More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1161 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1161  amidohydrolase  100 
 
 		 386 aa  781    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0937  peptidase M20D, amidohydrolase  65.45 
 
 		 387 aa  526  1e-148  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.47047  normal  0.0807888 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2910  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  62.95 
 
 		 388 aa  509  1e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1555  amidohydrolase  62.95 
 
 		 388 aa  509  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2343  peptidase M20D, amidohydrolase  62.34 
 
 		 386 aa  489  1e-137  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0732987  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1110  amidohydrolase  61.66 
 
 		 388 aa  485  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.247548  normal  0.0143187 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4586  putative amidohydrolase family protein  55.15 
 
 		 389 aa  419  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  51.7 
 
 		 387 aa  396  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1288  amidohydrolase  53.73 
 
 		 388 aa  388  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0866095  normal  0.389955 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  50.65 
 
 		 387 aa  388  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_004310  BR2037  M20/M25/M40 family peptidase  51.04 
 
 		 387 aa  384  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.403946  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2573  amidohydrolase  52.36 
 
 		 387 aa  384  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0165265  normal  0.498174 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1959  M20/M25/M40 family peptidase  50.52 
 
 		 387 aa  381  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0901  amidohydrolase  50.78 
 
 		 387 aa  381  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1734  peptidase M20D, amidohydrolase  51.55 
 
 		 389 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.0172136 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3565  peptidase M20D, amidohydrolase  51.81 
 
 		 390 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2229  amidohydrolase  51.04 
 
 		 395 aa  380  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4250  amidohydrolase  53.63 
 
 		 390 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.456638  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2982  putative amidohydrolase family protein  50.78 
 
 		 389 aa  378  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4367  amidohydrolase  50.52 
 
 		 388 aa  375  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4062  amidohydrolase  52.22 
 
 		 387 aa  376  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3187  amidohydrolase  52.71 
 
 		 388 aa  377  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0033512 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2260  putative amidohydrolase family protein  52.96 
 
 		 390 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3872  hippurate hydrolase  49.21 
 
 		 387 aa  375  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  47.33 
 
 		 397 aa  375  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2671  peptidase M20D, amidohydrolase  50.26 
 
 		 394 aa  369  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00976662  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  46.21 
 
 		 397 aa  366  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0245  amidohydrolase  53.49 
 
 		 388 aa  368  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.352854  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3289  peptidase M20D, amidohydrolase  50 
 
 		 387 aa  367  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.286044 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1729  peptidase M20D, amidohydrolase  50.52 
 
 		 390 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0022862 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5364  putative amidohydrolase family protein  50 
 
 		 390 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00388806 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0719  peptidase M20D, amidohydrolase  50.52 
 
 		 387 aa  367  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.093275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  45.94 
 
 		 396 aa  364  1e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  48.17 
 
 		 397 aa  361  1e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3056  amidohydrolase  50.52 
 
 		 387 aa  360  2e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2262  peptidase M20D, amidohydrolase  49.35 
 
 		 389 aa  359  4e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.891111  normal  0.0931897 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2919  amidohydrolase  50.39 
 
 		 388 aa  358  7e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.068301  normal  0.124085 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2692  amidohydrolase  50.39 
 
 		 388 aa  357  9.999999999999999e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2815  amidohydrolase  50.9 
 
 		 390 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.575474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0718  peptidase M20D, amidohydrolase  49.23 
 
 		 390 aa  355  5e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.178083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0665  amidohydrolase  50.13 
 
 		 408 aa  354  1e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5679  amidohydrolase  48.59 
 
 		 408 aa  354  1e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613587 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0687  amidohydrolase  50.13 
 
 		 408 aa  354  1e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.422759  normal  0.057643 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  51.35 
 
 		 395 aa  353  2e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4896  amidohydrolase  51.35 
 
 		 396 aa  353  2e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.873901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3584  amidohydrolase  50.13 
 
 		 390 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0132191 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  45.55 
 
 		 396 aa  352  4e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  47.42 
 
 		 388 aa  353  4e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  45.55 
 
 		 396 aa  353  4e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5374  amidohydrolase  51.35 
 
 		 399 aa  352  5e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2992  peptidase M20D, amidohydrolase  51.35 
 
 		 399 aa  352  5e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5250  amidohydrolase  51.08 
 
 		 396 aa  352  8e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4721  amidohydrolase  51.08 
 
 		 396 aa  351  1e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  47.37 
 
 		 403 aa  350  2e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  49.87 
 
 		 388 aa  350  2e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0252  peptidase M20D, amidohydrolase  50.54 
 
 		 396 aa  350  3e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24772  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  45.29 
 
 		 396 aa  348  6e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0610  amidohydrolase  48.84 
 
 		 389 aa  348  8e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00962709  normal  0.632979 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  50.13 
 
 		 379 aa  347  2e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  46.46 
 
 		 403 aa  346  3e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  45.29 
 
 		 423 aa  346  4e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5260  putative amidohydrolase family protein  46.37 
 
 		 387 aa  345  1e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0497165  normal  0.313624 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0935  amidohydrolase  47.8 
 
 		 415 aa  345  1e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  44.53 
 
 		 398 aa  343  2e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0651  amidohydrolase  45.34 
 
 		 447 aa  343  2e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0326492  normal  0.115252 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2533  peptidase M20D, amidohydrolase  45.45 
 
 		 397 aa  342  9e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030908 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4653  amidohydrolase  46.82 
 
 		 415 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0295739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3715  peptidase M20D, amidohydrolase  46.82 
 
 		 415 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410848  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5651  amidohydrolase  46.82 
 
 		 396 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.146235 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0749  peptidase M20D, amidohydrolase  45.68 
 
 		 427 aa  340  2e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0878973  normal  0.8802 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1090  amidohydrolase  48.45 
 
 		 424 aa  340  2e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  44.53 
 
 		 398 aa  340  2.9999999999999998e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4834  amidohydrolase  47.64 
 
 		 385 aa  338  8e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0546494  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1193  peptidase M20D, amidohydrolase  46.11 
 
 		 388 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.95754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5843  amidohydrolase  45.8 
 
 		 396 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5626  amidohydrolase  46.06 
 
 		 399 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.528848  normal  0.0552178 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3086  peptidase M20D, amidohydrolase  48.2 
 
 		 389 aa  336  5e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.985379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2871  peptidase M20D, amidohydrolase  50.65 
 
 		 391 aa  334  1e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0333  amidohydrolase  43.77 
 
 		 401 aa  334  2e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3769  amidohydrolase  49.19 
 
 		 396 aa  334  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2323  amidohydrolase  48.56 
 
 		 386 aa  333  3e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.462875 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4353  amidohydrolase  46.81 
 
 		 399 aa  333  4e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.980853  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  46.4 
 
 		 399 aa  332  5e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3314  amidohydrolase  46.65 
 
 		 390 aa  332  5e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1301  amidohydrolase  46.89 
 
 		 404 aa  332  6e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.855359 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  47.66 
 
 		 399 aa  332  7.000000000000001e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  46.74 
 
 		 388 aa  332  9e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4317  amidohydrolase  47.64 
 
 		 385 aa  331  1e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0319433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4914  putative hydrolase  46.05 
 
 		 405 aa  331  1e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  43.99 
 
 		 402 aa  330  2e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0984  peptidase M20D, amidohydrolase  48.72 
 
 		 397 aa  330  2e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4686  amidohydrolase  47.38 
 
 		 385 aa  331  2e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.694379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  45.04 
 
 		 397 aa  330  2e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  46.11 
 
 		 389 aa  329  4e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1813  peptidase M20D, amidohydrolase  46.74 
 
 		 388 aa  330  4e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.301487  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  42.17 
 
 		 404 aa  329  6e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  50.53 
 
 		 384 aa  329  6e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  45.26 
 
 		 406 aa  329  6e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1248  amidohydrolase  44.42 
 
 		 425 aa  328  1.0000000000000001e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.144528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2932  peptidase M20D, amidohydrolase  49.87 
 
 		 382 aa  327  2.0000000000000001e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.886758  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>