More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7215 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7215  hippurate hydrolase  100 
 
 		 397 aa  798    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5260  putative amidohydrolase family protein  60.94 
 
 		 387 aa  478  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0497165  normal  0.313624 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3928  amidohydrolase  65.09 
 
 		 395 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.530582  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2126  peptidase M20D, amidohydrolase  63.02 
 
 		 390 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.587793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1193  peptidase M20D, amidohydrolase  61.46 
 
 		 388 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.95754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0984  peptidase M20D, amidohydrolase  57.95 
 
 		 397 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3295  peptidase M20D, amidohydrolase  63.19 
 
 		 391 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.353614  normal  0.0242454 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  57.18 
 
 		 388 aa  444  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  56.51 
 
 		 388 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4834  amidohydrolase  58.96 
 
 		 385 aa  427  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0546494  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4686  amidohydrolase  58.96 
 
 		 385 aa  424  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.694379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4317  amidohydrolase  58.96 
 
 		 385 aa  424  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0319433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2323  amidohydrolase  57.18 
 
 		 386 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.462875 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  47.59 
 
 		 396 aa  350  3e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1298  peptidase M20D, amidohydrolase  47.68 
 
 		 394 aa  349  6e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  47.33 
 
 		 396 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  47.33 
 
 		 396 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1245  hippurate hydolase  47.33 
 
 		 396 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689013  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  47.33 
 
 		 396 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  47.33 
 
 		 396 aa  346  3e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  47.33 
 
 		 396 aa  346  3e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  47.33 
 
 		 396 aa  346  3e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  46.19 
 
 		 398 aa  346  4e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  47.16 
 
 		 394 aa  345  7e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  47.16 
 
 		 394 aa  345  7e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  47.16 
 
 		 394 aa  345  7e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  44.7 
 
 		 404 aa  343  4e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  45.59 
 
 		 402 aa  342  5e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  46.91 
 
 		 394 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  45.18 
 
 		 397 aa  342  7e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  47.07 
 
 		 396 aa  341  1e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  45.09 
 
 		 403 aa  341  1e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  46.82 
 
 		 396 aa  341  2e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5651  amidohydrolase  47.84 
 
 		 396 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.146235 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4653  amidohydrolase  47.84 
 
 		 415 aa  339  4e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0295739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  44.92 
 
 		 396 aa  339  4e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3715  peptidase M20D, amidohydrolase  47.84 
 
 		 415 aa  339  4e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410848  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5626  amidohydrolase  47.33 
 
 		 399 aa  339  5e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.528848  normal  0.0552178 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4433  amidohydrolase  46.39 
 
 		 394 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  47.37 
 
 		 387 aa  338  8e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  47.42 
 
 		 394 aa  338  8e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2871  peptidase M20D, amidohydrolase  47.42 
 
 		 391 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5843  amidohydrolase  47.46 
 
 		 396 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  48.4 
 
 		 395 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  46.86 
 
 		 412 aa  336  3.9999999999999995e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1288  amidohydrolase  47.42 
 
 		 388 aa  336  5e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0866095  normal  0.389955 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3769  amidohydrolase  50.27 
 
 		 396 aa  336  5e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2919  amidohydrolase  45.85 
 
 		 388 aa  334  1e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.068301  normal  0.124085 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  46.32 
 
 		 387 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  46.58 
 
 		 387 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  46.58 
 
 		 387 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  46.05 
 
 		 387 aa  334  2e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  48.8 
 
 		 425 aa  333  3e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  44.44 
 
 		 397 aa  332  7.000000000000001e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  45.79 
 
 		 387 aa  332  8e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  44.19 
 
 		 397 aa  332  9e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5812  peptidase M20D, amidohydrolase  47.81 
 
 		 394 aa  330  3e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.586057  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2692  amidohydrolase  45.34 
 
 		 388 aa  330  3e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  44.04 
 
 		 406 aa  330  3e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  46.81 
 
 		 389 aa  330  4e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4586  putative amidohydrolase family protein  46.09 
 
 		 389 aa  328  8e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  44.1 
 
 		 389 aa  328  1.0000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  46.05 
 
 		 387 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1813  peptidase M20D, amidohydrolase  48.24 
 
 		 388 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.301487  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2533  peptidase M20D, amidohydrolase  46.72 
 
 		 397 aa  328  1.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030908 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1090  amidohydrolase  47.4 
 
 		 424 aa  327  2.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4896  amidohydrolase  48.94 
 
 		 396 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.873901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3289  peptidase M20D, amidohydrolase  45.79 
 
 		 404 aa  327  3e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5374  amidohydrolase  48.67 
 
 		 399 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2992  peptidase M20D, amidohydrolase  48.67 
 
 		 399 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0333  amidohydrolase  45.2 
 
 		 401 aa  326  5e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1248  amidohydrolase  43.69 
 
 		 425 aa  326  5e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.144528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  46.19 
 
 		 388 aa  325  6e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2611  amidohydrolase  45.74 
 
 		 391 aa  325  7e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0252  peptidase M20D, amidohydrolase  48.67 
 
 		 396 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5935  amidohydrolase  47.41 
 
 		 396 aa  325  9e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  45.2 
 
 		 396 aa  324  2e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2549  amidohydrolase  45.19 
 
 		 389 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.475258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1410  amidohydrolase  46.91 
 
 		 404 aa  324  2e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.044641  normal  0.934375 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4914  putative hydrolase  43.67 
 
 		 405 aa  324  2e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  46.28 
 
 		 379 aa  323  3e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3456  amidohydrolase  47.35 
 
 		 388 aa  323  3e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1452  amidohydrolase  46.91 
 
 		 404 aa  323  4e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.127453 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  44.25 
 
 		 399 aa  322  5e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2753  amidohydrolase  45.48 
 
 		 391 aa  323  5e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114457  normal  0.226959 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0453  amidohydrolase  42.42 
 
 		 401 aa  323  5e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5405  amidohydrolase  46.68 
 
 		 396 aa  322  5e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  44.36 
 
 		 390 aa  322  6e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0937  peptidase M20D, amidohydrolase  43.04 
 
 		 387 aa  322  8e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.47047  normal  0.0807888 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5133  amidohydrolase  46.78 
 
 		 407 aa  322  9.000000000000001e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.519765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3314  amidohydrolase  46.79 
 
 		 390 aa  322  9.000000000000001e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4721  amidohydrolase  47.87 
 
 		 396 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2815  amidohydrolase  45.85 
 
 		 390 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.575474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2932  peptidase M20D, amidohydrolase  47.66 
 
 		 382 aa  321  9.999999999999999e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.886758  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5250  amidohydrolase  48.14 
 
 		 396 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4612  amidohydrolase  47.35 
 
 		 389 aa  322  9.999999999999999e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.194835  normal  0.384238 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0444  amidohydrolase  42.42 
 
 		 401 aa  322  9.999999999999999e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186163  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2379  amidohydrolase  44.67 
 
 		 402 aa  320  1.9999999999999998e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3241  peptidase M20D, amidohydrolase  49.74 
 
 		 391 aa  320  1.9999999999999998e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0177418  normal  0.343736 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  44.36 
 
 		 387 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>