More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4834 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4834  amidohydrolase  100 
 
 		 385 aa  774    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0546494  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4686  amidohydrolase  96.36 
 
 		 385 aa  711    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.694379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4317  amidohydrolase  95.84 
 
 		 385 aa  706    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0319433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  70.73 
 
 		 388 aa  568  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2323  amidohydrolase  77.2 
 
 		 386 aa  568  1e-161  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.462875 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  70.73 
 
 		 388 aa  567  1e-160  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5260  putative amidohydrolase family protein  61.92 
 
 		 387 aa  500  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0497165  normal  0.313624 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1193  peptidase M20D, amidohydrolase  65.01 
 
 		 388 aa  478  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.95754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3928  amidohydrolase  64.75 
 
 		 395 aa  471  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.530582  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2126  peptidase M20D, amidohydrolase  62.4 
 
 		 390 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.587793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0984  peptidase M20D, amidohydrolase  57.8 
 
 		 397 aa  448  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3295  peptidase M20D, amidohydrolase  62.44 
 
 		 391 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.353614  normal  0.0242454 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7215  hippurate hydrolase  58.96 
 
 		 397 aa  440  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  54.57 
 
 		 389 aa  410  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4586  putative amidohydrolase family protein  51.44 
 
 		 389 aa  398  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3187  amidohydrolase  55.47 
 
 		 388 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0033512 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5843  amidohydrolase  52.3 
 
 		 396 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1555  amidohydrolase  49.74 
 
 		 388 aa  385  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  51.01 
 
 		 397 aa  388  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5626  amidohydrolase  52.04 
 
 		 399 aa  388  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.528848  normal  0.0552178 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2910  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  49.74 
 
 		 388 aa  385  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5651  amidohydrolase  52.3 
 
 		 396 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.146235 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  50.26 
 
 		 398 aa  387  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2919  amidohydrolase  51.44 
 
 		 388 aa  385  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.068301  normal  0.124085 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  48.74 
 
 		 396 aa  386  1e-106  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  51.98 
 
 		 388 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2692  amidohydrolase  51.44 
 
 		 388 aa  386  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3715  peptidase M20D, amidohydrolase  52.3 
 
 		 415 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410848  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4653  amidohydrolase  52.3 
 
 		 415 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0295739  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  49.74 
 
 		 396 aa  382  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  47.7 
 
 		 397 aa  382  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  49.62 
 
 		 396 aa  383  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  49.62 
 
 		 403 aa  382  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  50 
 
 		 423 aa  383  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  47.59 
 
 		 397 aa  382  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  49.87 
 
 		 396 aa  383  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0937  peptidase M20D, amidohydrolase  47.91 
 
 		 387 aa  379  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.47047  normal  0.0807888 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0245  amidohydrolase  53.39 
 
 		 388 aa  375  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.352854  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2262  peptidase M20D, amidohydrolase  51.54 
 
 		 389 aa  375  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.891111  normal  0.0931897 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2533  peptidase M20D, amidohydrolase  50.64 
 
 		 397 aa  377  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030908 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2466  amidohydrolase  53.91 
 
 		 390 aa  372  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.293537  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0687  amidohydrolase  50.9 
 
 		 408 aa  373  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.422759  normal  0.057643 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  47.34 
 
 		 398 aa  372  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0665  amidohydrolase  50.9 
 
 		 408 aa  373  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  48.95 
 
 		 406 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0453  amidohydrolase  47.24 
 
 		 401 aa  370  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4367  amidohydrolase  52.12 
 
 		 388 aa  369  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1301  amidohydrolase  51.31 
 
 		 404 aa  370  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.855359 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  48.28 
 
 		 390 aa  368  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1729  peptidase M20D, amidohydrolase  51.66 
 
 		 390 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0022862 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4914  putative hydrolase  49.33 
 
 		 405 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  48.18 
 
 		 387 aa  371  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0935  amidohydrolase  49.1 
 
 		 415 aa  370  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3584  amidohydrolase  50.39 
 
 		 390 aa  369  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0132191 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2229  amidohydrolase  50.92 
 
 		 395 aa  370  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0444  amidohydrolase  47.24 
 
 		 401 aa  370  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186163  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2815  amidohydrolase  51.17 
 
 		 390 aa  368  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.575474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  50 
 
 		 412 aa  365  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  46.48 
 
 		 404 aa  367  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  48.18 
 
 		 387 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1734  peptidase M20D, amidohydrolase  51.03 
 
 		 389 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.0172136 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  46.8 
 
 		 397 aa  366  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1090  amidohydrolase  51.04 
 
 		 424 aa  368  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2671  peptidase M20D, amidohydrolase  50.38 
 
 		 394 aa  367  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00976662  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1248  amidohydrolase  48.21 
 
 		 425 aa  365  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.144528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  50.52 
 
 		 389 aa  366  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3565  peptidase M20D, amidohydrolase  50.9 
 
 		 390 aa  364  1e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  47.33 
 
 		 402 aa  363  2e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  49.87 
 
 		 387 aa  363  3e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2549  amidohydrolase  48.67 
 
 		 389 aa  362  4e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.475258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  48.53 
 
 		 387 aa  363  4e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5679  amidohydrolase  49.23 
 
 		 408 aa  363  4e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613587 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2611  amidohydrolase  48.81 
 
 		 391 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  48.79 
 
 		 387 aa  362  8e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  48.79 
 
 		 387 aa  362  8e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  47.75 
 
 		 387 aa  362  9e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_004310  BR2037  M20/M25/M40 family peptidase  50.65 
 
 		 387 aa  361  1e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.403946  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2379  amidohydrolase  49.87 
 
 		 402 aa  361  1e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1288  amidohydrolase  51.05 
 
 		 388 aa  361  1e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0866095  normal  0.389955 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  48.01 
 
 		 387 aa  361  1e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0651  amidohydrolase  48.16 
 
 		 447 aa  361  1e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0326492  normal  0.115252 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2260  putative amidohydrolase family protein  48.83 
 
 		 390 aa  361  1e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  48.53 
 
 		 387 aa  360  2e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  48.53 
 
 		 403 aa  360  2e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  48.26 
 
 		 387 aa  360  2e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2753  amidohydrolase  48.55 
 
 		 391 aa  359  5e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114457  normal  0.226959 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1110  amidohydrolase  49.21 
 
 		 388 aa  359  6e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.247548  normal  0.0143187 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4433  amidohydrolase  49.09 
 
 		 394 aa  358  7e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  49.09 
 
 		 394 aa  358  9e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  49.09 
 
 		 394 aa  358  9e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  49.09 
 
 		 394 aa  358  9e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4250  amidohydrolase  50.25 
 
 		 390 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.456638  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1959  M20/M25/M40 family peptidase  50.13 
 
 		 387 aa  357  1.9999999999999998e-97  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1298  peptidase M20D, amidohydrolase  48.96 
 
 		 394 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0333  amidohydrolase  46.68 
 
 		 401 aa  356  2.9999999999999997e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4012  amidohydrolase  48.83 
 
 		 392 aa  356  2.9999999999999997e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873821 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  48.83 
 
 		 394 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5364  putative amidohydrolase family protein  48.33 
 
 		 390 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00388806 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0749  peptidase M20D, amidohydrolase  48.76 
 
 		 427 aa  356  3.9999999999999996e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0878973  normal  0.8802 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0901  amidohydrolase  50.13 
 
 		 387 aa  356  3.9999999999999996e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>