More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2692 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2815  amidohydrolase  94.33 
 
 		 390 aa  708    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.575474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2919  amidohydrolase  98.45 
 
 		 388 aa  775    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.068301  normal  0.124085 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2692  amidohydrolase  100 
 
 		 388 aa  784    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3584  amidohydrolase  77 
 
 		 390 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0132191 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3187  amidohydrolase  69.07 
 
 		 388 aa  530  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0033512 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0245  amidohydrolase  71.65 
 
 		 388 aa  526  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.352854  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  60.98 
 
 		 388 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2671  peptidase M20D, amidohydrolase  62.28 
 
 		 394 aa  493  9.999999999999999e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00976662  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2262  peptidase M20D, amidohydrolase  62.56 
 
 		 389 aa  485  1e-136  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.891111  normal  0.0931897 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2229  amidohydrolase  60.73 
 
 		 395 aa  481  1e-135  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3565  peptidase M20D, amidohydrolase  62.92 
 
 		 390 aa  484  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1734  peptidase M20D, amidohydrolase  62.05 
 
 		 389 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.0172136 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2260  putative amidohydrolase family protein  59.38 
 
 		 390 aa  478  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1729  peptidase M20D, amidohydrolase  63.17 
 
 		 390 aa  477  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0022862 
 
 
-
 
NC_004310  BR2037  M20/M25/M40 family peptidase  59.79 
 
 		 387 aa  471  1e-132  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.403946  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2982  putative amidohydrolase family protein  59.74 
 
 		 389 aa  473  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1959  M20/M25/M40 family peptidase  59.28 
 
 		 387 aa  468  1.0000000000000001e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4367  amidohydrolase  62.27 
 
 		 388 aa  471  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3872  hippurate hydrolase  60.05 
 
 		 387 aa  470  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4250  amidohydrolase  61.64 
 
 		 390 aa  464  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.456638  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0901  amidohydrolase  59.28 
 
 		 387 aa  466  9.999999999999999e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1288  amidohydrolase  61.7 
 
 		 388 aa  462  1e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0866095  normal  0.389955 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  58.03 
 
 		 387 aa  464  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4586  putative amidohydrolase family protein  58.25 
 
 		 389 aa  464  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  58.29 
 
 		 387 aa  461  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5364  putative amidohydrolase family protein  58.61 
 
 		 390 aa  459  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00388806 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2573  amidohydrolase  59.54 
 
 		 387 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0165265  normal  0.498174 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0718  peptidase M20D, amidohydrolase  57.84 
 
 		 390 aa  449  1e-125  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.178083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3056  amidohydrolase  60.31 
 
 		 387 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0610  amidohydrolase  61.34 
 
 		 389 aa  443  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00962709  normal  0.632979 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3289  peptidase M20D, amidohydrolase  56.3 
 
 		 387 aa  442  1e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.286044 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4062  amidohydrolase  58.03 
 
 		 387 aa  439  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0719  peptidase M20D, amidohydrolase  55.9 
 
 		 387 aa  439  9.999999999999999e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.093275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2910  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  54.26 
 
 		 388 aa  434  1e-120  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1555  amidohydrolase  54.26 
 
 		 388 aa  434  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3314  amidohydrolase  54.52 
 
 		 390 aa  418  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0937  peptidase M20D, amidohydrolase  51.55 
 
 		 387 aa  412  1e-114  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.47047  normal  0.0807888 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0935  amidohydrolase  53.37 
 
 		 415 aa  409  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2343  peptidase M20D, amidohydrolase  53.21 
 
 		 386 aa  405  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0732987  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1110  amidohydrolase  53.49 
 
 		 388 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.247548  normal  0.0143187 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0687  amidohydrolase  53.89 
 
 		 408 aa  403  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.422759  normal  0.057643 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0665  amidohydrolase  53.89 
 
 		 408 aa  404  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5679  amidohydrolase  51.29 
 
 		 408 aa  391  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613587 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1301  amidohydrolase  52.73 
 
 		 404 aa  392  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.855359 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  50.75 
 
 		 404 aa  393  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1090  amidohydrolase  52.73 
 
 		 424 aa  390  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  51.46 
 
 		 389 aa  387  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1813  peptidase M20D, amidohydrolase  52.59 
 
 		 388 aa  388  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.301487  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4834  amidohydrolase  51.44 
 
 		 385 aa  385  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0546494  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  49.75 
 
 		 397 aa  384  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3086  peptidase M20D, amidohydrolase  52.71 
 
 		 389 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.985379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  49.12 
 
 		 398 aa  380  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1248  amidohydrolase  49.62 
 
 		 425 aa  380  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.144528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4686  amidohydrolase  52.22 
 
 		 385 aa  379  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.694379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  48.11 
 
 		 396 aa  380  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  50.13 
 
 		 390 aa  375  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0651  amidohydrolase  47.91 
 
 		 447 aa  376  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0326492  normal  0.115252 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2871  peptidase M20D, amidohydrolase  52.22 
 
 		 391 aa  376  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  48.36 
 
 		 397 aa  375  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  50.91 
 
 		 399 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  48.99 
 
 		 403 aa  372  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0749  peptidase M20D, amidohydrolase  49.26 
 
 		 427 aa  372  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0878973  normal  0.8802 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  50.13 
 
 		 388 aa  374  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4317  amidohydrolase  51.96 
 
 		 385 aa  375  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0319433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  49.37 
 
 		 397 aa  373  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  51.7 
 
 		 388 aa  372  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  47.86 
 
 		 396 aa  369  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0444  amidohydrolase  47.49 
 
 		 401 aa  370  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186163  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5260  putative amidohydrolase family protein  48.45 
 
 		 387 aa  371  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0497165  normal  0.313624 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1161  amidohydrolase  50.39 
 
 		 386 aa  370  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  47.61 
 
 		 396 aa  368  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  49.21 
 
 		 387 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  48.96 
 
 		 389 aa  369  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0453  amidohydrolase  47.24 
 
 		 401 aa  369  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  47.61 
 
 		 396 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  50.66 
 
 		 388 aa  368  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4653  amidohydrolase  50.76 
 
 		 415 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0295739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5651  amidohydrolase  50.76 
 
 		 396 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.146235 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4256  amidohydrolase  52.24 
 
 		 392 aa  367  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.545833 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  48.56 
 
 		 387 aa  365  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  46.85 
 
 		 397 aa  366  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5626  amidohydrolase  50.63 
 
 		 399 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.528848  normal  0.0552178 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2533  peptidase M20D, amidohydrolase  46.37 
 
 		 397 aa  365  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030908 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  49.87 
 
 		 387 aa  366  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  49.11 
 
 		 402 aa  367  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  50.53 
 
 		 395 aa  365  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3715  peptidase M20D, amidohydrolase  50.76 
 
 		 415 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410848  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  48.95 
 
 		 387 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4914  putative hydrolase  50.65 
 
 		 405 aa  364  1e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  48.84 
 
 		 406 aa  364  1e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2323  amidohydrolase  51.96 
 
 		 386 aa  365  1e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.462875 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5843  amidohydrolase  50.38 
 
 		 396 aa  364  1e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  49.87 
 
 		 389 aa  363  2e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  49.1 
 
 		 394 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  49.1 
 
 		 394 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  49.1 
 
 		 394 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  49.74 
 
 		 379 aa  362  8e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2476  amidohydrolase  51.21 
 
 		 398 aa  361  9e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.738512  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5569  amidohydrolase  46.97 
 
 		 401 aa  361  1e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  49.36 
 
 		 399 aa  360  2e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>