More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2932 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_2932  peptidase M20D, amidohydrolase  100 
 
 
382 aa  776    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.886758  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0044  peptidase M20D, amidohydrolase  59.32 
 
 
385 aa  429  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2179  amidohydrolase  60.42 
 
 
393 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.833898  normal  0.575344 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  51.57 
 
 
384 aa  369  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0984  peptidase M20D, amidohydrolase  50.39 
 
 
397 aa  365  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5679  amidohydrolase  49.22 
 
 
408 aa  363  2e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.613587 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  48.94 
 
 
389 aa  360  2e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  46.92 
 
 
397 aa  359  4e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0935  amidohydrolase  48.33 
 
 
415 aa  357  9.999999999999999e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5260  putative amidohydrolase family protein  49.86 
 
 
387 aa  357  9.999999999999999e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0497165  normal  0.313624 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  46.67 
 
 
397 aa  357  9.999999999999999e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  48.58 
 
 
388 aa  356  2.9999999999999997e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1090  amidohydrolase  49.61 
 
 
424 aa  357  2.9999999999999997e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0687  amidohydrolase  49.61 
 
 
408 aa  356  3.9999999999999996e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.422759  normal  0.057643 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  48.21 
 
 
396 aa  356  5e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2871  peptidase M20D, amidohydrolase  51.05 
 
 
391 aa  355  7.999999999999999e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0665  amidohydrolase  49.35 
 
 
408 aa  355  1e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  47.95 
 
 
396 aa  352  5.9999999999999994e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  45.64 
 
 
396 aa  351  1e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  50.54 
 
 
388 aa  350  3e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  46.39 
 
 
387 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  47.69 
 
 
396 aa  347  2e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0333  amidohydrolase  47.91 
 
 
401 aa  347  2e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  49.09 
 
 
403 aa  347  2e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0444  amidohydrolase  47.63 
 
 
401 aa  347  2e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186163  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1708  peptidase M20D, amidohydrolase  50.67 
 
 
389 aa  346  4e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.971842  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0453  amidohydrolase  47.37 
 
 
401 aa  345  6e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  45.88 
 
 
387 aa  345  8e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2982  putative amidohydrolase family protein  49.35 
 
 
389 aa  343  2e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  46.49 
 
 
387 aa  341  1e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  49.73 
 
 
388 aa  340  2e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  46.82 
 
 
397 aa  340  2e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  46.72 
 
 
398 aa  340  2.9999999999999998e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5843  amidohydrolase  47.4 
 
 
396 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575611  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5626  amidohydrolase  47.79 
 
 
399 aa  339  5e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.528848  normal  0.0552178 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  46.61 
 
 
404 aa  338  9e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  47.12 
 
 
394 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6268  amidohydrolase  47.58 
 
 
395 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.843577  normal  0.0558872 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  46.44 
 
 
379 aa  337  1.9999999999999998e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  45.97 
 
 
390 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  46.95 
 
 
397 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  46.17 
 
 
402 aa  336  5e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1248  amidohydrolase  47.14 
 
 
425 aa  335  5.999999999999999e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.144528  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2343  peptidase M20D, amidohydrolase  48.4 
 
 
386 aa  335  7e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0732987  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4433  amidohydrolase  46.86 
 
 
394 aa  334  1e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  45.67 
 
 
397 aa  334  1e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4653  amidohydrolase  47.26 
 
 
415 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0295739  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  45.53 
 
 
387 aa  334  2e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  46.11 
 
 
387 aa  334  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4586  putative amidohydrolase family protein  48.02 
 
 
389 aa  334  2e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5651  amidohydrolase  47.26 
 
 
396 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.146235 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3715  peptidase M20D, amidohydrolase  47.26 
 
 
415 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410848  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6670  amidohydrolase  47.04 
 
 
395 aa  333  4e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6435  peptidase M20D, amidohydrolase  47.04 
 
 
395 aa  333  4e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  46.6 
 
 
394 aa  332  6e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1132  amidohydrolase  48.73 
 
 
402 aa  332  6e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  46.6 
 
 
394 aa  332  6e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  46.6 
 
 
394 aa  332  6e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  46.07 
 
 
396 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  46.07 
 
 
396 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1245  hippurate hydolase  46.07 
 
 
396 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689013  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  46.07 
 
 
396 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1193  peptidase M20D, amidohydrolase  50.41 
 
 
388 aa  332  7.000000000000001e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.95754  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6067  amidohydrolase  47.85 
 
 
395 aa  332  8e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1161  amidohydrolase  49.87 
 
 
386 aa  332  8e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3314  amidohydrolase  47.91 
 
 
390 aa  332  8e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  46.6 
 
 
394 aa  331  1e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0937  peptidase M20D, amidohydrolase  47.18 
 
 
387 aa  331  1e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.47047  normal  0.0807888 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  45.26 
 
 
387 aa  331  1e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0651  amidohydrolase  44.86 
 
 
447 aa  330  2e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0326492  normal  0.115252 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1301  amidohydrolase  45.95 
 
 
404 aa  330  2e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.855359 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  45.81 
 
 
396 aa  330  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  45.81 
 
 
396 aa  330  3e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  45.81 
 
 
396 aa  330  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1298  peptidase M20D, amidohydrolase  46.6 
 
 
394 aa  330  3e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3928  amidohydrolase  50.54 
 
 
395 aa  330  3e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.530582  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  45.26 
 
 
387 aa  330  4e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6364  amidohydrolase  47.58 
 
 
395 aa  330  4e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.557183  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  46.56 
 
 
390 aa  328  6e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  45.41 
 
 
412 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  45.81 
 
 
396 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3456  amidohydrolase  45.93 
 
 
388 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  48 
 
 
388 aa  327  3e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  45 
 
 
387 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0069  peptidase M20D, amidohydrolase  46.44 
 
 
384 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.53846  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  45 
 
 
387 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  45 
 
 
387 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7215  hippurate hydrolase  47.66 
 
 
397 aa  326  5e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  45.95 
 
 
398 aa  325  6e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1216  amidohydrolase  46.03 
 
 
386 aa  325  6e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  46.49 
 
 
406 aa  325  6e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0749  peptidase M20D, amidohydrolase  44.85 
 
 
427 aa  324  1e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0878973  normal  0.8802 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4353  amidohydrolase  46.6 
 
 
399 aa  323  2e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.980853  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2808  amidohydrolase  46.03 
 
 
385 aa  323  2e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  45.69 
 
 
403 aa  323  3e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4834  amidohydrolase  48.39 
 
 
385 aa  323  3e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0546494  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  45.53 
 
 
387 aa  323  3e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  44.95 
 
 
423 aa  323  4e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2573  amidohydrolase  46.19 
 
 
387 aa  322  5e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0165265  normal  0.498174 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1813  peptidase M20D, amidohydrolase  49.33 
 
 
388 aa  322  7e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.301487  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>