More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0984 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0984  peptidase M20D, amidohydrolase  100 
 
 		 397 aa  803    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5260  putative amidohydrolase family protein  58.93 
 
 		 387 aa  479  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0497165  normal  0.313624 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7215  hippurate hydrolase  57.95 
 
 		 397 aa  452  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1193  peptidase M20D, amidohydrolase  61.48 
 
 		 388 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.95754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3928  amidohydrolase  61.48 
 
 		 395 aa  451  1e-125  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.530582  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2126  peptidase M20D, amidohydrolase  60.97 
 
 		 390 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.587793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3295  peptidase M20D, amidohydrolase  60.46 
 
 		 391 aa  435  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.353614  normal  0.0242454 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  54.73 
 
 		 388 aa  435  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4834  amidohydrolase  57.8 
 
 		 385 aa  433  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0546494  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4686  amidohydrolase  58.06 
 
 		 385 aa  431  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.694379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  54.73 
 
 		 388 aa  431  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4317  amidohydrolase  57.54 
 
 		 385 aa  426  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0319433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2323  amidohydrolase  56.52 
 
 		 386 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.462875 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  48.37 
 
 		 396 aa  378  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  49.74 
 
 		 394 aa  368  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  49.74 
 
 		 394 aa  368  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  49.74 
 
 		 394 aa  368  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  46.12 
 
 		 404 aa  366  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  46.12 
 
 		 397 aa  365  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  49.87 
 
 		 394 aa  366  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  49.23 
 
 		 394 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4433  amidohydrolase  48.97 
 
 		 394 aa  364  1e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  46.87 
 
 		 397 aa  365  1e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  47.62 
 
 		 396 aa  364  2e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  48.59 
 
 		 406 aa  363  2e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  48.97 
 
 		 396 aa  363  3e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1298  peptidase M20D, amidohydrolase  49.23 
 
 		 394 aa  363  4e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4914  putative hydrolase  49.1 
 
 		 405 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  47.9 
 
 		 403 aa  362  7.0000000000000005e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  48.97 
 
 		 396 aa  362  9e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  48.97 
 
 		 396 aa  362  9e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  48.97 
 
 		 396 aa  362  9e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2932  peptidase M20D, amidohydrolase  50.39 
 
 		 382 aa  361  1e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.886758  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1248  amidohydrolase  46.27 
 
 		 425 aa  360  2e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.144528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1245  hippurate hydolase  48.72 
 
 		 396 aa  360  3e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689013  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  48.72 
 
 		 396 aa  360  3e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2611  amidohydrolase  49.87 
 
 		 391 aa  360  3e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  48.72 
 
 		 396 aa  360  3e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  48.72 
 
 		 396 aa  360  3e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  45.86 
 
 		 396 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2753  amidohydrolase  48.59 
 
 		 391 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114457  normal  0.226959 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  47 
 
 		 402 aa  354  1e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  45.61 
 
 		 396 aa  354  2e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  46.87 
 
 		 397 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5843  amidohydrolase  49.62 
 
 		 396 aa  353  4e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5651  amidohydrolase  49.62 
 
 		 396 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.146235 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4653  amidohydrolase  49.62 
 
 		 415 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0295739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3715  peptidase M20D, amidohydrolase  49.62 
 
 		 415 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410848  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0444  amidohydrolase  45.45 
 
 		 401 aa  352  8e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186163  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2549  amidohydrolase  48.72 
 
 		 389 aa  351  1e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.475258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5626  amidohydrolase  49.37 
 
 		 399 aa  351  1e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.528848  normal  0.0552178 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  45.36 
 
 		 423 aa  350  3e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0453  amidohydrolase  45.21 
 
 		 401 aa  350  3e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  46.94 
 
 		 390 aa  348  7e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  45.36 
 
 		 398 aa  348  9e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2871  peptidase M20D, amidohydrolase  48.09 
 
 		 391 aa  347  2e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  48.85 
 
 		 389 aa  347  3e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2379  amidohydrolase  49.6 
 
 		 402 aa  346  4e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0651  amidohydrolase  46.55 
 
 		 447 aa  346  5e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0326492  normal  0.115252 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0749  peptidase M20D, amidohydrolase  47.15 
 
 		 427 aa  344  2e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0878973  normal  0.8802 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  43.53 
 
 		 398 aa  343  2e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  46.51 
 
 		 412 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  47.24 
 
 		 389 aa  342  5e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5679  amidohydrolase  46.41 
 
 		 408 aa  342  5e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613587 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2533  peptidase M20D, amidohydrolase  47.51 
 
 		 397 aa  342  5.999999999999999e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030908 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  45.38 
 
 		 389 aa  342  7e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  44.28 
 
 		 397 aa  341  1e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4012  amidohydrolase  47.29 
 
 		 392 aa  341  2e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873821 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1813  peptidase M20D, amidohydrolase  47.91 
 
 		 388 aa  340  4e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.301487  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0687  amidohydrolase  46.98 
 
 		 408 aa  339  5e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.422759  normal  0.057643 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  48.83 
 
 		 384 aa  339  5e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0935  amidohydrolase  45.9 
 
 		 415 aa  338  9e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5812  peptidase M20D, amidohydrolase  48.72 
 
 		 394 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.586057  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0665  amidohydrolase  46.97 
 
 		 408 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  46.56 
 
 		 387 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1132  amidohydrolase  47.39 
 
 		 402 aa  337  1.9999999999999998e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  45.66 
 
 		 390 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  47.51 
 
 		 395 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2919  amidohydrolase  48.08 
 
 		 388 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.068301  normal  0.124085 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2692  amidohydrolase  48.08 
 
 		 388 aa  335  7e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  47.07 
 
 		 387 aa  335  7e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1555  amidohydrolase  45.78 
 
 		 388 aa  335  1e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1291  peptidase M20D, amidohydrolase  48.34 
 
 		 391 aa  335  1e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.214577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2910  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  45.78 
 
 		 388 aa  335  1e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1090  amidohydrolase  46.91 
 
 		 424 aa  335  1e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  46.31 
 
 		 387 aa  335  1e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  47.37 
 
 		 388 aa  334  2e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0333  amidohydrolase  42.79 
 
 		 401 aa  334  2e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  44.11 
 
 		 397 aa  334  2e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  46.43 
 
 		 387 aa  333  4e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  46.43 
 
 		 387 aa  333  4e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  46.68 
 
 		 387 aa  333  5e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1161  amidohydrolase  48.72 
 
 		 386 aa  330  2e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1301  amidohydrolase  44.36 
 
 		 404 aa  330  2e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.855359 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  45.04 
 
 		 387 aa  329  4e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7452  peptidase M20D, amidohydrolase  47.51 
 
 		 416 aa  329  6e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2466  amidohydrolase  50.51 
 
 		 390 aa  329  6e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.293537  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  45.82 
 
 		 388 aa  329  6e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  48.05 
 
 		 425 aa  328  8e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4586  putative amidohydrolase family protein  46.29 
 
 		 389 aa  328  9e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>