More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6019 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6019  amidohydrolase  100 
 
 		 389 aa  786    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2598  peptidase M20D, amidohydrolase  91.26 
 
 		 396 aa  688    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.572475  normal  0.542589 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5140  amidohydrolase  89.2 
 
 		 389 aa  682    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.778625 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6319  amidohydrolase  97.86 
 
 		 373 aa  712    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.834758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  68.12 
 
 		 389 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  66.24 
 
 		 389 aa  526  1e-148  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  67.87 
 
 		 387 aa  521  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  68.6 
 
 		 387 aa  521  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  68.6 
 
 		 387 aa  521  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  66.84 
 
 		 387 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  66.84 
 
 		 387 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  67.1 
 
 		 387 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  65.36 
 
 		 387 aa  510  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  64.1 
 
 		 390 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  66.32 
 
 		 387 aa  503  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  64.84 
 
 		 387 aa  503  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  63.71 
 
 		 390 aa  471  1.0000000000000001e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5133  amidohydrolase  62.79 
 
 		 407 aa  465  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.519765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  59.38 
 
 		 399 aa  462  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2379  amidohydrolase  61.94 
 
 		 402 aa  461  1e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  59.84 
 
 		 394 aa  455  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  59.84 
 
 		 394 aa  455  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  59.84 
 
 		 394 aa  455  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1298  peptidase M20D, amidohydrolase  59.84 
 
 		 394 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4012  amidohydrolase  61.33 
 
 		 392 aa  453  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873821 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4433  amidohydrolase  59.59 
 
 		 394 aa  451  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  56.74 
 
 		 403 aa  451  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  60.36 
 
 		 394 aa  451  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4353  amidohydrolase  58.16 
 
 		 399 aa  449  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.980853  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1245  hippurate hydolase  59.59 
 
 		 396 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689013  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  59.59 
 
 		 396 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  59.59 
 
 		 396 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  59.59 
 
 		 396 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  59.59 
 
 		 396 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  59.33 
 
 		 396 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  59.59 
 
 		 396 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  59.59 
 
 		 396 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  59.33 
 
 		 394 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  60.32 
 
 		 395 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5935  amidohydrolase  59.41 
 
 		 396 aa  424  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5374  amidohydrolase  59.41 
 
 		 399 aa  421  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2992  peptidase M20D, amidohydrolase  59.41 
 
 		 399 aa  421  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4896  amidohydrolase  59.68 
 
 		 396 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.873901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4728  amidohydrolase  57.26 
 
 		 393 aa  421  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.848291 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4721  amidohydrolase  59.68 
 
 		 396 aa  423  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  55.73 
 
 		 388 aa  419  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0252  peptidase M20D, amidohydrolase  59.41 
 
 		 396 aa  421  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2753  amidohydrolase  59.26 
 
 		 391 aa  418  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114457  normal  0.226959 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5250  amidohydrolase  59.41 
 
 		 396 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  54.52 
 
 		 412 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3769  amidohydrolase  56.74 
 
 		 396 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2611  amidohydrolase  58.44 
 
 		 391 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2175  peptidase M20D, amidohydrolase  58.33 
 
 		 396 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.20985 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2549  amidohydrolase  58.36 
 
 		 389 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.475258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1291  peptidase M20D, amidohydrolase  58.36 
 
 		 391 aa  411  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.214577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  57.67 
 
 		 406 aa  411  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  56.4 
 
 		 399 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  54.01 
 
 		 379 aa  405  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  55.97 
 
 		 425 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5569  amidohydrolase  54.05 
 
 		 401 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5424  hippuricase  54.62 
 
 		 388 aa  403  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5222  hippurate hydrolase  57.14 
 
 		 398 aa  399  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.22678 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4914  putative hydrolase  58.29 
 
 		 405 aa  396  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0051  peptidase M20D, amidohydrolase  55.44 
 
 		 407 aa  392  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1698  amidohydrolase  55.98 
 
 		 406 aa  393  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.31217  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1494  hippurate hydrolase  58.33 
 
 		 395 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213987  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  50.13 
 
 		 396 aa  388  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2111  hippurate hydrolase  58.33 
 
 		 395 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.216397  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1808  peptidase  58.33 
 
 		 753 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0794  hippurate hydrolase  58.33 
 
 		 395 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0378  amidohydrolase family protein  58.33 
 
 		 395 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1302  amidohydrolase  55.27 
 
 		 409 aa  386  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.580399  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  49.62 
 
 		 396 aa  383  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  49.23 
 
 		 396 aa  383  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0476  amidohydrolase family protein  58.22 
 
 		 395 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.504077  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  50.13 
 
 		 396 aa  380  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0948  peptidase M20D, amidohydrolase  55.17 
 
 		 395 aa  380  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  49.24 
 
 		 397 aa  380  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5896  amidohydrolase  55.44 
 
 		 395 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0480348 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5405  amidohydrolase  51.44 
 
 		 396 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3289  peptidase M20D, amidohydrolase  52.73 
 
 		 404 aa  376  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  47.97 
 
 		 398 aa  376  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5220  amidohydrolase  51.7 
 
 		 393 aa  371  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  47.33 
 
 		 397 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2533  peptidase M20D, amidohydrolase  50.77 
 
 		 397 aa  370  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030908 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  47.21 
 
 		 423 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  47.97 
 
 		 397 aa  370  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1452  amidohydrolase  53.49 
 
 		 404 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.127453 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5812  peptidase M20D, amidohydrolase  55.04 
 
 		 394 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.586057  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1410  amidohydrolase  53.63 
 
 		 404 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.044641  normal  0.934375 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5419  peptidase, M20D subfamily  51.66 
 
 		 393 aa  365  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.880964 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4507  hippurate hydrolase  52.07 
 
 		 403 aa  363  2e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0151662 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4767  amidohydrolase  53.09 
 
 		 395 aa  363  3e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5516  amidohydrolase  53.09 
 
 		 395 aa  363  3e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3600  peptidase M20D, amidohydrolase  53.09 
 
 		 395 aa  363  3e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5073  amidohydrolase  50.26 
 
 		 387 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.546308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  48.04 
 
 		 404 aa  362  8e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  47.89 
 
 		 402 aa  361  1e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  48.42 
 
 		 398 aa  359  6e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4367  amidohydrolase  53.87 
 
 		 388 aa  359  6e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>