More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0749 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_0651  amidohydrolase  85.99 
 
 
447 aa  733    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0326492  normal  0.115252 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0749  peptidase M20D, amidohydrolase  100 
 
 
427 aa  876    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0878973  normal  0.8802 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0935  amidohydrolase  71.46 
 
 
415 aa  605  9.999999999999999e-173  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0665  amidohydrolase  71.08 
 
 
408 aa  600  1e-170  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0687  amidohydrolase  71.08 
 
 
408 aa  600  1e-170  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.422759  normal  0.057643 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5679  amidohydrolase  70 
 
 
408 aa  585  1e-166  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.613587 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1301  amidohydrolase  69.14 
 
 
404 aa  576  1.0000000000000001e-163  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.855359 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1090  amidohydrolase  67.47 
 
 
424 aa  573  1.0000000000000001e-162  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  49.63 
 
 
397 aa  384  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  49.5 
 
 
397 aa  384  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2229  amidohydrolase  45.83 
 
 
395 aa  370  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  45.79 
 
 
396 aa  362  6e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  45.54 
 
 
396 aa  360  3e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2919  amidohydrolase  49.26 
 
 
388 aa  359  5e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.068301  normal  0.124085 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  44.8 
 
 
396 aa  358  9.999999999999999e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2692  amidohydrolase  49.26 
 
 
388 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  46.1 
 
 
396 aa  357  2.9999999999999997e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  46.23 
 
 
402 aa  357  2.9999999999999997e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  48.22 
 
 
388 aa  356  5e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  46.15 
 
 
398 aa  356  5e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  47.22 
 
 
403 aa  353  2e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2343  peptidase M20D, amidohydrolase  46.04 
 
 
386 aa  354  2e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0732987  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  45.91 
 
 
423 aa  352  5e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0333  amidohydrolase  46.46 
 
 
401 aa  353  5e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3584  amidohydrolase  48.76 
 
 
390 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0132191 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  46.72 
 
 
404 aa  352  8e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  45.71 
 
 
397 aa  352  8e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2533  peptidase M20D, amidohydrolase  45.79 
 
 
397 aa  352  8.999999999999999e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0030908 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  46.72 
 
 
389 aa  352  1e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0937  peptidase M20D, amidohydrolase  45.3 
 
 
387 aa  350  2e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.47047  normal  0.0807888 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2260  putative amidohydrolase family protein  46.67 
 
 
390 aa  350  3e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1555  amidohydrolase  44.33 
 
 
388 aa  349  5e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435924  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2910  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  44.33 
 
 
388 aa  349  5e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  46.88 
 
 
388 aa  348  7e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  46.85 
 
 
397 aa  348  7e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2871  peptidase M20D, amidohydrolase  47.51 
 
 
391 aa  348  1e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3187  amidohydrolase  47.52 
 
 
388 aa  347  2e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0033512 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  45.2 
 
 
397 aa  347  3e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4834  amidohydrolase  48.76 
 
 
385 aa  346  4e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0546494  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1729  peptidase M20D, amidohydrolase  47.64 
 
 
390 aa  346  5e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0022862 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0444  amidohydrolase  46.17 
 
 
401 aa  345  6e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186163  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2815  amidohydrolase  47.29 
 
 
390 aa  345  7e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.575474  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5260  putative amidohydrolase family protein  45.3 
 
 
387 aa  345  1e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0497165  normal  0.313624 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  45.68 
 
 
388 aa  344  1e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0453  amidohydrolase  45.92 
 
 
401 aa  344  2e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0984  peptidase M20D, amidohydrolase  47.15 
 
 
397 aa  344  2e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2982  putative amidohydrolase family protein  45.66 
 
 
389 aa  343  2e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4686  amidohydrolase  49.38 
 
 
385 aa  343  4e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.694379  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4586  putative amidohydrolase family protein  43.92 
 
 
389 aa  341  2e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1161  amidohydrolase  45.68 
 
 
386 aa  340  2e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3565  peptidase M20D, amidohydrolase  45.16 
 
 
390 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4317  amidohydrolase  49.13 
 
 
385 aa  339  5e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0319433  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1813  peptidase M20D, amidohydrolase  44.8 
 
 
388 aa  339  5.9999999999999996e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.301487  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4250  amidohydrolase  46.9 
 
 
390 aa  339  5.9999999999999996e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.456638  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3314  amidohydrolase  45.36 
 
 
390 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  44.19 
 
 
398 aa  336  3.9999999999999995e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1734  peptidase M20D, amidohydrolase  45.16 
 
 
389 aa  336  5e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.0172136 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3715  peptidase M20D, amidohydrolase  46.21 
 
 
415 aa  336  5e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410848  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4653  amidohydrolase  46.21 
 
 
415 aa  336  5e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0295739  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5651  amidohydrolase  46.21 
 
 
396 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.146235 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2671  peptidase M20D, amidohydrolase  44.06 
 
 
394 aa  335  7e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00976662  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1248  amidohydrolase  45.59 
 
 
425 aa  335  1e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.144528  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  42.93 
 
 
387 aa  335  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1132  amidohydrolase  47.62 
 
 
402 aa  334  1e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0245  amidohydrolase  48.27 
 
 
388 aa  335  1e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.352854  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  44.44 
 
 
387 aa  334  2e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  44.44 
 
 
387 aa  332  6e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  44.44 
 
 
387 aa  332  6e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5843  amidohydrolase  45.71 
 
 
396 aa  332  8e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575611  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2466  amidohydrolase  47.76 
 
 
390 aa  331  1e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.293537  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  44.19 
 
 
387 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  44.19 
 
 
387 aa  331  2e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4367  amidohydrolase  45.61 
 
 
388 aa  330  3e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2126  peptidase M20D, amidohydrolase  46.67 
 
 
390 aa  330  3e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.587793  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5626  amidohydrolase  45.71 
 
 
399 aa  330  4e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.528848  normal  0.0552178 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  44.47 
 
 
388 aa  329  4e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1110  amidohydrolase  43.6 
 
 
388 aa  330  4e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.247548  normal  0.0143187 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  44.7 
 
 
387 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2549  amidohydrolase  44.83 
 
 
389 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.475258  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  42.18 
 
 
387 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  45.37 
 
 
395 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2262  peptidase M20D, amidohydrolase  43.42 
 
 
389 aa  327  3e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.891111  normal  0.0931897 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3872  hippurate hydrolase  44.39 
 
 
387 aa  326  4.0000000000000003e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5569  amidohydrolase  45.15 
 
 
401 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544377  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2611  amidohydrolase  44.44 
 
 
391 aa  325  6e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2323  amidohydrolase  48.13 
 
 
386 aa  326  6e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.462875 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  45.14 
 
 
425 aa  325  8.000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2753  amidohydrolase  44.58 
 
 
391 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114457  normal  0.226959 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  43.67 
 
 
389 aa  325  9e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3928  amidohydrolase  46.42 
 
 
395 aa  325  1e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.530582  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1193  peptidase M20D, amidohydrolase  46.17 
 
 
388 aa  323  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.95754  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  44.03 
 
 
389 aa  323  3e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1288  amidohydrolase  43.46 
 
 
388 aa  323  4e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0866095  normal  0.389955 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5220  amidohydrolase  45.87 
 
 
393 aa  323  4e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2573  amidohydrolase  43.64 
 
 
387 aa  322  6e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0165265  normal  0.498174 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  43.69 
 
 
387 aa  322  7e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4012  amidohydrolase  44.55 
 
 
392 aa  321  9.999999999999999e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.873821 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1298  peptidase M20D, amidohydrolase  44.42 
 
 
394 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2932  peptidase M20D, amidohydrolase  44.44 
 
 
382 aa  321  1.9999999999999998e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.886758  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5405  amidohydrolase  44.07 
 
 
396 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>