More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2573 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2573  amidohydrolase  100 
 
 		 387 aa  786    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0165265  normal  0.498174 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  77.92 
 
 		 387 aa  625  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  77.4 
 
 		 387 aa  625  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2037  M20/M25/M40 family peptidase  65.89 
 
 		 387 aa  527  1e-148  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.403946  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0901  amidohydrolase  65.89 
 
 		 387 aa  526  1e-148  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1959  M20/M25/M40 family peptidase  65.37 
 
 		 387 aa  524  1e-147  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3056  amidohydrolase  70.03 
 
 		 387 aa  522  1e-147  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4062  amidohydrolase  67.36 
 
 		 387 aa  520  1e-146  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3872  hippurate hydrolase  65.37 
 
 		 387 aa  519  1e-146  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1729  peptidase M20D, amidohydrolase  62.24 
 
 		 390 aa  498  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0022862 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4250  amidohydrolase  62.92 
 
 		 390 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.456638  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1734  peptidase M20D, amidohydrolase  62.31 
 
 		 389 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.0172136 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3565  peptidase M20D, amidohydrolase  61.64 
 
 		 390 aa  490  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2982  putative amidohydrolase family protein  61.13 
 
 		 389 aa  488  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2671  peptidase M20D, amidohydrolase  60 
 
 		 394 aa  484  1e-135  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00976662  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2262  peptidase M20D, amidohydrolase  60.26 
 
 		 389 aa  479  1e-134  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.891111  normal  0.0931897 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  59.07 
 
 		 388 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4586  putative amidohydrolase family protein  60.05 
 
 		 389 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3187  amidohydrolase  61.34 
 
 		 388 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0033512 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2229  amidohydrolase  58.78 
 
 		 395 aa  456  1e-127  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2692  amidohydrolase  59.54 
 
 		 388 aa  455  1e-127  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2919  amidohydrolase  59.54 
 
 		 388 aa  455  1e-127  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.068301  normal  0.124085 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1288  amidohydrolase  60.57 
 
 		 388 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0866095  normal  0.389955 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0245  amidohydrolase  61.86 
 
 		 388 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.352854  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0719  peptidase M20D, amidohydrolase  58.72 
 
 		 387 aa  451  1e-125  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.093275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2815  amidohydrolase  59.54 
 
 		 390 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.575474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3289  peptidase M20D, amidohydrolase  58.46 
 
 		 387 aa  445  1.0000000000000001e-124  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.286044 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4367  amidohydrolase  56.88 
 
 		 388 aa  441  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2260  putative amidohydrolase family protein  58.1 
 
 		 390 aa  440  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5364  putative amidohydrolase family protein  58.61 
 
 		 390 aa  437  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00388806 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3584  amidohydrolase  57.51 
 
 		 390 aa  434  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0132191 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2910  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  54.45 
 
 		 388 aa  423  1e-117  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0718  peptidase M20D, amidohydrolase  53.47 
 
 		 390 aa  422  1e-117  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.178083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1555  amidohydrolase  54.45 
 
 		 388 aa  423  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0610  amidohydrolase  58.4 
 
 		 389 aa  421  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00962709  normal  0.632979 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3314  amidohydrolase  55.81 
 
 		 390 aa  417  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0937  peptidase M20D, amidohydrolase  53.4 
 
 		 387 aa  418  9.999999999999999e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.47047  normal  0.0807888 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  52.14 
 
 		 396 aa  414  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  50.38 
 
 		 396 aa  414  1e-114  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  51.89 
 
 		 396 aa  413  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  51.94 
 
 		 396 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  51.64 
 
 		 397 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  52.41 
 
 		 397 aa  401  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  55.32 
 
 		 379 aa  401  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3086  peptidase M20D, amidohydrolase  54.92 
 
 		 389 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.985379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2343  peptidase M20D, amidohydrolase  52.62 
 
 		 386 aa  398  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0732987  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1161  amidohydrolase  52.36 
 
 		 386 aa  395  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1110  amidohydrolase  54.45 
 
 		 388 aa  398  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.247548  normal  0.0143187 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  52.89 
 
 		 398 aa  393  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  51.13 
 
 		 404 aa  391  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  49.5 
 
 		 397 aa  387  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  52.23 
 
 		 387 aa  378  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  50.26 
 
 		 398 aa  379  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  49.87 
 
 		 423 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  50.93 
 
 		 388 aa  378  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  50 
 
 		 397 aa  371  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  50.4 
 
 		 397 aa  374  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  51.18 
 
 		 387 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  50.92 
 
 		 387 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  49.35 
 
 		 403 aa  368  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0444  amidohydrolase  48.87 
 
 		 401 aa  370  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186163  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0453  amidohydrolase  48.62 
 
 		 401 aa  369  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  50.39 
 
 		 387 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  50.66 
 
 		 387 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  50.39 
 
 		 387 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  49.74 
 
 		 402 aa  368  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  50.8 
 
 		 395 aa  367  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2533  peptidase M20D, amidohydrolase  46.73 
 
 		 397 aa  368  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030908 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  50.93 
 
 		 399 aa  363  3e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0333  amidohydrolase  51.19 
 
 		 401 aa  363  4e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  49.61 
 
 		 387 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2611  amidohydrolase  50.79 
 
 		 391 aa  362  9e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4896  amidohydrolase  51.47 
 
 		 396 aa  361  9e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.873901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  48.06 
 
 		 388 aa  361  1e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  49.34 
 
 		 387 aa  361  1e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  48.45 
 
 		 389 aa  360  2e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  48.58 
 
 		 388 aa  360  2e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1248  amidohydrolase  48.23 
 
 		 425 aa  359  4e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.144528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  48.95 
 
 		 412 aa  359  4e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5374  amidohydrolase  50.93 
 
 		 399 aa  359  6e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  48.95 
 
 		 406 aa  359  6e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2992  peptidase M20D, amidohydrolase  50.93 
 
 		 399 aa  359  6e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0252  peptidase M20D, amidohydrolase  50.67 
 
 		 396 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0687  amidohydrolase  49.87 
 
 		 408 aa  358  9.999999999999999e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.422759  normal  0.057643 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  49.08 
 
 		 387 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0665  amidohydrolase  49.87 
 
 		 408 aa  358  9.999999999999999e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  48.43 
 
 		 390 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  50.4 
 
 		 389 aa  356  2.9999999999999997e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0935  amidohydrolase  48.29 
 
 		 415 aa  356  3.9999999999999996e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0651  amidohydrolase  45.89 
 
 		 447 aa  355  5e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0326492  normal  0.115252 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5250  amidohydrolase  50.93 
 
 		 396 aa  355  5e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2753  amidohydrolase  50.13 
 
 		 391 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114457  normal  0.226959 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4721  amidohydrolase  50.93 
 
 		 396 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1132  amidohydrolase  50 
 
 		 402 aa  354  1e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  47.44 
 
 		 396 aa  354  1e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1813  peptidase M20D, amidohydrolase  48.83 
 
 		 388 aa  353  2e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.301487  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  47.2 
 
 		 403 aa  353  2e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2549  amidohydrolase  49.48 
 
 		 389 aa  353  4e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.475258  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1090  amidohydrolase  48.16 
 
 		 424 aa  352  7e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6019  amidohydrolase  50.26 
 
 		 389 aa  352  8e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>