More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR2037 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR2037  M20/M25/M40 family peptidase  100 
 
 
387 aa  795    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.403946  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0901  amidohydrolase  94.32 
 
 
387 aa  739    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1959  M20/M25/M40 family peptidase  99.48 
 
 
387 aa  792    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3872  hippurate hydrolase  66.67 
 
 
387 aa  539  9.999999999999999e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  64.42 
 
 
387 aa  524  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2573  amidohydrolase  65.89 
 
 
387 aa  524  1e-148  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0165265  normal  0.498174 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  64.16 
 
 
387 aa  522  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4062  amidohydrolase  64.25 
 
 
387 aa  509  1e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2671  peptidase M20D, amidohydrolase  63.04 
 
 
394 aa  505  9.999999999999999e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00976662  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1734  peptidase M20D, amidohydrolase  62.82 
 
 
389 aa  498  1e-140  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.0172136 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2262  peptidase M20D, amidohydrolase  62.05 
 
 
389 aa  491  9.999999999999999e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.891111  normal  0.0931897 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1729  peptidase M20D, amidohydrolase  62.4 
 
 
390 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0022862 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3565  peptidase M20D, amidohydrolase  62.15 
 
 
390 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4250  amidohydrolase  61.64 
 
 
390 aa  490  1e-137  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.456638  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2982  putative amidohydrolase family protein  59.74 
 
 
389 aa  479  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3056  amidohydrolase  60.47 
 
 
387 aa  480  1e-134  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2919  amidohydrolase  59.79 
 
 
388 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.068301  normal  0.124085 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2692  amidohydrolase  59.79 
 
 
388 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2229  amidohydrolase  60.16 
 
 
395 aa  468  1.0000000000000001e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3187  amidohydrolase  61.34 
 
 
388 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0033512 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4586  putative amidohydrolase family protein  56.48 
 
 
389 aa  467  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1288  amidohydrolase  59.54 
 
 
388 aa  464  1e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0866095  normal  0.389955 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2815  amidohydrolase  60.31 
 
 
390 aa  462  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.575474  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0718  peptidase M20D, amidohydrolase  58.87 
 
 
390 aa  461  1e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.178083  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  57.51 
 
 
388 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4367  amidohydrolase  58.96 
 
 
388 aa  456  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0719  peptidase M20D, amidohydrolase  57.69 
 
 
387 aa  457  1e-127  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.093275  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0245  amidohydrolase  61.08 
 
 
388 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.352854  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3584  amidohydrolase  58.55 
 
 
390 aa  444  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0132191 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0610  amidohydrolase  59.95 
 
 
389 aa  436  1e-121  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00962709  normal  0.632979 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2260  putative amidohydrolase family protein  55.53 
 
 
390 aa  434  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1555  amidohydrolase  54.43 
 
 
388 aa  428  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435924  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2910  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  54.43 
 
 
388 aa  428  1e-119  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3289  peptidase M20D, amidohydrolase  54.5 
 
 
387 aa  429  1e-119  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.286044 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3314  amidohydrolase  53.89 
 
 
390 aa  419  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5364  putative amidohydrolase family protein  54.5 
 
 
390 aa  416  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00388806 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2343  peptidase M20D, amidohydrolase  55.32 
 
 
386 aa  408  1e-113  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0732987  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0937  peptidase M20D, amidohydrolase  53.23 
 
 
387 aa  409  1e-113  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.47047  normal  0.0807888 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1110  amidohydrolase  53.65 
 
 
388 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.247548  normal  0.0143187 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  48.61 
 
 
396 aa  392  1e-108  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1161  amidohydrolase  51.04 
 
 
386 aa  391  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3086  peptidase M20D, amidohydrolase  55.12 
 
 
389 aa  391  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.985379  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  48.11 
 
 
396 aa  385  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  49.1 
 
 
396 aa  385  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  48.84 
 
 
396 aa  385  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  50.13 
 
 
398 aa  384  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  50.65 
 
 
388 aa  382  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  47.49 
 
 
397 aa  382  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  46.21 
 
 
397 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  49.87 
 
 
388 aa  377  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  48.37 
 
 
404 aa  377  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  48.25 
 
 
403 aa  372  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1813  peptidase M20D, amidohydrolase  50.65 
 
 
388 aa  374  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.301487  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  49.07 
 
 
389 aa  369  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  46.98 
 
 
397 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2533  peptidase M20D, amidohydrolase  46.48 
 
 
397 aa  365  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0030908 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  49.34 
 
 
379 aa  363  3e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  48.16 
 
 
387 aa  361  1e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4834  amidohydrolase  50.65 
 
 
385 aa  358  9e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0546494  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  47.68 
 
 
399 aa  357  9.999999999999999e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  46.17 
 
 
398 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0665  amidohydrolase  48.55 
 
 
408 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0687  amidohydrolase  48.55 
 
 
408 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.422759  normal  0.057643 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0935  amidohydrolase  45.43 
 
 
415 aa  355  5.999999999999999e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  47.24 
 
 
390 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  47.29 
 
 
389 aa  354  1e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1248  amidohydrolase  48.06 
 
 
425 aa  353  2.9999999999999997e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.144528  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0444  amidohydrolase  47.38 
 
 
401 aa  353  2.9999999999999997e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186163  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  47.57 
 
 
402 aa  352  8.999999999999999e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5651  amidohydrolase  47.86 
 
 
396 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.146235 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3715  peptidase M20D, amidohydrolase  47.86 
 
 
415 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410848  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4653  amidohydrolase  47.86 
 
 
415 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0295739  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  47.21 
 
 
388 aa  351  1e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  46.35 
 
 
397 aa  351  1e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0453  amidohydrolase  47.12 
 
 
401 aa  351  1e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  45.96 
 
 
397 aa  350  2e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  45.66 
 
 
423 aa  350  2e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4686  amidohydrolase  50.65 
 
 
385 aa  350  3e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.694379  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4317  amidohydrolase  50.65 
 
 
385 aa  349  5e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0319433  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0651  amidohydrolase  44.67 
 
 
447 aa  348  7e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0326492  normal  0.115252 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  46.19 
 
 
406 aa  348  8e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1301  amidohydrolase  46.07 
 
 
404 aa  348  9e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.855359 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2871  peptidase M20D, amidohydrolase  48.68 
 
 
391 aa  347  2e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2323  amidohydrolase  50.9 
 
 
386 aa  347  2e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.462875 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5843  amidohydrolase  47.22 
 
 
396 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575611  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  48 
 
 
395 aa  346  3e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1090  amidohydrolase  46.3 
 
 
424 aa  346  3e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5424  hippuricase  46.86 
 
 
388 aa  347  3e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5626  amidohydrolase  47.22 
 
 
399 aa  345  6e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.528848  normal  0.0552178 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2808  amidohydrolase  47.93 
 
 
385 aa  345  7e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5260  putative amidohydrolase family protein  44.96 
 
 
387 aa  345  8.999999999999999e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0497165  normal  0.313624 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  46.93 
 
 
403 aa  345  8.999999999999999e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  45.79 
 
 
387 aa  343  2e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2611  amidohydrolase  46.05 
 
 
391 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  45.6 
 
 
389 aa  343  2.9999999999999997e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  46.52 
 
 
399 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5374  amidohydrolase  48.77 
 
 
399 aa  343  4e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2992  peptidase M20D, amidohydrolase  48.77 
 
 
399 aa  343  4e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4896  amidohydrolase  48.77 
 
 
396 aa  342  5e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.873901  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  46.04 
 
 
394 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>