More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0051 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A0051  peptidase M20D, amidohydrolase  100 
 
 
407 aa  835    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  77.83 
 
 
425 aa  683    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4728  amidohydrolase  66.15 
 
 
393 aa  555  1e-157  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.848291 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  62.92 
 
 
395 aa  511  1e-144  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3769  amidohydrolase  63.43 
 
 
396 aa  508  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5935  amidohydrolase  62.66 
 
 
396 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4896  amidohydrolase  62.66 
 
 
396 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.873901  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0252  peptidase M20D, amidohydrolase  62.92 
 
 
396 aa  502  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24772  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2175  peptidase M20D, amidohydrolase  62.66 
 
 
396 aa  503  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.20985 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5374  amidohydrolase  62.4 
 
 
399 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5250  amidohydrolase  62.4 
 
 
396 aa  501  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2992  peptidase M20D, amidohydrolase  62.4 
 
 
399 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4721  amidohydrolase  62.15 
 
 
396 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5220  amidohydrolase  60.51 
 
 
393 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5405  amidohydrolase  58.31 
 
 
396 aa  475  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0378  amidohydrolase family protein  63.43 
 
 
395 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1494  hippurate hydrolase  63.43 
 
 
395 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213987  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1808  peptidase  63.43 
 
 
753 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0476  amidohydrolase family protein  63.17 
 
 
395 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.504077  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2111  hippurate hydrolase  63.43 
 
 
395 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.216397  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0794  hippurate hydrolase  63.43 
 
 
395 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5222  hippurate hydrolase  60.21 
 
 
398 aa  451  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.22678 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5569  amidohydrolase  57.82 
 
 
401 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544377  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  58.53 
 
 
399 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  56.46 
 
 
390 aa  440  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  54.91 
 
 
387 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  55.17 
 
 
387 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  54.91 
 
 
387 aa  438  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  54.91 
 
 
387 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  54.91 
 
 
387 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  57.18 
 
 
403 aa  437  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  55.29 
 
 
389 aa  433  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  56.12 
 
 
406 aa  432  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  54.91 
 
 
387 aa  429  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4353  amidohydrolase  57.33 
 
 
399 aa  428  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.980853  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2379  amidohydrolase  54.71 
 
 
402 aa  427  1e-118  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  53.68 
 
 
387 aa  426  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  54.64 
 
 
387 aa  428  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  54.76 
 
 
394 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  54.76 
 
 
394 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  54.76 
 
 
394 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  54.5 
 
 
396 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  54.5 
 
 
396 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1245  hippurate hydolase  54.5 
 
 
396 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689013  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  54.5 
 
 
396 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1298  peptidase M20D, amidohydrolase  54.5 
 
 
394 aa  423  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  54.5 
 
 
396 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  54.5 
 
 
396 aa  424  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  54.5 
 
 
396 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  53.83 
 
 
390 aa  423  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  54.5 
 
 
396 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  54.23 
 
 
394 aa  423  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  55.17 
 
 
412 aa  419  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4012  amidohydrolase  54.64 
 
 
392 aa  421  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.873821 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  54.11 
 
 
387 aa  421  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4433  amidohydrolase  53.97 
 
 
394 aa  421  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  55.2 
 
 
399 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  54.23 
 
 
394 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2753  amidohydrolase  53.45 
 
 
391 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114457  normal  0.226959 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4914  putative hydrolase  55.2 
 
 
405 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2611  amidohydrolase  54.35 
 
 
391 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2549  amidohydrolase  53.52 
 
 
389 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.475258  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6019  amidohydrolase  55.44 
 
 
389 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  54.09 
 
 
389 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  53.7 
 
 
388 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1291  peptidase M20D, amidohydrolase  54.23 
 
 
391 aa  404  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.214577  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5133  amidohydrolase  54.43 
 
 
407 aa  402  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.519765  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5424  hippuricase  53.68 
 
 
388 aa  404  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  52.69 
 
 
379 aa  394  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6319  amidohydrolase  56.42 
 
 
373 aa  395  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.834758  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  47.53 
 
 
398 aa  390  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  50.25 
 
 
396 aa  386  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2598  peptidase M20D, amidohydrolase  55.17 
 
 
396 aa  386  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.572475  normal  0.542589 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5140  amidohydrolase  55.44 
 
 
389 aa  387  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.778625 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  47.46 
 
 
397 aa  384  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  49.36 
 
 
396 aa  383  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  47.09 
 
 
397 aa  380  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1302  amidohydrolase  51.63 
 
 
409 aa  379  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.580399  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  47.72 
 
 
397 aa  378  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  48.84 
 
 
396 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5812  peptidase M20D, amidohydrolase  53.85 
 
 
394 aa  375  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.586057  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1698  amidohydrolase  54.2 
 
 
406 aa  373  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.31217  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  47.09 
 
 
396 aa  373  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  49.47 
 
 
389 aa  370  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3289  peptidase M20D, amidohydrolase  52 
 
 
404 aa  371  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2533  peptidase M20D, amidohydrolase  49.36 
 
 
397 aa  368  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0030908 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3715  peptidase M20D, amidohydrolase  48.18 
 
 
415 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410848  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  47.42 
 
 
404 aa  370  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4653  amidohydrolase  48.18 
 
 
415 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0295739  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  46.37 
 
 
398 aa  365  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5651  amidohydrolase  49.87 
 
 
396 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.146235 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  46.21 
 
 
397 aa  368  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1410  amidohydrolase  51.87 
 
 
404 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.044641  normal  0.934375 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4507  hippurate hydrolase  51.87 
 
 
403 aa  367  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0151662 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5843  amidohydrolase  49.1 
 
 
396 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575611  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2229  amidohydrolase  51.06 
 
 
395 aa  364  1e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  50.26 
 
 
388 aa  364  2e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  45.85 
 
 
423 aa  363  3e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1452  amidohydrolase  51.47 
 
 
404 aa  363  4e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.127453 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  47.03 
 
 
403 aa  362  7.0000000000000005e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.824493 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>