More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7452 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7452  peptidase M20D, amidohydrolase  100 
 
 
416 aa  843    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4387  peptidase M20D, amidohydrolase  49.48 
 
 
406 aa  371  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.68228 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  51.06 
 
 
388 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  49.87 
 
 
388 aa  354  2e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5260  putative amidohydrolase family protein  48.27 
 
 
387 aa  352  8e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0497165  normal  0.313624 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  47.01 
 
 
397 aa  344  2e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  45.57 
 
 
396 aa  342  5.999999999999999e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  45.57 
 
 
396 aa  342  9e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4586  putative amidohydrolase family protein  47.53 
 
 
389 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  46.11 
 
 
423 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  46.11 
 
 
398 aa  336  5e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1729  peptidase M20D, amidohydrolase  48.55 
 
 
390 aa  335  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0022862 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  48.11 
 
 
388 aa  334  1e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  45.05 
 
 
396 aa  333  4e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  43.49 
 
 
396 aa  331  1e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  44.18 
 
 
397 aa  330  3e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  44.53 
 
 
397 aa  330  3e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0984  peptidase M20D, amidohydrolase  47.51 
 
 
397 aa  329  6e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  47.09 
 
 
394 aa  325  6e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1298  peptidase M20D, amidohydrolase  47.35 
 
 
394 aa  325  9e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2037  M20/M25/M40 family peptidase  45.33 
 
 
387 aa  324  2e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.403946  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  47.09 
 
 
394 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1734  peptidase M20D, amidohydrolase  46.83 
 
 
389 aa  323  2e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.0172136 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  47.09 
 
 
394 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  47.09 
 
 
394 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  44.12 
 
 
387 aa  323  5e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  45.79 
 
 
403 aa  322  6e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4834  amidohydrolase  49.33 
 
 
385 aa  322  6e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0546494  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1248  amidohydrolase  45.93 
 
 
425 aa  322  7e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.144528  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0665  amidohydrolase  47.96 
 
 
408 aa  322  8e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1959  M20/M25/M40 family peptidase  45.07 
 
 
387 aa  322  9.000000000000001e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0687  amidohydrolase  47.96 
 
 
408 aa  322  9.999999999999999e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.422759  normal  0.057643 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4433  amidohydrolase  46.56 
 
 
394 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  46.83 
 
 
396 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  46.83 
 
 
396 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  46.83 
 
 
396 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2573  amidohydrolase  45.33 
 
 
387 aa  321  1.9999999999999998e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0165265  normal  0.498174 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0935  amidohydrolase  46.59 
 
 
415 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  46.56 
 
 
394 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  46.83 
 
 
396 aa  320  3e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1245  hippurate hydolase  46.83 
 
 
396 aa  320  3e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689013  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1193  peptidase M20D, amidohydrolase  48.68 
 
 
388 aa  320  3e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.95754  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  44.77 
 
 
387 aa  320  3e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  46.83 
 
 
396 aa  320  3e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  46.83 
 
 
396 aa  320  3e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  46.3 
 
 
389 aa  320  3e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0901  amidohydrolase  44.8 
 
 
387 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  44.65 
 
 
387 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  44.35 
 
 
387 aa  319  5e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  43.6 
 
 
398 aa  319  6e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3565  peptidase M20D, amidohydrolase  46.17 
 
 
390 aa  319  6e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  44.35 
 
 
387 aa  319  6e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0444  amidohydrolase  44.76 
 
 
401 aa  319  7e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186163  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  47.35 
 
 
396 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  43.32 
 
 
387 aa  318  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  44.92 
 
 
387 aa  318  1e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  43.77 
 
 
390 aa  318  1e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2126  peptidase M20D, amidohydrolase  48.41 
 
 
390 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.587793  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  44.12 
 
 
387 aa  318  2e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0453  amidohydrolase  44.5 
 
 
401 aa  317  2e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  44.12 
 
 
387 aa  318  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4653  amidohydrolase  44.61 
 
 
415 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0295739  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5626  amidohydrolase  46.84 
 
 
399 aa  317  3e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.528848  normal  0.0552178 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3715  peptidase M20D, amidohydrolase  44.61 
 
 
415 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410848  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  47.21 
 
 
406 aa  317  3e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  44.09 
 
 
387 aa  316  4e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5651  amidohydrolase  46.97 
 
 
396 aa  316  5e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.146235 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2229  amidohydrolase  45.55 
 
 
395 aa  316  5e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  44.94 
 
 
388 aa  316  6e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3041  amidohydrolase  47.04 
 
 
402 aa  315  6e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0143655 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1090  amidohydrolase  47.54 
 
 
424 aa  315  7e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  43.85 
 
 
399 aa  315  7e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4914  putative hydrolase  47.61 
 
 
405 aa  315  8e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  44.47 
 
 
404 aa  315  8e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5843  amidohydrolase  46.98 
 
 
396 aa  315  9e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575611  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3187  amidohydrolase  48.01 
 
 
388 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0033512 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4317  amidohydrolase  49.07 
 
 
385 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0319433  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2260  putative amidohydrolase family protein  46.56 
 
 
390 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2671  peptidase M20D, amidohydrolase  45.17 
 
 
394 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00976662  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4686  amidohydrolase  49.07 
 
 
385 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.694379  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  43.6 
 
 
402 aa  313  3.9999999999999997e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2692  amidohydrolase  46.49 
 
 
388 aa  312  6.999999999999999e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2262  peptidase M20D, amidohydrolase  46.56 
 
 
389 aa  312  7.999999999999999e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.891111  normal  0.0931897 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  45.31 
 
 
399 aa  312  9e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2753  amidohydrolase  47.33 
 
 
391 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114457  normal  0.226959 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2611  amidohydrolase  47.06 
 
 
391 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  43.2 
 
 
387 aa  311  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4012  amidohydrolase  45.62 
 
 
392 aa  310  2e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.873821 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4367  amidohydrolase  47.15 
 
 
388 aa  310  2e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  43.14 
 
 
412 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  45.31 
 
 
397 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2919  amidohydrolase  46.22 
 
 
388 aa  310  4e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.068301  normal  0.124085 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4353  amidohydrolase  43.04 
 
 
399 aa  310  4e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.980853  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2549  amidohydrolase  47.12 
 
 
389 aa  310  4e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.475258  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0651  amidohydrolase  43.22 
 
 
447 aa  309  5.9999999999999995e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0326492  normal  0.115252 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3928  amidohydrolase  48.68 
 
 
395 aa  309  5.9999999999999995e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.530582  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2982  putative amidohydrolase family protein  44.44 
 
 
389 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3314  amidohydrolase  44.5 
 
 
390 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7215  hippurate hydrolase  45.99 
 
 
397 aa  306  3e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  45.38 
 
 
390 aa  306  3e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.857442 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>