More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0935 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0665  amidohydrolase  86.43 
 
 
408 aa  733    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0687  amidohydrolase  86.28 
 
 
408 aa  736    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.422759  normal  0.057643 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5679  amidohydrolase  79 
 
 
408 aa  655    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.613587 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0935  amidohydrolase  100 
 
 
415 aa  845    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1090  amidohydrolase  77.86 
 
 
424 aa  654    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1301  amidohydrolase  81.45 
 
 
404 aa  676    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.855359 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0651  amidohydrolase  72 
 
 
447 aa  617  1e-175  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0326492  normal  0.115252 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0749  peptidase M20D, amidohydrolase  71.46 
 
 
427 aa  605  9.999999999999999e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0878973  normal  0.8802 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  51.52 
 
 
397 aa  396  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2692  amidohydrolase  53.37 
 
 
388 aa  398  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2919  amidohydrolase  53.37 
 
 
388 aa  397  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.068301  normal  0.124085 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  51.15 
 
 
397 aa  394  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3584  amidohydrolase  53.98 
 
 
390 aa  394  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0132191 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2229  amidohydrolase  48.73 
 
 
395 aa  388  1e-107  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  50.9 
 
 
388 aa  388  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  49.87 
 
 
396 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  49.87 
 
 
396 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  50.93 
 
 
388 aa  379  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  49.49 
 
 
397 aa  379  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3187  amidohydrolase  52.11 
 
 
388 aa  381  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0033512 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  49.61 
 
 
396 aa  375  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2815  amidohydrolase  51.55 
 
 
390 aa  377  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.575474  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  49.08 
 
 
389 aa  373  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0245  amidohydrolase  53.37 
 
 
388 aa  372  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.352854  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  49.35 
 
 
403 aa  368  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  50.66 
 
 
388 aa  370  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0937  peptidase M20D, amidohydrolase  49.22 
 
 
387 aa  370  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.47047  normal  0.0807888 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2260  putative amidohydrolase family protein  50.13 
 
 
390 aa  369  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3314  amidohydrolase  49.61 
 
 
390 aa  370  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4367  amidohydrolase  50.39 
 
 
388 aa  367  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4586  putative amidohydrolase family protein  48.45 
 
 
389 aa  368  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1813  peptidase M20D, amidohydrolase  49.48 
 
 
388 aa  365  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.301487  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0333  amidohydrolase  49.74 
 
 
401 aa  368  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  48.45 
 
 
398 aa  365  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  48.24 
 
 
402 aa  367  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5260  putative amidohydrolase family protein  46.91 
 
 
387 aa  362  1e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0497165  normal  0.313624 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  47.69 
 
 
398 aa  361  1e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  46.28 
 
 
423 aa  361  1e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0610  amidohydrolase  49.61 
 
 
389 aa  361  1e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00962709  normal  0.632979 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1248  amidohydrolase  50.27 
 
 
425 aa  360  3e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.144528  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1729  peptidase M20D, amidohydrolase  49.74 
 
 
390 aa  359  6e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0022862 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4834  amidohydrolase  49.1 
 
 
385 aa  358  7e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0546494  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3289  peptidase M20D, amidohydrolase  45.88 
 
 
387 aa  358  8e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.286044 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0444  amidohydrolase  48.56 
 
 
401 aa  358  9.999999999999999e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186163  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  47.41 
 
 
397 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  45.57 
 
 
396 aa  356  3.9999999999999996e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0453  amidohydrolase  48.3 
 
 
401 aa  356  3.9999999999999996e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2343  peptidase M20D, amidohydrolase  49.22 
 
 
386 aa  355  6.999999999999999e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0732987  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5364  putative amidohydrolase family protein  49.35 
 
 
390 aa  355  6.999999999999999e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00388806 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  47.67 
 
 
397 aa  354  1e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  47.34 
 
 
387 aa  355  1e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3086  peptidase M20D, amidohydrolase  50 
 
 
389 aa  353  2e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.985379  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0719  peptidase M20D, amidohydrolase  46.02 
 
 
387 aa  354  2e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.093275  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  47.34 
 
 
387 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2871  peptidase M20D, amidohydrolase  49.09 
 
 
391 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  47.55 
 
 
404 aa  353  2.9999999999999997e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2932  peptidase M20D, amidohydrolase  48.33 
 
 
382 aa  351  1e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.886758  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1288  amidohydrolase  46.02 
 
 
388 aa  350  2e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0866095  normal  0.389955 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4256  amidohydrolase  48.03 
 
 
392 aa  350  2e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.545833 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4686  amidohydrolase  49.35 
 
 
385 aa  349  4e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.694379  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2533  peptidase M20D, amidohydrolase  46.21 
 
 
397 aa  349  6e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0030908 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4317  amidohydrolase  49.35 
 
 
385 aa  349  6e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0319433  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2037  M20/M25/M40 family peptidase  45.43 
 
 
387 aa  347  3e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.403946  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  45.6 
 
 
387 aa  347  3e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  45.6 
 
 
387 aa  346  5e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2573  amidohydrolase  48.29 
 
 
387 aa  345  8.999999999999999e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0165265  normal  0.498174 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1161  amidohydrolase  47.8 
 
 
386 aa  345  1e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1959  M20/M25/M40 family peptidase  45.17 
 
 
387 aa  344  1e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1132  amidohydrolase  49.23 
 
 
402 aa  343  2e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  46.88 
 
 
406 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0901  amidohydrolase  45.65 
 
 
387 aa  343  4e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1734  peptidase M20D, amidohydrolase  47.29 
 
 
389 aa  342  7e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.0172136 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  45.83 
 
 
390 aa  342  1e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3565  peptidase M20D, amidohydrolase  46.91 
 
 
390 aa  341  1e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  46.48 
 
 
389 aa  341  1e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2982  putative amidohydrolase family protein  45.99 
 
 
389 aa  340  2e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  46.7 
 
 
387 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3872  hippurate hydrolase  46.97 
 
 
387 aa  340  2e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  45.93 
 
 
379 aa  341  2e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4914  putative hydrolase  46.55 
 
 
405 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4653  amidohydrolase  47.55 
 
 
415 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0295739  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  46.7 
 
 
387 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3715  peptidase M20D, amidohydrolase  47.55 
 
 
415 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410848  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  46.7 
 
 
387 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  46.09 
 
 
387 aa  340  4e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  46.09 
 
 
387 aa  339  5e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5651  amidohydrolase  47.55 
 
 
396 aa  339  5e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.146235 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  44.42 
 
 
388 aa  339  7e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2126  peptidase M20D, amidohydrolase  47.56 
 
 
390 aa  338  8e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.587793  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0984  peptidase M20D, amidohydrolase  45.9 
 
 
397 aa  338  9e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4250  amidohydrolase  48.71 
 
 
390 aa  338  9e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.456638  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2466  amidohydrolase  50.4 
 
 
390 aa  338  9.999999999999999e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.293537  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  46.28 
 
 
387 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  46.74 
 
 
394 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  46.74 
 
 
394 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  46.97 
 
 
387 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  46.74 
 
 
394 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2910  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  44.47 
 
 
388 aa  336  5e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1555  amidohydrolase  44.47 
 
 
388 aa  336  5e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435924  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5843  amidohydrolase  47.27 
 
 
396 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575611  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>