More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5935 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  85.17 
 
 		 395 aa  703    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4896  amidohydrolase  86.87 
 
 		 396 aa  703    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.873901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0252  peptidase M20D, amidohydrolase  85.35 
 
 		 396 aa  694    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5935  amidohydrolase  100 
 
 		 396 aa  813    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2175  peptidase M20D, amidohydrolase  96.72 
 
 		 396 aa  775    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.20985 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3769  amidohydrolase  84.09 
 
 		 396 aa  689    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5250  amidohydrolase  85.86 
 
 		 396 aa  696    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2992  peptidase M20D, amidohydrolase  87.72 
 
 		 399 aa  701    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5374  amidohydrolase  87.72 
 
 		 399 aa  701    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4721  amidohydrolase  85.35 
 
 		 396 aa  695    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2111  hippurate hydrolase  80.87 
 
 		 395 aa  610  1e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.216397  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1494  hippurate hydrolase  80.87 
 
 		 395 aa  610  1e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213987  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1808  peptidase  80.61 
 
 		 753 aa  609  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0378  amidohydrolase family protein  80.87 
 
 		 395 aa  610  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0794  hippurate hydrolase  80.87 
 
 		 395 aa  610  1e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0476  amidohydrolase family protein  81.28 
 
 		 395 aa  608  1e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.504077  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4728  amidohydrolase  63.59 
 
 		 393 aa  515  1.0000000000000001e-145  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.848291 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  62.89 
 
 		 425 aa  512  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5569  amidohydrolase  61.34 
 
 		 401 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0051  peptidase M20D, amidohydrolase  62.66 
 
 		 407 aa  491  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  61.34 
 
 		 399 aa  494  9.999999999999999e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5222  hippurate hydrolase  62.02 
 
 		 398 aa  487  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.22678 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5405  amidohydrolase  59.28 
 
 		 396 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5220  amidohydrolase  57.95 
 
 		 393 aa  462  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  59.43 
 
 		 390 aa  452  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4012  amidohydrolase  58.1 
 
 		 392 aa  448  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873821 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  57.67 
 
 		 387 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  57.41 
 
 		 387 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  58.47 
 
 		 387 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  57.67 
 
 		 387 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  58.64 
 
 		 387 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  58.47 
 
 		 387 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  56.99 
 
 		 396 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  56.99 
 
 		 396 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  56.99 
 
 		 396 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  56.99 
 
 		 396 aa  443  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  58.73 
 
 		 387 aa  443  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  57.25 
 
 		 396 aa  444  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  57.94 
 
 		 387 aa  444  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  56.99 
 
 		 396 aa  443  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  56.99 
 
 		 396 aa  443  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1245  hippurate hydolase  56.99 
 
 		 396 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689013  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2379  amidohydrolase  58.99 
 
 		 402 aa  444  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  56.54 
 
 		 390 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  56.51 
 
 		 389 aa  437  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  57.4 
 
 		 406 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  56.1 
 
 		 389 aa  434  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  55.18 
 
 		 394 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  55.96 
 
 		 394 aa  432  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6019  amidohydrolase  59.41 
 
 		 389 aa  434  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  56.02 
 
 		 387 aa  431  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  55.18 
 
 		 394 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  55.18 
 
 		 394 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  55.18 
 
 		 394 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4433  amidohydrolase  55.18 
 
 		 394 aa  430  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  56.42 
 
 		 412 aa  428  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5133  amidohydrolase  57.98 
 
 		 407 aa  429  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.519765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1298  peptidase M20D, amidohydrolase  55.18 
 
 		 394 aa  431  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4914  putative hydrolase  57.66 
 
 		 405 aa  431  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6319  amidohydrolase  59.95 
 
 		 373 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.834758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5140  amidohydrolase  59.95 
 
 		 389 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.778625 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2549  amidohydrolase  57.85 
 
 		 389 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.475258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1291  peptidase M20D, amidohydrolase  58.38 
 
 		 391 aa  412  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.214577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5424  hippuricase  54.88 
 
 		 388 aa  412  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  55.23 
 
 		 379 aa  412  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2611  amidohydrolase  57.59 
 
 		 391 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  54.86 
 
 		 388 aa  414  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2753  amidohydrolase  58.2 
 
 		 391 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114457  normal  0.226959 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2598  peptidase M20D, amidohydrolase  59.41 
 
 		 396 aa  410  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.572475  normal  0.542589 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4353  amidohydrolase  55.61 
 
 		 399 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.980853  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1302  amidohydrolase  54.96 
 
 		 409 aa  402  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.580399  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  53.49 
 
 		 399 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  51.91 
 
 		 396 aa  392  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3289  peptidase M20D, amidohydrolase  55.26 
 
 		 404 aa  390  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0143  amidohydrolase  50.9 
 
 		 385 aa  389  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  51.39 
 
 		 396 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  53.23 
 
 		 403 aa  387  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  51.39 
 
 		 396 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  49.62 
 
 		 397 aa  382  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4507  hippurate hydrolase  53.42 
 
 		 403 aa  384  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0151662 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1410  amidohydrolase  54.47 
 
 		 404 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.044641  normal  0.934375 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  48.1 
 
 		 398 aa  378  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  49.11 
 
 		 397 aa  380  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2229  amidohydrolase  50.75 
 
 		 395 aa  378  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1452  amidohydrolase  54.47 
 
 		 404 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.127453 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  48.68 
 
 		 397 aa  368  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0333  amidohydrolase  47.59 
 
 		 401 aa  370  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  48.1 
 
 		 396 aa  371  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4873  amidohydrolase  49.87 
 
 		 389 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.458115 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5843  amidohydrolase  48.86 
 
 		 396 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4653  amidohydrolase  48.39 
 
 		 415 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0295739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5626  amidohydrolase  49.11 
 
 		 399 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.528848  normal  0.0552178 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  47.49 
 
 		 404 aa  368  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3715  peptidase M20D, amidohydrolase  48.39 
 
 		 415 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410848  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5812  peptidase M20D, amidohydrolase  55.23 
 
 		 394 aa  365  1e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.586057  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  48.09 
 
 		 397 aa  364  1e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  48.42 
 
 		 397 aa  364  1e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  51.2 
 
 		 388 aa  363  3e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5651  amidohydrolase  48.86 
 
 		 396 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.146235 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  49.87 
 
 		 388 aa  362  8e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>