More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5569 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5569  amidohydrolase  100 
 
 		 401 aa  823    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  61.86 
 
 		 395 aa  503  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5250  amidohydrolase  62.11 
 
 		 396 aa  498  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5374  amidohydrolase  61.86 
 
 		 399 aa  495  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5935  amidohydrolase  61.34 
 
 		 396 aa  494  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4896  amidohydrolase  62.11 
 
 		 396 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.873901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2992  peptidase M20D, amidohydrolase  61.86 
 
 		 399 aa  495  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4721  amidohydrolase  61.86 
 
 		 396 aa  497  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3769  amidohydrolase  62.89 
 
 		 396 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2175  peptidase M20D, amidohydrolase  61.6 
 
 		 396 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.20985 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0252  peptidase M20D, amidohydrolase  60.57 
 
 		 396 aa  486  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5222  hippurate hydrolase  62.53 
 
 		 398 aa  486  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.22678 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  60.98 
 
 		 399 aa  477  1e-133  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0476  amidohydrolase family protein  63.5 
 
 		 395 aa  475  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.504077  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1494  hippurate hydrolase  63.4 
 
 		 395 aa  472  1e-132  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213987  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0794  hippurate hydrolase  63.4 
 
 		 395 aa  472  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1808  peptidase  63.4 
 
 		 753 aa  472  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2111  hippurate hydrolase  63.4 
 
 		 395 aa  472  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.216397  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  61.01 
 
 		 425 aa  473  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0378  amidohydrolase family protein  63.4 
 
 		 395 aa  472  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4728  amidohydrolase  57.73 
 
 		 393 aa  461  9.999999999999999e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.848291 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5220  amidohydrolase  55.1 
 
 		 393 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0051  peptidase M20D, amidohydrolase  57.82 
 
 		 407 aa  428  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  53.94 
 
 		 387 aa  426  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  54.88 
 
 		 390 aa  424  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  54.09 
 
 		 387 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  52.51 
 
 		 387 aa  413  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  52.24 
 
 		 387 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  54.57 
 
 		 403 aa  412  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5405  amidohydrolase  53.37 
 
 		 396 aa  413  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  52.24 
 
 		 387 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  52.51 
 
 		 387 aa  414  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  52.24 
 
 		 387 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  51.98 
 
 		 387 aa  409  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  51.4 
 
 		 389 aa  409  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  53.03 
 
 		 387 aa  409  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  52.58 
 
 		 396 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  52.58 
 
 		 396 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  52.58 
 
 		 396 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4012  amidohydrolase  55.73 
 
 		 392 aa  407  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873821 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1245  hippurate hydolase  52.58 
 
 		 396 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689013  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  52.58 
 
 		 396 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  52.58 
 
 		 396 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  52.58 
 
 		 396 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2379  amidohydrolase  55.61 
 
 		 402 aa  405  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  52.47 
 
 		 412 aa  404  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  52.59 
 
 		 396 aa  402  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5133  amidohydrolase  55.53 
 
 		 407 aa  402  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.519765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4433  amidohydrolase  52.06 
 
 		 394 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6019  amidohydrolase  54.05 
 
 		 389 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  52.06 
 
 		 394 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4914  putative hydrolase  53.06 
 
 		 405 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1298  peptidase M20D, amidohydrolase  51.55 
 
 		 394 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4353  amidohydrolase  53.68 
 
 		 399 aa  398  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.980853  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  52.59 
 
 		 394 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  51.29 
 
 		 394 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  51.29 
 
 		 394 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  51.29 
 
 		 394 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  52.09 
 
 		 399 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  53.23 
 
 		 390 aa  395  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  52.04 
 
 		 406 aa  395  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5424  hippuricase  51.19 
 
 		 388 aa  389  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  51.86 
 
 		 379 aa  390  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2549  amidohydrolase  53.14 
 
 		 389 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.475258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2611  amidohydrolase  52.36 
 
 		 391 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1291  peptidase M20D, amidohydrolase  53.66 
 
 		 391 aa  385  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.214577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6319  amidohydrolase  55.47 
 
 		 373 aa  386  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.834758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  51.86 
 
 		 388 aa  383  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2753  amidohydrolase  52.36 
 
 		 391 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114457  normal  0.226959 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5140  amidohydrolase  53.79 
 
 		 389 aa  383  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.778625 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  49.61 
 
 		 397 aa  381  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2598  peptidase M20D, amidohydrolase  54.26 
 
 		 396 aa  373  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.572475  normal  0.542589 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  46.52 
 
 		 397 aa  371  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  49.6 
 
 		 389 aa  371  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  46.21 
 
 		 396 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  46.31 
 
 		 396 aa  366  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  47.66 
 
 		 397 aa  366  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  49.47 
 
 		 389 aa  363  2e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  47.27 
 
 		 397 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5843  amidohydrolase  48.19 
 
 		 396 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1302  amidohydrolase  49.62 
 
 		 409 aa  361  1e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.580399  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  48.04 
 
 		 398 aa  361  1e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  47.66 
 
 		 396 aa  361  2e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5626  amidohydrolase  47.93 
 
 		 399 aa  360  2e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.528848  normal  0.0552178 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5651  amidohydrolase  48.19 
 
 		 396 aa  360  3e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.146235 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  44.56 
 
 		 398 aa  360  3e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3715  peptidase M20D, amidohydrolase  48.19 
 
 		 415 aa  360  3e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410848  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4653  amidohydrolase  48.19 
 
 		 415 aa  360  3e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0295739  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0333  amidohydrolase  47.58 
 
 		 401 aa  359  4e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4586  putative amidohydrolase family protein  51.44 
 
 		 389 aa  359  6e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5896  amidohydrolase  49.87 
 
 		 395 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0480348 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4507  hippurate hydrolase  50.89 
 
 		 403 aa  355  6.999999999999999e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0151662 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  49.48 
 
 		 388 aa  355  1e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2919  amidohydrolase  47.22 
 
 		 388 aa  354  2e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.068301  normal  0.124085 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0948  peptidase M20D, amidohydrolase  50.8 
 
 		 395 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  43.8 
 
 		 423 aa  352  5e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2692  amidohydrolase  46.97 
 
 		 388 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4250  amidohydrolase  49.75 
 
 		 390 aa  351  1e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.456638  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3289  peptidase M20D, amidohydrolase  49.62 
 
 		 404 aa  348  7e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  44.97 
 
 		 404 aa  348  8e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>