 		 387 aa  360  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.546308  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>