More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4612 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4612  amidohydrolase  100 
 
 		 389 aa  789    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.194835  normal  0.384238 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3165  amidohydrolase  83.51 
 
 		 389 aa  647    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3456  amidohydrolase  83.76 
 
 		 389 aa  662    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.960361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3241  peptidase M20D, amidohydrolase  72.49 
 
 		 391 aa  551  1e-156  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0177418  normal  0.343736 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  51.33 
 
 		 389 aa  379  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  52.38 
 
 		 396 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1245  hippurate hydolase  52.38 
 
 		 396 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689013  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  52.38 
 
 		 396 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  52.38 
 
 		 396 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  52.12 
 
 		 396 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  52.12 
 
 		 396 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  52.38 
 
 		 396 aa  375  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  50.52 
 
 		 387 aa  372  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  52.12 
 
 		 396 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4433  amidohydrolase  51.32 
 
 		 394 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  51.06 
 
 		 394 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  50.79 
 
 		 394 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  49.22 
 
 		 387 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1298  peptidase M20D, amidohydrolase  50.79 
 
 		 394 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  49.48 
 
 		 387 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  51.06 
 
 		 394 aa  365  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  50.79 
 
 		 394 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  49.22 
 
 		 387 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  50.79 
 
 		 394 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  48.96 
 
 		 387 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  49.22 
 
 		 387 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  49.22 
 
 		 387 aa  365  1e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  50 
 
 		 412 aa  363  3e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  48.45 
 
 		 390 aa  363  3e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  48.71 
 
 		 387 aa  360  2e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  48.31 
 
 		 387 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  45.73 
 
 		 398 aa  356  3.9999999999999996e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  46.46 
 
 		 397 aa  355  1e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  45.61 
 
 		 397 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2466  amidohydrolase  52 
 
 		 390 aa  350  2e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.293537  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5843  amidohydrolase  47.61 
 
 		 396 aa  348  8e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575611  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  47.26 
 
 		 396 aa  348  1e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  45.98 
 
 		 397 aa  348  1e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  47.52 
 
 		 396 aa  347  2e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4653  amidohydrolase  47.98 
 
 		 415 aa  346  3e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0295739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5626  amidohydrolase  47.36 
 
 		 399 aa  347  3e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.528848  normal  0.0552178 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3715  peptidase M20D, amidohydrolase  47.98 
 
 		 415 aa  346  3e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410848  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5651  amidohydrolase  47.98 
 
 		 396 aa  346  3e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.146235 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  46.37 
 
 		 397 aa  346  5e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  47 
 
 		 396 aa  344  1e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  46.02 
 
 		 404 aa  344  1e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0333  amidohydrolase  45.32 
 
 		 401 aa  345  1e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  44.91 
 
 		 423 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  44.25 
 
 		 403 aa  343  4e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  48.3 
 
 		 425 aa  341  1e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  49.07 
 
 		 395 aa  340  2e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  45.59 
 
 		 402 aa  340  2e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  44.82 
 
 		 398 aa  340  2e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  46.23 
 
 		 397 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  48.27 
 
 		 389 aa  339  5e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  50.39 
 
 		 384 aa  338  9e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0252  peptidase M20D, amidohydrolase  49.07 
 
 		 396 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5374  amidohydrolase  49.6 
 
 		 399 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2992  peptidase M20D, amidohydrolase  49.6 
 
 		 399 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  50.13 
 
 		 399 aa  336  3.9999999999999995e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  47.12 
 
 		 396 aa  335  5e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3769  amidohydrolase  48.84 
 
 		 396 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5224  amidohydrolase  49.61 
 
 		 401 aa  335  7e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4896  amidohydrolase  49.34 
 
 		 396 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.873901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1132  amidohydrolase  48.73 
 
 		 402 aa  334  1e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5250  amidohydrolase  49.34 
 
 		 396 aa  333  2e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4721  amidohydrolase  49.34 
 
 		 396 aa  332  5e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5935  amidohydrolase  48.81 
 
 		 396 aa  332  6e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2175  peptidase M20D, amidohydrolase  48.54 
 
 		 396 aa  332  6e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.20985 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5133  amidohydrolase  51.18 
 
 		 407 aa  332  9e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.519765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  47.87 
 
 		 379 aa  332  9e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3523  peptidase M20D, amidohydrolase  48.97 
 
 		 385 aa  330  2e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2871  peptidase M20D, amidohydrolase  48.14 
 
 		 391 aa  331  2e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  47.29 
 
 		 406 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  46.04 
 
 		 403 aa  329  6e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5260  putative amidohydrolase family protein  46.17 
 
 		 387 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0497165  normal  0.313624 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  48.27 
 
 		 389 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0453  amidohydrolase  43.19 
 
 		 401 aa  327  3e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0444  amidohydrolase  43.19 
 
 		 401 aa  327  3e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186163  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2027  amidohydrolase  43.39 
 
 		 382 aa  326  6e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0315101  normal  0.0503578 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  47.01 
 
 		 388 aa  325  7e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2262  peptidase M20D, amidohydrolase  46.98 
 
 		 389 aa  325  9e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.891111  normal  0.0931897 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2533  peptidase M20D, amidohydrolase  46.23 
 
 		 397 aa  324  1e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030908 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3565  peptidase M20D, amidohydrolase  47.38 
 
 		 390 aa  324  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4012  amidohydrolase  48.94 
 
 		 392 aa  323  3e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873821 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4914  putative hydrolase  47.21 
 
 		 405 aa  323  3e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  46.38 
 
 		 387 aa  323  4e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6067  amidohydrolase  47.04 
 
 		 395 aa  322  5e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1248  amidohydrolase  43.58 
 
 		 425 aa  322  6e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.144528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5222  hippurate hydrolase  49.47 
 
 		 398 aa  322  7e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.22678 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  46.37 
 
 		 388 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7215  hippurate hydrolase  47.35 
 
 		 397 aa  322  9.999999999999999e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6364  amidohydrolase  46.77 
 
 		 395 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.557183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  45.84 
 
 		 387 aa  320  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5812  peptidase M20D, amidohydrolase  50.26 
 
 		 394 aa  320  3e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.586057  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  47.86 
 
 		 390 aa  320  3.9999999999999996e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  44.85 
 
 		 388 aa  318  7.999999999999999e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0051  peptidase M20D, amidohydrolase  47.52 
 
 		 407 aa  318  1e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1734  peptidase M20D, amidohydrolase  46.98 
 
 		 389 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.0172136 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5896  amidohydrolase  48.68 
 
 		 395 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0480348 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>