More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3928 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2126  peptidase M20D, amidohydrolase  88.95 
 
 		 390 aa  673    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.587793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1193  peptidase M20D, amidohydrolase  82.99 
 
 		 388 aa  645    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.95754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5260  putative amidohydrolase family protein  82.34 
 
 		 387 aa  673    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0497165  normal  0.313624 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3295  peptidase M20D, amidohydrolase  87.34 
 
 		 391 aa  652    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.353614  normal  0.0242454 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3928  amidohydrolase  100 
 
 		 395 aa  799    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.530582  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  64.34 
 
 		 388 aa  514  1e-144  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  63.57 
 
 		 388 aa  508  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7215  hippurate hydrolase  65.09 
 
 		 397 aa  496  1e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4834  amidohydrolase  64.75 
 
 		 385 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0546494  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0984  peptidase M20D, amidohydrolase  61.48 
 
 		 397 aa  489  1e-137  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4686  amidohydrolase  64.75 
 
 		 385 aa  484  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.694379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4317  amidohydrolase  64.75 
 
 		 385 aa  483  1e-135  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0319433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2323  amidohydrolase  64.49 
 
 		 386 aa  478  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.462875 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4653  amidohydrolase  52.91 
 
 		 415 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0295739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5651  amidohydrolase  52.91 
 
 		 396 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.146235 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3715  peptidase M20D, amidohydrolase  52.91 
 
 		 415 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410848  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5843  amidohydrolase  52.41 
 
 		 396 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5626  amidohydrolase  52.41 
 
 		 399 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.528848  normal  0.0552178 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  48.48 
 
 		 397 aa  382  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  50.77 
 
 		 390 aa  383  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  48.61 
 
 		 397 aa  380  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  49.62 
 
 		 396 aa  376  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  50 
 
 		 387 aa  378  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  50.53 
 
 		 387 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3187  amidohydrolase  52.71 
 
 		 388 aa  375  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0033512 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  49.37 
 
 		 396 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4586  putative amidohydrolase family protein  50.13 
 
 		 389 aa  376  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  49.74 
 
 		 387 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  50.53 
 
 		 387 aa  375  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  51.06 
 
 		 387 aa  374  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  50 
 
 		 387 aa  372  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  49.37 
 
 		 396 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  50.53 
 
 		 387 aa  375  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  49.21 
 
 		 412 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  48.11 
 
 		 403 aa  368  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  49.1 
 
 		 396 aa  369  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  47.99 
 
 		 397 aa  370  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  48.61 
 
 		 398 aa  371  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  47.53 
 
 		 387 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  49.08 
 
 		 406 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1245  hippurate hydolase  48.32 
 
 		 396 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689013  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  47.34 
 
 		 396 aa  367  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  48.32 
 
 		 396 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  48.32 
 
 		 396 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  48.32 
 
 		 396 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  48.32 
 
 		 396 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  48.32 
 
 		 396 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3584  amidohydrolase  50.39 
 
 		 390 aa  366  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0132191 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4012  amidohydrolase  48.07 
 
 		 392 aa  366  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873821 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4433  amidohydrolase  48.58 
 
 		 394 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  48.32 
 
 		 396 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  48.58 
 
 		 394 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  47.53 
 
 		 387 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  48.32 
 
 		 394 aa  365  1e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1298  peptidase M20D, amidohydrolase  48.58 
 
 		 394 aa  365  1e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2533  peptidase M20D, amidohydrolase  49.75 
 
 		 397 aa  364  1e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030908 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  48.32 
 
 		 394 aa  365  1e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  48.32 
 
 		 394 aa  365  1e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0937  peptidase M20D, amidohydrolase  46.13 
 
 		 387 aa  363  2e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.47047  normal  0.0807888 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0453  amidohydrolase  47.36 
 
 		 401 aa  363  2e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  48.84 
 
 		 394 aa  364  2e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  47.77 
 
 		 390 aa  363  2e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0444  amidohydrolase  47.36 
 
 		 401 aa  363  2e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186163  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  46.48 
 
 		 397 aa  363  3e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2919  amidohydrolase  49.61 
 
 		 388 aa  363  3e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.068301  normal  0.124085 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  46.67 
 
 		 404 aa  363  4e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2379  amidohydrolase  48.47 
 
 		 402 aa  362  7.0000000000000005e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4914  putative hydrolase  48.81 
 
 		 405 aa  360  2e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2692  amidohydrolase  49.61 
 
 		 388 aa  360  2e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2910  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  47.03 
 
 		 388 aa  359  5e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  45.98 
 
 		 398 aa  359  5e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1555  amidohydrolase  47.03 
 
 		 388 aa  359  5e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  47.14 
 
 		 402 aa  359  6e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0333  amidohydrolase  47.09 
 
 		 401 aa  358  6e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2932  peptidase M20D, amidohydrolase  50.54 
 
 		 382 aa  358  7e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.886758  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  46.08 
 
 		 423 aa  358  8e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  47.09 
 
 		 397 aa  358  9e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1090  amidohydrolase  49.48 
 
 		 424 aa  358  9.999999999999999e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  49.21 
 
 		 389 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1288  amidohydrolase  49.23 
 
 		 388 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0866095  normal  0.389955 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  47.24 
 
 		 387 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2229  amidohydrolase  48.3 
 
 		 395 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  47.61 
 
 		 387 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0935  amidohydrolase  48.58 
 
 		 415 aa  356  3.9999999999999996e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  50.53 
 
 		 384 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0687  amidohydrolase  48.2 
 
 		 408 aa  355  5e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.422759  normal  0.057643 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0665  amidohydrolase  48.2 
 
 		 408 aa  355  5e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  49.47 
 
 		 395 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2982  putative amidohydrolase family protein  48.97 
 
 		 389 aa  355  8.999999999999999e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  47.73 
 
 		 389 aa  354  1e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2262  peptidase M20D, amidohydrolase  49.74 
 
 		 389 aa  355  1e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.891111  normal  0.0931897 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1248  amidohydrolase  47.21 
 
 		 425 aa  355  1e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.144528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2815  amidohydrolase  49.87 
 
 		 390 aa  353  4e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.575474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5679  amidohydrolase  45.8 
 
 		 408 aa  352  7e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613587 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  48.32 
 
 		 388 aa  351  1e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1301  amidohydrolase  47.15 
 
 		 404 aa  350  2e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.855359 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1729  peptidase M20D, amidohydrolase  50.39 
 
 		 390 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0022862 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  46.42 
 
 		 379 aa  350  2e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0749  peptidase M20D, amidohydrolase  46.42 
 
 		 427 aa  350  3e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0878973  normal  0.8802 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2611  amidohydrolase  49.07 
 
 		 391 aa  350  3e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.234689 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>