More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5516 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_4767  amidohydrolase  100 
 
 		 395 aa  793    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0948  peptidase M20D, amidohydrolase  84.18 
 
 		 395 aa  649    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5516  amidohydrolase  100 
 
 		 395 aa  793    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3600  peptidase M20D, amidohydrolase  100 
 
 		 395 aa  793    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5896  amidohydrolase  85.2 
 
 		 395 aa  657    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0480348 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  59.38 
 
 		 390 aa  457  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5812  peptidase M20D, amidohydrolase  63.37 
 
 		 394 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.586057  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4012  amidohydrolase  60 
 
 		 392 aa  454  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873821 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  58.22 
 
 		 387 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  57.18 
 
 		 390 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  56.14 
 
 		 387 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2379  amidohydrolase  58.35 
 
 		 402 aa  436  1e-121  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  56.5 
 
 		 387 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  56.5 
 
 		 387 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  56.5 
 
 		 387 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  57.03 
 
 		 387 aa  432  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  55.7 
 
 		 387 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  55.44 
 
 		 387 aa  430  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  55.44 
 
 		 396 aa  424  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  55.27 
 
 		 412 aa  427  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1245  hippurate hydolase  55.44 
 
 		 396 aa  424  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689013  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  55.7 
 
 		 387 aa  427  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  55.44 
 
 		 396 aa  424  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  55.1 
 
 		 394 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  55.44 
 
 		 396 aa  424  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  55.36 
 
 		 394 aa  427  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  55.1 
 
 		 394 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  55.1 
 
 		 394 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  55.44 
 
 		 396 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  55.44 
 
 		 396 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1298  peptidase M20D, amidohydrolase  54.59 
 
 		 394 aa  422  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  55.7 
 
 		 396 aa  421  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  55.44 
 
 		 396 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  54.34 
 
 		 394 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4433  amidohydrolase  54.08 
 
 		 394 aa  421  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  55.09 
 
 		 388 aa  415  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  55.18 
 
 		 389 aa  414  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  55.27 
 
 		 389 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3289  peptidase M20D, amidohydrolase  56.01 
 
 		 404 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  53.91 
 
 		 406 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4914  putative hydrolase  55.21 
 
 		 405 aa  402  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6019  amidohydrolase  53.09 
 
 		 389 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  53.06 
 
 		 395 aa  395  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1291  peptidase M20D, amidohydrolase  53.75 
 
 		 391 aa  396  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.214577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  52.82 
 
 		 425 aa  395  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5419  peptidase, M20D subfamily  54.5 
 
 		 393 aa  395  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.880964 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5133  amidohydrolase  55.03 
 
 		 407 aa  396  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.519765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2753  amidohydrolase  54.26 
 
 		 391 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114457  normal  0.226959 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2549  amidohydrolase  54.43 
 
 		 389 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.475258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3769  amidohydrolase  53.57 
 
 		 396 aa  393  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  53.62 
 
 		 379 aa  394  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4507  hippurate hydrolase  55.5 
 
 		 403 aa  394  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0151662 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1452  amidohydrolase  55.58 
 
 		 404 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.127453 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2611  amidohydrolase  53.63 
 
 		 391 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1410  amidohydrolase  55.58 
 
 		 404 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.044641  normal  0.934375 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2598  peptidase M20D, amidohydrolase  54.1 
 
 		 396 aa  387  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.572475  normal  0.542589 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  53.99 
 
 		 399 aa  388  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  48.73 
 
 		 397 aa  386  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  48.22 
 
 		 397 aa  382  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4353  amidohydrolase  53.21 
 
 		 399 aa  384  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.980853  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4896  amidohydrolase  51.91 
 
 		 396 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.873901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5140  amidohydrolase  53.61 
 
 		 389 aa  379  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.778625 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0252  peptidase M20D, amidohydrolase  51.65 
 
 		 396 aa  378  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5250  amidohydrolase  51.91 
 
 		 396 aa  381  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2992  peptidase M20D, amidohydrolase  51.91 
 
 		 399 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5374  amidohydrolase  51.91 
 
 		 399 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5935  amidohydrolase  51.28 
 
 		 396 aa  375  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4728  amidohydrolase  50.8 
 
 		 393 aa  377  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.848291 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2175  peptidase M20D, amidohydrolase  51.53 
 
 		 396 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.20985 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4721  amidohydrolase  51.91 
 
 		 396 aa  378  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6319  amidohydrolase  54.28 
 
 		 373 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.834758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5569  amidohydrolase  49.87 
 
 		 401 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0051  peptidase M20D, amidohydrolase  51.55 
 
 		 407 aa  372  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  49.08 
 
 		 397 aa  372  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  48.08 
 
 		 396 aa  374  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5843  amidohydrolase  50.91 
 
 		 396 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5651  amidohydrolase  51.04 
 
 		 396 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.146235 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5626  amidohydrolase  50.91 
 
 		 399 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.528848  normal  0.0552178 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  47.83 
 
 		 396 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5424  hippuricase  49.21 
 
 		 388 aa  369  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3715  peptidase M20D, amidohydrolase  51.04 
 
 		 415 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410848  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4653  amidohydrolase  51.04 
 
 		 415 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0295739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5220  amidohydrolase  48.48 
 
 		 393 aa  368  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1302  amidohydrolase  54.66 
 
 		 409 aa  367  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.580399  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  49.33 
 
 		 399 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  48.56 
 
 		 403 aa  365  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  48.43 
 
 		 397 aa  365  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  48.43 
 
 		 396 aa  364  1e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5224  amidohydrolase  51.68 
 
 		 401 aa  364  2e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5073  amidohydrolase  49.86 
 
 		 387 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.546308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  51.14 
 
 		 388 aa  361  1e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  46.37 
 
 		 402 aa  360  2e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1004  hippurate hydrolase  47.73 
 
 		 383 aa  360  2e-98  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  46.97 
 
 		 398 aa  360  3e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  45.92 
 
 		 396 aa  359  5e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1067  hippurate hydrolase  47.73 
 
 		 383 aa  358  7e-98  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.956056  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5222  hippurate hydrolase  53.46 
 
 		 398 aa  358  8e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.22678 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5405  amidohydrolase  49.73 
 
 		 396 aa  356  2.9999999999999997e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0803  hippurate hydrolase  46.93 
 
 		 383 aa  356  3.9999999999999996e-97  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1808  peptidase  54.99 
 
 		 753 aa  356  5e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>